《Science | 多尺度光催化邻近标记揭示细胞表面和细胞之间的邻接关系》

  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2024-07-30
  • 2024年7月19日,加州大学旧金山分校的研究人员在Science发表题为Multiscale photocatalytic proximity labeling reveals cell surface neighbors on and between cells的文章。

    近距离标记蛋白质组学(PLP)策略是获得蛋白质邻域快照的有力方法。该研究介绍了一种分辨率可调的多尺度 PLP 方法,该方法使用了一种市售的光催化剂 Eosin Y,在可见光照射下可激活不同标记半径的光致发光物。

    研究人员将该平台用于分析致癌表皮生长因子受体的邻域,并利用免疫测定和 AlphaFold-Multimer 预测对 20 多个邻域进行了正交验证。研究人员进一步分析了由双特异性 T 细胞啮合因子和嵌合抗原受体 T 细胞诱导的细胞-细胞突触的蛋白质邻域。这个集成的多尺度 PLP 平台绘制了细胞表面和细胞表面之间的局部和远端蛋白质网络,这将有助于系统地构建细胞表面相互作用组,揭示水平信号传导伙伴,发现新的免疫治疗机会。

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    • 编译者:李康音
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    • 2024年2月28日,美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心的王凌华教授和Humam Kadara教授的合作团队在Nature在线发表了题为 An atlas of epithelial cell states and plasticity in lung adenocarcinoma的文章。 肺癌是全世界癌症死亡率最高的恶性肿瘤之一, 其中肺腺癌(Lung adenocarcinoma, LUAD)为最常见的组织学类型。虽然近年来早期检测手段的进步使得越来越多的肺腺癌患者能够得到早期诊断,但现有的治疗手段的预后效果仍不理想。另一方面,近年来针对肺癌,尤其是肺腺癌的前沿研究存在局限性,如样本数量有限,又如单细胞测序规模相对较小,导致可供分析的上皮细胞数量有限。这些现状突显了对早期肺腺癌进行系统性深入研究的紧迫性。深入理解早期肺腺癌发生发展背后的细胞机制对于寻找新的潜在治疗靶点和制定有效的早期干预策略至关重要。 该研究的主要成果是在早期肺腺癌组织和癌旁区域发现了一群携带KRAS致癌基因突变的,KRT8表达阳性的肺泡中间态细胞(KRT8+ alveolar intermediate cells,KACs)。通过和Jichao Chen教授合作,该团队在基因工程小鼠模型中对肺泡上皮细胞进行了谱系标记和追踪,并证实了KACs最终可转化为肺腺癌细胞。这项研究不仅为开发针对早期肺腺癌的检测和预防策略提供了新的启示,也为推动在最早阶段检测甚至阻断肺腺癌的发展开辟了新的研究方向,并且这项研究工作是迄今为止关于早期未经治疗干预的肺腺癌在上皮细胞规模和整合数据类型上最大和最全面的单细胞研究。
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