预测HCV感染患者抗病毒治疗有效性的工具对选择最佳的治疗策略十分重要。研究者运用系统生物学方法发现18个在血液中表达的基因预示PEG干扰素和三唑核苷治疗中止后HCV RNA再次出现。由于这些预测基因数量很小且预测准确率高达94%,这组基因可作为临床决定中有用的生物标记。检测已成功治疗的慢性丙型肝炎感染患者血液转录概况后发现并不能恢复到正常健康人的状态。即使治疗引起HCV RNA消失后6个月,慢性HCV感染患者血液中的基因表达仍然是改变的,强有力地说明了在先前感染的患者中免疫参数的长期调节。