酒精和香烟使用对全基因组DNA甲基化产生深远的影响，并很常见，很多精神疾病都有这个比较隐蔽特点。酒精和香烟的使用可能的阻碍理解某些精神疾病的生物学因为如果物质使用的效果没有考虑到，它们的存在可能会混淆其他行为障碍的识别。自下丘脑 - 垂体 - 肾上腺轴（HPA）是已知的，我们通过检查在两个关??键HPA轴的基因，NR3C1和FKBP5。检查混杂醇和香烟消耗量对周围的DNA甲基化作用影响的可能性。我们发现，酒精和烟雾使用的影响在FKBP5基因比NR3C1基因更为突出。此外，在这两种基因的去甲基化吸烟和饮酒有关。我们认为，涉及HPA轴复杂的疾病的表观遗传学研究需要考虑物质使用的影响，应该小心控制，以尽量减少I型和II型错误的可能性。
