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《2020年第35期》

  • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者： hujm
  • 发布时间：2020-02-10

  • 1、《柳叶刀》评论：迫切需要为2019年新型冠状病毒暴发及时提供心理保健支持

    2、新生儿重症监护室2019-nCoV暴发应急预案 科学家尚未能准确预测新冠病毒的运动轨迹

    3、《柳叶刀》发文称快速隔离有症状患者可防止疫情在中国以外国家持续暴发

    4、WHO对关于新型冠状病毒暴发已被宣布为国际关注的突发公共卫生事件的应对措施

    5、Nature发文讨论穿山甲是否是2019-nCoV的可能来源

    6、科学家尚未能准确预测新冠病毒的运动轨迹

    7、武汉市138例2019-nCoV感染肺炎住院患者临床特征分析

    8、对2019年新型冠状病毒病死率估计需谨慎

    9、武汉大学中南医院关于常规血清学方法检测2019-nCoV的建议

    10、武汉大学中南医院等发布《诊断和治疗2019年新型冠状病毒感染的肺炎的快速建议指南（标准版）》

    11、韩国首例2019年新型冠状病毒性肺炎输入病例对感染预防和控制措施的启示

    12、两例2019年新型冠状病毒肺炎的CT表现

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相关报告

  • 《2020年第59期》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：xuwenwhlib
    • 发布时间：2020-03-05
    • “COVID-19科研动态监测每日快报” 提供最新科研论文线索、摘译科研论文主要内容，按病毒溯源、流行预测、病毒检测和疾病诊断、药物研发、机理研究、政策法规等领域整理国内外重要机构的研究成果，为我国的科研攻关和相关科学研究提供参考。 页面底部可下载快报PDF文件 主要目录 其他 1 3月4日_Nature报道新型冠状病毒疫情及药物研发等进展 1 3月3日_WHO发文称世界范围内卫生工作者的个人防护设备短缺，并呼吁各国政府增加产量 2 3月3日_致命的冠状病毒：2003年的SARS大流行和2020年的新型冠状病毒流行 3 风险估计 4 3月3日_北京协和医院关于癌症患者感染COVID-19的风险的观点 4 3月3日_浙江大学医学院附属第二医院关于癌症患者感染COVID-19的风险的观点 6 3月3日_大规模传染性和感染性疾病的经济影响:以武汉新型冠状病毒为例 7 病患治疗 8 3月3日_瑞士洛桑大学附属医院等关于疑似SARS-CoV-2感染的孕妇的医疗服务提供者指南 8 临床资料 9 3月3日_新加坡SARS-CoV-2感染患者的流行病学特征和临床进程 9 3月3日_武汉市及武汉市外地区冠状病毒病(COVID-19)患者流行病学及临床特征比较 10 3月3日_武汉地区2019年冠状病毒感染(COVID-19)患者死亡结果的临床特点及危险因素分析 11 3月3日_COVID-19的传播中女性表现出不同于男性的特征 12 3月3日_中国江苏省COVID-19重症患者的早期及危重护理:一项描述性研究 13 3月3日_中国武汉地区因SARS-CoV-2感染死亡患者的临床特征 14 3月3日_青岛市妇女儿童医院等机构研究团队指出需要采取措施预防COVID-19患者并发常见呼吸道病原体感染 15 3月3日_北京地区有肺炎和无肺炎症状的COVID-19患者的流行病学和临床特征分析 16 3月3日_胰腺中ACE2表达高可能导致SARS-CoV-2感染后的胰腺损伤 17 3月3日_首都医科大学附属北京佑安医院等机构的研究团队认为血浆C反应蛋白水平与COVID-19患者的肝损伤密切相关 18 2月29日_SARS-CoV-2引起的无症状状态、急性呼吸道疾病和肺炎 19 心理保健 20 3月3日_缓解COVID-19暴发期间居家隔离对儿童的影响 20 3月3日_普通民众，参与COVID-19控制的医疗队成员和非医疗队成员的替代性创伤 22 专家观点 23 3月3日_中国面临的是否仅仅是SARS-CoV-2的前兆波 23 药物研发 24 3月3日_通过虚拟筛选6.87亿种化合物鉴定新型冠状病毒蛋白酶抑制剂 24 机理研究 25 3月3日_非结构蛋白NS7b和NS8可能与2019-nCoV的进化及系统发育相关 25 3月3日_2019-nCoV与抗体依赖增强的疫苗风险的医学对策分析 26 3月3日_SARS-CoV-2中Nsp15核糖核酸内切酶(NendoU)的晶体结构 27 流行预测 28 3月4日_中国深圳COVID-19的流行病学和传播：391例病例和1286位密切接触者的分析 28 3月4日_基于个人和政府行为建立的COVID-19疫情概念模型 28 3月3日_封闭环境有利于2019新型冠状病毒（COVID-19）的二次传播 29 3月3日_福建师范大学等预测中国COVID-19累计死亡人数 30 3月3日_中国COVID-19流行的病死率的估算 31 3月3日_南京大学分析中国2019年新型冠状病毒病的流行病学趋势 32 3月3日_COVID-19流行病的分形动力学 33 3月3日_对新加坡2020年2月COVID-19传播潜势的实时监测 33 3月3日_利用Kermack-McKendrick模型描述COVID-19流行病的参数关系 34 3月3日_中国COVID-19的流行预测模型及软件评估干预措施 35 3月3日_全球视野下2019新型冠状病毒（COVID-19）疫情动态风险和国际传播的时空估计 35 3月3日_一个评估中国大陆COVID-19疫情期间武汉封城效应和地方努力的简单模型 36 病毒检测 38 3月3日_反转录RT-LAMP法可快速检测SARS-CoV-2 38 疾病诊断 38 3月3日_2019年新型冠状病毒病患者对SARS-CoV-2的抗体反应 38 3月3日_IgM和IgG检测对COVID-19高度疑似感染者诊断的临床意义 39 3月3日_基于机器学习预测SARS-CoV-2感染性肺炎患者住院时间的CT放射学模型：一项多中心研究 40
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  • 《2020年第105期》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：xuwenwhlib
    • 发布时间：2020-04-21
    • “‘COVID-19’科研动态监测每日快报”由中国科学院武汉文献情报中心和中国科学院文献情报中心合作推出。该项服务旨在通过提供最新科研论文线索、摘译科研论文主要内容，为我国的科研攻关和相关科学研究提供参考。 页面底部可下载快报PDF文件 主要目录 机理研究 1 4月17日_非人类灵长类动物模型中COVID-19、MERS和SARS的发病机理的比较研究 1 4 月19日_SARS-CoV-2突变对其致病性的影响 1 4月18日_广州医科大学等团队研究发现弗林蛋白酶和ACE2在口腔上皮细胞中的显著表达可能有助于2019-nCoV进入宿主细胞 2 4月9日_港大袁国勇教授团队率先比较SARS-CoV-2和SARS-CoV在离体人类肺组织中的复制和免疫激活特征 3 疾病诊断 4 4月19日_通过简单血液检查来识别COVID-19的新型特异的基于人工智能的方法 4 其他 5 4月19日_阿卜杜拉国王科技大学发文称没有证据表明COVID-19疫情具有温度依赖性 5 4月18日_一种可快速部署到会产生气溶胶的医疗操作中的负压式防护罩 5 机理研究 4月17日_非人类灵长类动物模型中COVID-19、MERS和SARS的发病机理的比较研究 1.时间：2020年4月17日 2.机构或团队：鹿特丹伊拉斯姆斯大学医学中心、荷兰Viroclinics Xplore公司、荷兰灵长类生物医学研究中心、荷兰乌得勒支大学、德国夏里特大学医院 3.事件概要： 鹿特丹伊拉斯姆斯大学医学中心等机构的科研人员在Science期刊发表题为“Comparative pathogenesis of COVID-19, MERS, and SARS in a nonhuman primate model”的文章。 文章指出，为了将COVID-19的发病机制与以前出现的冠状病毒进行比较，研究人员给猕猴接种了SARS-CoV-2或MERS-CoV，并将其病理学和病毒学与SARS-CoV感染的历史报道进行了比较。在感染了SARS-CoV-2的猕猴中，病毒在没有临床体征的情况下从鼻和喉中排出，并在弥漫性肺泡损伤病灶的I型和II型肺细胞，以及鼻、支气管和细支气管粘膜的纤毛上皮细胞中检测到病毒。在SARS-CoV感染中，肺部病变通常更为严重，而在MERS-CoV感染中则较轻，其中主要在II型肺细胞中检测到病毒。这些数据表明，SARS-CoV-2会在猕猴中引起类似COVID-19的疾病，并为验证防治策略提供了新的模型。 4.附件： 原文链接：https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/16/science.abb7314 4 月19日_SARS-CoV-2突变对其致病性的影响 1.时间：2020年4月19日 2.机构或团队：浙江大学 3.事件概要： 浙江大学在medRxiv预印本平台发表论文“Patient-derived mutations impact pathogenicity of SARS-CoV-2”。文章旨在研究不同患者体内病毒的突变对其致病性的影响。 基因测序数据显示SARS-CoV-2存在大量的单核苷酸突变（SNVs），文章对来自11例患者体内SARS-CoV-2病毒的功能特征进行表征，发现不同的病毒分离株具有不同的突变，包括S蛋白中6个不同的突变，其中两个不同的SNVs导致相同的错义突变。当这些病毒株感染Vero-E6细胞时，不同的突变株具有不一样的细胞病变作用和病毒负载能力（差别高达270倍）。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接：https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.14.20060160v1 4月18日_广州医科大学等团队研究发现弗林蛋白酶和ACE2在口腔上皮细胞中的显著表达可能有助于2019-nCoV进入宿主细胞 1.时间：2020年4月18日 2.机构或团队：广州医科大学、广东省实验动物监测所、暨南大学口腔医学院、马来西亚莫纳什大学、广东药科大学 3.事件概要： 4月18日，bioRxiv预印平台发布了题为“Significant expression of FURIN and ACE2 on oral epithelial cells may facilitate the efficiency of 2019-nCov entry”的文章。 文章指出，弗林蛋白酶（FURIN）活性对于2019-nCoV的人畜共患传播至关重要，且有相关报道称ACE2可能是2019-nCoV的受体。此外，FURIN和ACE2受体在作为病毒潜在靶器官的呼吸道上皮、心脏组织和肠道中均有表达。然而，关于FURIN和ACE2在口腔组织中表达的研究报道较少。 文章利用公开的单细胞序列数据分析了ACE2和FURIN在新冠病毒进入口腔粘膜宿主细胞中的表达，探讨了新冠病毒在口腔中的潜在感染途径。采用免疫组化（IHC）染色来证实ACE2和FURIN在蛋白水平上的表达。结果表明，生物信息学分析显示ACE2和FURIN在不同口腔黏膜组织上皮细胞中的表达存在差异，FURIN阳性细胞比例明显高于ACE2阳性细胞。IHC实验表明，靶组织中ACE2阳性和FURIN阳性细胞主要位于上皮层，部分表达于成纤维细胞，进一步证实了生物信息学的结果。 文章结论：根据上述结果，文章推测2019-nCoV可能通过与ACE2受体结合和与FURIN蛋白酶激活的细胞膜融合两种途径有效入侵口腔粘膜细胞。结果表明，口腔黏膜组织对2019-nCoV敏感，为临床和日常生活中的病毒预防策略提供了有价值的信息。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.18.047951v1 4月9日_港大袁国勇教授团队率先比较SARS-CoV-2和SARS-CoV在离体人类肺组织中的复制和免疫激活特征 1.时间：2020年4月9日 2.机构或团队：香港大学李嘉诚医学院、香港大学附属玛丽医院、香港大学深圳医院、海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室 3.事件概要： Clinical Infectious Diseases于4月9日出版了香港大学袁国勇教授等研究团队的论文“Comparative replication and immune activation profiles of SARS-CoV-2 and SARS-CoV in human lungs: an ex vivo study with implications for the pathogenesis of COVID-19”[1]，全面研究了SARS-CoV-2感染在人肺组织中的复制、细胞嗜性和免疫激活特征，并以SARS-CoV作为比较。该研究提供了第一份在离体人类肺组织中比较SARS-CoV-2和SARS-CoV感染的复制能力和免疫激活特征的定量数据。结果发现，与SARS-CoV相比，SARS-CoV-2在人肺组织中的感染和复制效率更高。在48小时间隔内，SARS-CoV-2从受感染的肺组织中产生的感染性病毒颗粒比SARS-CoV感染产生的病毒颗粒多3.20倍（P <0.024）。SARS-CoV-2和SARS-CoV在细胞嗜性方面相似，均靶向I型和II型肺细胞和肺泡巨噬细胞。重要的是，尽管SARS-CoV-2病毒复制效率更高，但其并未在感染的人肺组织中显著诱导I，II或III型干扰素。此外，SARS-CoV感染上调了13种代表性促炎细胞因子/趋化因子中的11种（84.62％）的表达，而SARS-CoV-2感染仅上调了这13种关键炎症介质中的5种（38.46％），尽管其复制效率更高。 袁教授领导团队先前于3月26日在Clinical Infectious Diseases杂志出版了另一篇论文“Simulation of the clinical and pathological manifestations of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) in golden Syrian hamster model: implications for disease pathogenesis and transmissibility”[2]，建立了一种新颖的，易于获得的生理性叙利亚仓鼠小动物模型进行SARS-CoV-2感染用于探究临床、病毒学、组织病理学和免疫学特征，以研究COVID-19的致病性、传播和被动免疫效果。 4.附件： [1]https://academic.oup.com/cid/article/doi/10.1093/cid/ciaa410/5818134?searchresult=1# [2]https://academic.oup.com/cid/article/doi/10.1093/cid/ciaa325/5811871?searchresult=1 疾病诊断 4月19日_通过简单血液检查来识别COVID-19的新型特异的基于人工智能的方法 1.时间：2020年4月19日 2.机构或团队：英国谢菲尔德大学等 3.事件概要： 英国谢菲尔德大学等机构在medRxiv预印本平台发表论文“A novel specific artificial intelligence-based method to identify COVID-19 cases using simple blood exams”，更新了其开发的COVID-19筛查方法的数据。 文章开发了一种机器学习分类策略，旨在通过大批量的简单血液检测样本进行初筛，快速判定可能为阳性的样本。随后，阳性样本可进行进一步的高灵敏性测试（CT、特异性抗体检测）。该AI模型平均特异性为85.98% [95%CI: 84.94 -86.84]，阴性预测值（NPV）为94.92% [95%CI: 94.37% -95.37%]。在灵敏性方面，该模型平均达到70.25% [95%CI: 66.57% -73.12%]，阳性预测值（PPV）为44.96% [95%CI: 43.15% -46.87%]。受试者操作特征（ROC）的曲线下面积（AUC）为 86.78% [95%CI: 85.65%–87.90%]。文章指出，该模型能够较准确地预测急救室中的阴性和阳性病例，在病人分流中发挥重要作用。该人工智能模型名为ER-CoV，所有代码都可以在https://github.com/soares-f/ER-CoV上找到。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接：https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.10.20061036v2 其他 4月19日_阿卜杜拉国王科技大学发文称没有证据表明COVID-19疫情具有温度依赖性 1.时间：2020年4月19日 2.机构或团队：沙特阿卜杜拉国王科技大学 3.事件概要： 阿卜杜拉国王科技大学于2020年4月19日在medRxiv预印平台上发布了题为“No Evidence for Temperature-Dependence of the COVID-19 Epidemic”的文章。文章指出，COVID-19疫情从中国扩展到北温带，最近又扩展到热带地区和南半球。研究人员指出，没有证据表明温度超过20℃时其传播率会下降，这表明COVID-19不太可能是一种季节性呼吸道疾病。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接 https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.29.20046706v2 4月18日_一种可快速部署到会产生气溶胶的医疗操作中的负压式防护罩 1.时间：2020年4月18日 2.机构或团队：温哥华总医院、英属哥伦比亚大学 3.事件概要： 温哥华总医院和英属哥伦比亚大学的科研人员在medRxiv预印本平台发表题为“A Rapidly Deployable Negative Pressure Enclosure for Aerosol-Generating Medical Procedures”的文章。 文章指出，COVID-19大流行给医护人员带来了巨大的安全挑战。产生气溶胶的医疗操作（Aerosol-generating medical procedures, AGMPs）可能会增加医院内传播的风险，而目前全球个人防护设备（personal protective equipment, PPE）的短缺加剧了这种情况。因此，迫切需要改进的方法来降低AGMPs期间的风险。 研究方法：气溶胶防护罩（Aerosol Containment Enclosure, ACE）由丙烯酸树脂和用于设备端口密封的硅胶垫片构成，并用薄塑料片完成。医院的壁面抽吸在ACE内产生负压。为了评估防护能力，在静态条件下和模拟AGMPs期间记录了压差。还进行了烟流模式、荧光雾化和糖精钠雾化测试。 研究结果：使用带有两个壁面抽吸单元的外壳，获得了高达-47.7 毫米水柱的负压（O2流入量为15 L min-1，合并流出量为70 L min-1）。在模拟AGMPs期间，负压维持在-10至-35毫米水柱之间，包括通过面罩输送氧气、气道抽吸、袋式面罩人工通气和潜在COVID-19患者气管插管。在使用过程中，ACE有效地将烟雾、荧光素气溶胶和糖精钠气溶胶控制在外壳内。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接：https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.14.20063958v1
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