《1月31日_2019-nCov的最近共同祖先时间(MRCA)及流行动态(第三版更新)》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: xuwenwhlib
  • 发布时间:2020-02-07
  • 1月31日_2019-nCov的最近共同祖先时间(MRCA)及流行动态(第三版更新)

    1.时间:2020年1月31日

    2.机构或团队:中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、北京大学

    3.事件概要:

    1月31日,bioRxiv预印本更新发表来自中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、北京大学的文章。

    文中使用贝叶斯方法框架,基于GISAID提供的33个基因组序列,推断从时间校准的病毒系统发育和Re(effective reproductive number)随时间的变化,来表示此次2019-nCoV的流行动态。文章得到最近共同祖先时间(MRCA)为2019年12月17日(95%置信区间:2019年12月7日至2019年12月23日)。2020年1月1日左右,Re的估计中值从1.6变为1.1。这项研究提供了对2019-nCoV流行的早期认识。然而,由于数据量有限,在现阶段解释计算结果时应谨慎。

    附:

    1月27日,第二版计算结果为:最近共同祖先时间(MRCA)预计为2019年12月17日(95%置信区间:2019年12月5日至2019年12月23日)。Re的中值估计值在0.2到2.2之间。

    1月26日,第一版计算结果为:最近共同祖先时间(MRCA)预计为2019年12月17日(95%置信区间:2019年12月5日至2019年12月23日)。Re随时间急剧变化,最高值为2.5(0.5,4.9),最低值为0.3(0.006,1.47)(中间值和95%置信区间)。

    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.25.919688v3
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