《Nat Com | 甲酰肽受体结构为阿尔茨海默症药物研发带来新机遇》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2022-04-01
  • 甲酰肽受体(Formyl peptide receptor, FPR)属于G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor, GPCR)超家族,这类受体在免疫反应初期识别来自病原体或受损组织的危险信号(如:细菌或线粒体释放的甲酰肽等),使中性粒细胞发生迁移和浸润。人体内包含三种FPR(FPR1-3)。其中,FPR1和FPR2与炎症、多发性硬化症及神经退行性疾病等密切相关。阿尔兹海默症(Alzheimer’s disease, AD)的主要病理特征之一是位于大脑皮层和海马区神经元外的老年斑(senile plaques, SP),老年斑主要由b淀粉样蛋-42(Aβ42)构成,以往研究发现Aβ42可通过与 FPR2结合介导其细胞毒性。此外,FPR2还可作为神经保护肽humanin的受体,这种神经保护肽可避免神经细胞遭受Aβ42的损伤。这些研究表明,FPR2在AD的发生发展中发挥重要作用,但相关分子机制一直不清楚。

      近日,中国科学院上海药物研究所吴蓓丽研究组和赵强研究组在FPR结构研究中取得突破性进展,成功解析FPR2分别与Aβ42和甲酰化humanin结合的两个复合物电镜结构,并利用功能实验对配体结合模式和受体功能调控机制进行研究,首次在原子水平阐明FPR2介导Aβ42神经损伤和humanin神经保护的分子机理。此外,研究团队还测定了FPR1和FPR2分别与不同甲酰肽结合的复合物电镜结构,揭示了这两种FPR的配体选择性机制。这些研究为深入理解FPR在AD和其它炎症疾病中发挥的重要作用提供了重要依据,将有助于相关疾病的药物开发。研究论文于北京时间2022年4月1日以“Structural basis of FPR2 in recognition of Aβ42 and neuroprotection by humanin”为题发表于国际知名学术期刊Nature Communications。

      FPR2与Aβ42的复合物结构显示,Aβ42的N端区域在与FPR2的结合中发挥主要作用,其头部伸入到FPR2跨膜结构域的结合口袋中,与跨膜螺旋形成极性作用;尾部通过疏水作用与受体的胞外侧区域结合。Aβ42的C末端则主要通过稳定N端区域的构象,协助其与受体结合。进一步的功能研究结果发现,FPR2与Aβ42作用界面上的关键氨基酸突变后,受体被Aβ42激活的能力显著下降,这说明FPR2与Aβ42的正确识别对于受体功能至关重要。Aβ42在体内以多种构象状态存在,上述研究结果表明,只有当Aβ42具有某一种特定构象时才能激活FPR2,从而引发炎症反应和神经毒性,这为阐明FPR2在AD病程中发挥病理功能的分子机制提供了结构基础。

      神经保护肽humanin可保护神经细胞免受Aβ42诱导的神经凋亡。此次,研究人员发现,humanin与Aβ42在FPR2中的结合位点大部分重合,但humanin与受体形成的作用力更强,这使其可通过占据结合位点有效地阻断Aβ42与受体的结合,从而抑制炎症反应和细胞内Aβ42的纤维化聚集。这为阐释humanin发挥神经保护作用的分子机制提供了重要依据。

      FPR1与FPR2通过与细菌或线粒体来源的甲酰肽结合,在宿主防御和炎症反应中发挥重要作用,但这两种FPR对甲酰肽的识别具有极强的特异性。FPR1选择性地识别分子量较小的短链甲酰肽,而FPR2倾向于结合分子量较大的长链甲酰肽。比较FPR1和FPR2与不同甲酰肽的复合物结构,发现两种受体的配体结合口袋内的电荷差异以及受体胞外区域的开放程度决定了配体的选择性。与FPR1相比,FPR2胞外区域的开口更大,为其结合分子量较大的多肽及蛋白质配体提供了充足的空间,使FPR2成为迄今为止发现的配体最为多样化的GPCR。

      这项研究系统地揭示了甲酰肽受体对多种不同类型配体的特异性识别机制,阐明了FPR在炎症和神经退行性疾病中的调控机制,将助力新型疾病治疗策略的开发。

      研究论文的第一作者包括上海药物所助理研究员朱亚、硕士研究生宗鑫、副研究员韩硕和中国科学院大学杭州高等研究院博士研究生林晓文。研究工作获得国家自然科学基金委员会、国家科技部、中国科学院和上海市科学技术委员会等部门的经费支持。

      全文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-022-29361-x

  • 原文来源:http://www.simm.ac.cn/web/xwzx/kydt/202204/t20220401_6418117.html
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    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-03-05
    • 甲酰肽是一类在氨基末端(N末端)具有甲酰化甲硫氨酸的多肽分子,是一种普遍存在的病原相关分子模式(PAMP)或损伤相关分子模式(DAMP)。甲酰肽受体 (FPRs)家族作为一类模式识别相关G蛋白偶联受体 (GPCR),能够特异性识别来源于入侵病原体或宿主受损线粒体中的甲酰肽,在人体固有免疫中扮演重要角色。FPRs由三个成员组成,包括FPR1、FPR2(也称为FPRL1)和FPR3,这些受体主要分布于中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞等免疫细胞中,被甲酰肽激活后,一方面诱导中性粒细胞、肥大细胞等激活,释放炎症细胞因子,促使炎症发生;同时,作为趋化物招募巨噬细胞等快速富集,引起活性氧的产生消灭病原微生物,并对病原体以及受损组织进行吞噬清除,在免疫防御和调节过程起重要作用。FPRs与趋化因子受体、过敏毒素受体(C5aR1),类二十烷脂质分子白三烯B4和前列腺素D2(BLT和CRTH2)受体一起构成Gi偶联的趋化因子受体家族,分属于A类GPCR的γ分支,主要通过偶联G蛋白家族中的Gi/o异源三聚体介导信号传递。   FPR1和FPR2在氨基酸序列上高度相似,然而,两者显示出不同的甲酰肽偏好性。FPR1倾向于高亲和力结合短甲酰肽,例如典型的甲酰肽fMLF (N-formyl-Met-Leu-Phe),而FPR2偏向结合较长的肽或具有特定序列的肽,例如酚溶性调节蛋白α(PSMα),一种金黄色葡萄球菌产生的甲酰肽毒素。大量研究发现,FPR1和FPR2,尤其是FPR2,表现出明显的配体杂乱性,除了能够模式化识别广泛来源的甲酰化多肽配体外,还可以识别一系列结构和功能不一样的非甲酰化蛋白或脂质配体,包括血清淀粉样蛋白A (SAA)、HIV病毒来源多肽、鼠疫病原体耶尔森氏菌的致病毒素、β淀粉样蛋白以及脂质配体LXA4和Resolving D1等,表现出促进炎症或抗炎效应。开发偏向性激活FPR2消炎信号通路的激动剂药物是目前靶向哮喘、阿尔兹海默症以及心脑血管疾病等药物研究领域的热点和前沿。   前期,上海药物所徐华强课题组通过冷冻电镜技术解析并报道了首个甲酰肽受体FPR2结合多肽配体WKYMVm的近原子分辨率结构,结合多种实验方法揭示了FPR2的配体正性结合口袋特性以及配体识别多样性的可能结构因素(庞大的配体结合口袋以及构象活跃的胞外结构域),阐释了FPRs受体家族识别甲酰肽的潜在的保守识别模式。为进一步确证FPRs识别甲酰肽的保守机制以及配体结合多样性分子机制,科研团队与美国匹兹堡大学张诚课题组合作,解析了甲酰肽fMLFII激活下FPR1-Gi和FPR2-Gi信号复合物,以及抗炎多肽CGEN-855A和化合物Compound 43结合FPR2-Gi复合物的冷冻电镜结构(2.9埃 - 3.2埃),并结合细胞水平功能分析揭示了甲酰肽识别并激活FPRs的保守模式,阐述了FPR1和FPR2结合不同长度甲酰肽的选择性决定因素等,为深入了解甲酰肽受体家族的配体识别和激活机理以及靶向FPRs理性药物设计提供了重要的结构基础和理论依据。研究论文“Molecular recognition of formylpeptides and diverse agonists by the formylpeptide receptors FPR1 and FPR2”于2月25日在线发表于国际知名期刊Nature communications。 研究发现,甲酰肽fMLFII以N端朝口袋内部的方式结合到FPR1和FPR2上,与科研人员前期用计算机模拟得出的结论一致。结构比对发现,fMLFII在FPR1和FPR2中的结合模式高度相似,其N末端的甲酰基与FPR1/FPR2配体结合口袋内部保守的氨基酸残基D3.33, R5.38 和R5.42形成极性相互作用网络,这三个保守的氨基酸充当“钳子”的作用,将甲硫氨酸侧链以正确的构象定位到口袋底部由保守氨基酸W6.48 、P5.50、F6.44以及V3.40形成的狭窄的激活腔中,引起腔内氨基酸构象变化,进而激活FPRs,这表明FPR1/FPR2通过保守的模式识别甲酰肽。值得注意的是,保守激活腔内的氨基酸W6.48 、P5.50、F6.44以及V3.40是Class A 类GPCRs激活的关键基序。通过比较WKYMVm, 甲酰肽fMLFII, CGEN-885A以及Compound 43四种不同配体结合的FPR2结构发现,虽然这些配体在FPR2正性结合口袋的结合模式各异,但是三种多肽配体的C端/N端甲硫氨酸侧链以及Compound 43的氯苯基在保守激活腔中构象高度重合,并且均与保守氨基酸D3.33, R5.38 和R5.42形成极性相互作用网络,表明不同FPRs配体与甲酰肽配体共享上述相似的受体激活分子机制。  FPR1和FPR2对不同的甲酰肽具有结合的偏好性,研究结果表明,FPR1上的非保守氨基酸Y2576.51和F1023.29与甲酰肽形成更多的相互作用,相比于FPR2,FPR1的近胞外端结构更为狭窄,在空间上限制了长链甲酰肽与其结合,这些因素共同决定了FPR1偏好性识别短链甲酰肽而FPR2倾向于结合长链甲酰肽。   上海药物所副研究员庄友文、美国匹兹堡大学博士后Lei Wang为该论文的共同第一作者,上海药物所为第一单位。徐华强研究员、张诚教授为共同通讯作者。参加这项研究的还有上海药物所研究生郭嘉、王悦和刘卫一,以及匹兹堡大学博士后孙大鹏,其中,郭嘉在冷冻电镜样品制备和数据处理过程中做出了重要的贡献。此项工作得到了美国国立卫生研究院、科技部重点研发计划项目、中国科学院先导计划、上海市科技重大专项以及中国科学院特别研究助理项目经费支持。   文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-022-28586-0#Sec17   关联文章:https://www.nature.com/articles/s41467-020-14728-9
  • 《Alzhe & Demen |上海药物所合作揭示抑制多巴胺转运体促进溶酶体生成并改善小鼠阿尔茨海默病样症状的机制》

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    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2023-04-17
    •   溶酶体是细胞内负责物质降解的重要细胞器,其内部含有蛋白酶、酯酶等多种水解酶,可降解多种大分子物质,包括蛋白质和脂类等。溶酶体功能紊乱导致胞内物质不能被正常降解进而诱发多种重大疾病如神经退行性疾病等。阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种典型的神经退行性疾病,其主要病理特征是脑部毒性蛋白Aβ的累积,进而导致神经元死亡和认知记忆等功能受损。因此,促进溶酶体生成,增强其降解Aβ淀粉样蛋白的功能,对改善AD具有重要意义。   中国科学院上海药物研究所柳红和周宇团队联合复旦大学基础医学院药理学系李洋团队,合作揭示了一种溶酶体生成的调控新机制,阐明了多巴胺转运体在调控蛋白质量控制过程中的新作用,并发现了可改善AD症状的新型小分子化合物 LH2-051,为临床抗AD候选药物的研发提供了良好的理论基础和治疗新机制,即DAT-CDK9-TFEB信号通路。近日,相关成果“Inhibition of the dopamine transporter promotes lysosome biogenesis and ameliorates Alzheimer's disease-like symptoms in mice”以Featured Article正式发表于阿尔茨海默病研究领域顶尖期刊Alzheimer's & Dementia上,并应邀撰写评论性文章发表于自噬领域高水平期刊Autophagy上。  研究团队发现以LH2-051为代表的一类结构新颖的小分子化合物可以通过抑制多巴胺转运体(Dopamine transporter, DAT)的功能来促进转录因子EB (TFEB)的活化,进而促进溶酶体的生成。小分子化合物LH2-051结合DAT后,诱导DAT从细胞膜转位至溶酶体膜上,随后溶酶体膜上的DAT调控周期蛋白依赖性激酶9 (Cyclin-Dependent Kinase 9, CDK9)在溶酶体膜上的定位并导致CDK9从溶酶体释放下来而失去磷酸化TFEB的能力,进而激活TFEB进入细胞核,促进溶酶体生成相关的基因表达,最终促进溶酶体生成。APP/PS1转基因AD小鼠模型显示LH2-051处理后能显著促进小鼠大脑海马和皮层中溶酶体的生成及Aβ降解,并可以显著改善小鼠行为学表现。该项工作揭示了全新的溶酶体调控机制,为AD药物研发提供了一条崭新的研究策略。   上海药物所-南京中医药大学联合培养博士研究生周建辉和复旦大学基础医学院药理学系博士研究生尹利敏为该论文共同第一作者。上海药物所柳红研究员、周宇研究员和复旦大学基础医学院药理学系李洋青年研究员为该论文的共同通讯作者。该研究获得了国家自然科学基金、科技部脑科学与类脑研究重大专项等项目的资助。   全文链接:   https://alz-journals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/alz.12776   https://doi.org/10.1080/15548627.2022.2131247