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《上海交大朱勃/陈功友团队在Plant Communications发文揭示水稻细菌性条斑病菌外膜囊泡sRNA抑制水稻气孔免疫的机制》

  • 来源专题：生物育种
  • 编译者： 季雪婧
  • 发布时间：2024-01-24

  •     2024年1月12日，上海交通大学农业与生物学院朱勃长聘副教授和陈功友长聘教授联合团队在Plant Communications在线发表了题为“Suppression of host plant defense by bacterial small RNAs packaged in outer membrane vesicles”的研究论文。该论文揭示了条斑病菌外膜囊泡（OMVs）的内容物small RNAs（sRNA）Xosr001抑制水稻气孔免疫从而增强其毒力的作用机制。

        在植物与病原菌之间复杂的“军备竞赛”中，病原菌通过分泌效应因子增强自身的毒力，除此之外，还可以通过分泌OMVs向宿主细胞运输和传递信号分子从而调节信号通路抑制宿主的先天免疫。OMVs是一种天然的纳米级颗粒，特异性地包裹核酸、蛋白质、脂质等分子，其中sRNAs作为重要的内容物能够特异且高效地参与细胞间的物质传递和信息交流，而在植物病原细菌OMVs中，sRNAs与宿主植物相互作用的机制仍不清楚。

  • 原文来源：http://www.ebiotrade.com/newsf/2024-1/20240117064331497.htm
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  • 《上海交大陈功友团队在Nature Communications发文揭示植物病原菌拮抗活性物吡唑三嗪的生物合成与调控机制》
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    • 编译者：姜丽华
    • 发布时间：2023-02-25
    • 植物在生长发育过程中受到各种病原菌的侵染危害，导致植物死亡和造成显著经济损失。农作物抗病育种和使用绿色农药是防控作物重大致灾病害的有效途径，而绿色农药可以来自植物生长环境中产生抗生素的生防微生物。2023年2月9日，Nature子刊Nature Communications在线发表上海交通大学农业与生物学院陈功友教授和生命科学技术学院林双君教授联合团队的“The natural pyrazolotriazine pseudoiodinine from Pseudomonas mosselii 923 inhibits plant bacterial and fungal pathogens”研究论文，揭示了摩氏假单胞菌923菌株产生天然抗生素吡唑三嗪pseudoiodinine的生物合成与调控机制。 水稻是我国和世界上的主要粮食作物之一，但由稻黄单胞菌（Xanthomonas oryzae）和稻瘟病菌（Magnaporthe oryzae）引起的水稻白叶枯病、条斑病和稻瘟病是水稻上的重要致灾病害。该研究工作科学假说认为，对这些致灾病害病原菌产生抗生素活性的生防微生物应当来自水稻田生态环境。经过大量筛选，从水稻根际土壤中分离获得了一株高效拮抗植物病原黄单胞菌和稻瘟病菌的摩式假单胞菌923菌株，鉴定其产生的拮抗物质为吡唑三嗪（pseudoiodinine），其由7个基因组成的psdABCDEFG操纵元决定生物合成；三磷酸鸟苷（guanosine triphosphate，GTP)是其生物合成的前体化合物，1,6-didesmethyltoxo?avin (1,6-DDMT)是其合成的中间体；GacA-rsmY/Z-CsrA1/2/3模块调控pseudoiodinine的生物合成。对GacA-rsmY/Z-CsrA1/2/3的CsrA1/2/3进行缺失，构建了高产pseudoiodinine的植物病害生防工程菌（图1）。 Pseudoiodinine是一种含多个氮原子的杂环分子，最早报道假单胞菌（P. fluorescens var. pseudoiodinum）可产生，但未见其遗传学、生物合成与调控机制的揭示。Pseudoiodinine具有吡唑[4,3-e][1,2,4]三嗪（Pyrazolo[4,3-e][1,2,4]triazine）特征核心骨架，该化合物及其衍生物如诺斯托辛A（Nostocine A）和氟维奥A（Fluviol A）还具有抗菌、抗病毒、抗肿瘤、延缓动脉粥样硬化等活性，具有成药潜力。 重要的是，本研究发现Pseudoiodinine对多种植物病原黄单胞菌均具有抑制作用，其中包括柑橘溃疡病菌（X. citri subsp. citri）、大豆斑疹病菌（X. axonopodis pv. glycines）、棉花角斑病菌（X. campestris pv. malvacearum）、麦类黄单胞菌（X. translucens pathovars）、辣椒斑点病菌（X. campestris pv. vesicatoria）等。对白叶枯病菌和条斑病菌的抑菌活性最强，MIC值分别为0.5 μg mL?1和4 μg mL?1，EC50值分别为0.17 μg mL?1和1.36 μg mL?1。对稻瘟病菌的EC50为4.48 μg mL?1。温室和田间防控试验显示，923菌株和pseudoiodinine在病害预防和治疗方面，均能对白叶枯病和条斑病进行有效防控，防病效果达70%以上（图2、图3）。 这些研究结果为利用摩氏假单胞菌923菌株生物防治作物细菌和真菌病害提供了一种新思路，并且吡唑三嗪（pseudoiodinine）作为一种新型绿色生物农药或先导化合物用于植物细菌和真菌病害的防控，或者未来动物肿瘤治疗药物研发，均具有潜在的重大应用价值。 上海交通大学农业与生物学院博士后杨瑞环和生命科学技术学院博士后石清为论文的共同第一作者，邹丽芳副教授和陈功友教授为论文的共同通讯作者。上海交通大学生命科学技术学院林双君教授和黄婷婷副研究员指导了该项研究，上海交通大学农业与生物长聘教轨副教授范江波博士参与了该项研究。该研究得到了国家重点研发计划（2022YFD1400200, 2017YFD0200400）、国家自然科学基金重点项目（31830072）和上海市科技兴农项目（2020‐02‐08‐00‐08‐F01462）的资助。 论文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-023-36433-z
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  • 《上海交大陈功友团队开辟水稻广谱抗病育种新途径》
    • 来源专题：转基因生物新品种培育
    • 编译者：zhangyi8606
    • 发布时间：2019-11-09
    • 上海交通大学教授陈功友领衔的植物与病原菌分子互作研究团队通过近20年研究，揭示了病原菌效应蛋白这个“间谍”与植物感病基因“接头人”之间的协同进化关系，提出利用基因编辑技术阻断两者之间的协同进化进程，从而使植物获得广谱抗病（RLS）的育种新途径，为解决作物抗病性丧失问题，保障粮食安全与食品安全提供了新的思路。该研究成果近日在线发表于《分子植物》。 水稻白叶枯病是三大水稻病害之一，是危害水稻生产的头号细菌“杀手”。该病在亚洲、拉丁美洲和西非数十个国家的水稻种植区广泛发生，国内目前除了新疆和东北的北部地区以外，其他省市的水稻种植区均有分布。水稻白叶枯病通常导致水稻减产10%~20%，发生严重的地区可达50%以上，甚至是绝收。同时水稻白叶枯病也是植物病理学和植物免疫学领域最重要的模式系统之一，在科学上具有重要研究价值。 大量筛选，发现病原细菌新“间谍” 植物病害发生的过程，就是病原菌与植物双方投入大量“兵力”进行的一场没有硝烟的战争。为了抵御病原菌的入侵，植物通过角质、蜡质等多种生化物质构筑起一系列坚固的物理和化学“堡垒”。病原菌运用“明修栈道，暗渡陈仓”的兵法来“攻击”这些“堡垒”，一方面通过合成胞外降解酶、毒素等物质“明修栈道”，从外部一层层瓦解这些“堡垒”，另一方面却通过组装多种被称为分泌系统的装置“暗渡陈仓”，将大量的效应蛋白“间谍”直接分泌到植物体“堡垒”内部，这些“间谍”在植物体内部大肆破坏，最终使“堡垒”从内部被“攻破”，植物发生病害。水稻白叶枯病菌派出的最重要的一类效应蛋白“间谍”是III型分泌系统分泌的转录激活因子类效应蛋白（TALE蛋白），其中只有少数几个毒性作用明显，称为主效TALE蛋白。 陈功友团队多年来从全国各水稻产区的发病田块收集分离到数百个白叶枯病原菌株，在不同的水稻品种上测定了这些菌株的毒性，并进行分子标记分析，发现这些中国菌株具有丰富的遗传多样性和毒性差异。通过基因组学和分子生物学工具，从其中几个强毒性菌株中分离到数十个TALE蛋白编码基因并分别测定毒性，最终“识破”了一类被称为PthXo2-like的新型主效TALE蛋白“间谍”，并且在不同的菌株中发现了这类蛋白的五种类型。 反复验证，确定水稻“间谍接头人” 水稻白叶枯病菌分泌的TALE蛋白“间谍”进入植物细胞后，能够躲过植物免疫系统的侦查，伪装成水稻自身的转录激活因子，与“潜伏”在水稻细胞内的一类感病基因“接头人”进行“联络”，“接头暗号”是双方特定氨基酸序列与DNA序列之间的一套密码。一旦“对上了暗号”，TALE蛋白就能够识别并结合在病基因启动子的相应区域，激活感病基因的表达，从内部“攻破”植物的防线。 研究人员通过对新发现的 “间谍”蛋白序列进行比较分析，初步确定水稻感病基因OsSWEET13具有“接头人”嫌疑。接下来经过不同分子生物学实验的反复验证，最终确定该基因即为该类“间谍”的靶标基因“接头人”。同时，对3000份水稻种质资源基因组进行的分析发现，该基因在启动子识别区域也存在十种不同的类型。从而证明病原菌的效应蛋白“间谍”与水稻感病基因“接头人”之间呈现出一种“军备竞赛”的协同进化关系。 善用利器，建立抗病育种新途径 陈功友团队根据水稻感病基因“接头人”OsSWEET与病原细菌TALE蛋白“间谍”之间的关系，采用新兴的基因编辑技术这一研究利器，干扰“间谍”与“接头人”之间“接头暗号”的识别，从而同时阻断多个细菌TALE蛋白“间谍”的破坏活动，最终获得了广谱抗白叶枯病的水稻新种质，提出了阻断植物感病性而获得广谱抗病性的育种新途径。 南京农业大学窦道龙教授对此评价道：“该研究在理论上阐明了不通过利用抗病基因而通过编辑多个感病基因从而实现作物的广谱抗病性，为水稻白叶枯病的防治提供了新的材料和方案，为作物抗病育种和抗性丧失治理提供了成功案例，具有重要理论和实践意义。” 据悉，陈功友团队目前正在将该技术应用于优良杂交水稻亲本的改良中，预计一两年内可育成稳定遗传的品种，这将大大缩短杂交水稻育种年限。不久，随着这些高产又抗病的品种在生产上的推广应用，农药的用量将急剧减少，农民生产水稻的经济和人力成本将大大降低，而老百姓将也在餐桌上吃到更加优质安全的大米。
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