英国混合基因型丙型肝炎病毒（HCV）感染的发病率在很大程度上是未知的。由于直接作用抗病毒药物的疗效在不同基因型之间是可变的，所以治疗方案针对感染的基因型而定制，这可能对未确诊的混合基因型HCV感染中潜在基因型的治疗构成问题。因此需要在治疗前准确诊断混合基因型感染。以PCR为基础的诊断工具，筛选出英国基因型1a和3引起的混合基因型感染的发生率，这些基因型在506名诊断有这些基因型的个体的队列中。总体感染率为3.8％; 然而，这一比率分布不均。混合感染样本由主要和次要基因型组成，其中后者占总病毒载量的不到21％，并且在67％的病例中少于1％的病毒载量。通过下一代测序Illumina PCR的队列子集比通过PCR获得的发病率高得多，这可能是由于该技术的非定量性质以及基于阴性对照指定假阳性阈值而发生的。
