《3月4日_东北师范大学研究团队认为COVID-19与SARS相关冠状病毒的受体结合蛋白存在很强的进化趋同》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: xuwenwhlib
  • 发布时间:2020-03-06
  • 3月4日_东北师范大学研究团队认为COVID-19与SARS相关冠状病毒的受体结合蛋白存在很强的进化趋同

    1.时间:2020年3月4日

    2.机构或团队:东北师范大学

    3.事件概要:

    3月4日,bioRxiv预印本平台发表了来自东北师范大学研究团队的题为“Strong evolutionary convergence of receptor-binding protein spike between COVID-19 and SARS-related coronaviruses”的文章。文章指出,虽然COVID-19和SARS相关的冠状病毒亲缘关系远,但两者均能够通过相同的受体(血管紧张素-转换酶2)ACE2感染人类宿主,并引起相似的临床和病理特征,提示其表型趋同。然而,它们表型趋同的分子基础仍然未知。

    该研究使用了最近开发的分子系统生态学方法来检查导致其表型趋同的分子基础。该文章指出,基因组水平分析结果显示,负责受体结合的刺突蛋白已沿着与2019-nCoV和SARS-CoV相关的分支进行了重要的自然选择;进一步检查显示,在COVID-19和SARS相关的冠状病毒进化枝之间的刺突蛋白的受体结合域(RBD)中,进化收敛的氨基酸位点比例异常高,导致其RBD蛋白序列发生系统发育。该文章分析认为,除了刺突蛋白,还发现了其伴侣蛋白ORF3a的进化趋同,表明它们可能共同进化。

    该文章认为其结果证明了COVID-19与SARS相关的CoV之间有很强的适应性进化趋同,可能有助于它们适应相似或相同的受体。该文章指出,许多观察到的蝙蝠SARS样冠状病毒具有与2019-nCoV和SARS-CoV进化趋同的RBD序列,可能已预先适应了人类宿主受体ACE2,因此可能是潜在的未来可感染人类的新型冠状病毒来源。

    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

    4.附件:

    原文链接https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.04.975995v1

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.04.975995v1
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    • 2月18日_重组和趋同进化导致了2019武汉新型冠状病毒的出现 1.时间:2020年2月18日 2.机构或团队:美国哥伦比亚大学、美国哈佛大学 3.事件概要: 2月18日,BioRxiv预印平台发表了美国哥伦比亚大学和哈佛大学的论文“Recombination and convergent evolution led to the emergence of 2019 Wuhan coronavirus”。 研究团队展示了β属冠状病毒中的重组现象。这些β属冠状病毒包括了能感染人类的SARS和MERS病毒。而这两种病毒频繁地在刺突基因中出现受体结合域(RBD)。进一步研究发现,这一普遍的现象进程很可能导致了此次新型冠状病毒(2019- nCoV)祖先受体结合域(RBD)重组事件的发生。该重组事件推测至少发生在11年前。通过与蝙蝠中分离的病毒株相比,新型冠状病毒(2019- nCoV)在受体结合域(RBD)上积累了大量氨基酸替换。同样的在对病毒复制和转录中有重要作用的多聚蛋白Orf1a的一个区域中也发现了大量氨基酸的替换。在这些突变中,该研究团队发现了在2003年的SARS病毒株中存在427N和436Y位点普遍的氨基酸替换现象,而427N和436Y同属于一个螺旋结构,似乎与人类ACE2受体存在相互作用。这表明了病毒存在潜在的适应性进化。 该研究团队提出了一个关于新型冠状病毒(2019- nCoV)出现的两步设想。先是在2009年之前,来源于蝙蝠的新型冠状病毒(2019- nCoV)的祖先通过重组融合了类似SARS的受体结合域(RBD)从而获得了SARS的基因特征,随后这些重组病毒经历了趋同进化,进而产生了此次的新型冠状病毒。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.10.942748v1