《人工智能和遗传学可以帮助农民用更少的肥料种植玉米。》

  • 来源专题:农机装备
  • 编译者: 江浩
  • 发布时间:2025-06-03
  • NYU研究团队采用模型作物方法,追踪了玉米基因的进化历史,这些基因与常作为植物生物学模型的小开花杂草拟南芥共享。在《自然通讯》杂志上发表的前一项研究中,Coruzzi团队发现了玉米和拟南芥中对氮反应保守的基因,并验证了它们在植物中的作用。在最新的《植物细胞》研究中,他们进一步利用这些成果,确定了由同一转录因子调控的基因组——即“调控子”——如何影响玉米和拟南芥的氮利用效率。 研究团队首先使用RNA测序技术测量玉米和拟南芥在氮处理下的基因响应情况。然后,他们利用这些数据训练机器学习模型,以识别在玉米和拟南芥品种中保守的氮响应基因,以及调控这些重要基因的转录因子。通过计算每个“氮利用效率调控子”的集体机器学习得分,他们将这些调控子按其表达水平准确预测田间种植的玉米品种的氮利用效率的能力进行排名。 最后,研究人员在玉米和拟南芥中使用细胞研究验证了机器学习预测的准确性,确认了这些基因组的调控情况。这一研究展示了通过机器学习方法识别和验证植物中复杂基因调控网络的潜力,有助于提高农作物的氮利用效率。
  • 原文来源:https://www.nyu.edu/about/news-publications/news/2025/may/ai-nue-regulons.html
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    • 编译者:袁雪
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    • 巴西研究人员正在应用一种创新方法,以加速选择转基因玉米植株以抵抗干旱,并降低任务所涉及的运营成本。该技术使用配备 RGB 摄像头的无人机捕捉田间实验的图像,并将其转换为评估植物健康状况的指数。有了这些信息,就可以更快地识别出最有前途的标本,并模拟它们在不同气候条件下的表现,使选择过程更加高效和准确。 该研究由应用于气候变化的基因组学中心 (GCCRC) 的研究人员进行,该中心是 Embrapa 和坎皮纳斯州立大学 (Unicamp) 之间的合作伙伴关系,得到了圣保罗研究基金会 (Fapesp) 的支持。结果于昨天(1 月 5 日)发表在《植物表型组杂志》上。 由于气候变化导致干旱的频率和严重程度增加,因此开发更具适应力的品种变得至关重要。然而,传统的现场评估方法既费时又昂贵,难以快速推进。“在传统方法中,有必要等待工厂的整个周期并进行手动测量,通常使用昂贵的设备和缓慢的流程,”Embrapa Digital Agriculture 的研究员、该研究的作者 Juliana Yassitepe 解释说。 使用新方法,现场数据收集得到了显著优化。“以前,我们需要几天时间来测量谷物产量、开花时间和株高。现在,我们可以通过无人机飞行和图像处理在几个小时内完成,“Yassitepe 说。 现场实验 在 2023 年旱季期间,在坎皮纳斯 (SP) 进行了两次实验,为期五个月。共种植了 21 个玉米品种,其中 18 个品种具有正在接受耐旱性测试的基因,3 个品种没有基因改变,用于比较。这些植物受到受控管理条件的约束,差异在于一个变量:灌溉。“一组在整个周期中都接受了水,而另一组则遭受了干旱,”Yassitepe 详细说明。 无人机每周在实验场进行飞行,使用 RGB(传统)和多光谱(捕捉不可见光谱,例如红外)相机捕捉图像。分析表明,RGB 相机比多光谱相机便宜得多,可产生可靠的结果,使该技术可用于大规模育种计划。 降低成本并提高效率 除了降低运营成本外,该方法还允许在较小的区域进行研究,这在资源有限的项目中特别有用。种植面积的问题有时是植物遗传改良研究的瓶颈,因为研究小组并不总是有很多可行的种子可以在非常大的区域种植“,Yassitepe 解释说。“通过较低的飞行,可以获得高分辨率的图像,使我们能够在同一区域测试更多种类的玉米,”GCCRC 的博士后研究员、该研究的合著者 Helcio Pereira 补充道。 这种方法还可以在整个生长周期中监测植物的发育。“连续的时间分析对于了解植物如何应对水分胁迫至关重要,”Pereira 解释说。 无人机收集的详细数据已被用于开发预测模型,帮助选择适应不同环境条件的玉米品种。“有了这些模型,我们可以预测植物品种的行为,而无需频繁的手动测量,使过程更快、更容易获得,”Pereira 说。 由 Helcio Pereira、Juliana Nonato、Rafaela Duarte、Isabel Gerhardt、Ricardo Dante、Paulo Arruda 和 Juliana Yassitepe 撰写的研究“受干旱胁迫影响的转基因玉米事件的时间田间表型组学:交叉验证情景和机器学习模型”可在此处访问。 关于 GCCRC 气候变化基因组研究中心 (GCCRC) 是 Embrapa 和 Unicamp 在 FAPESP 的支持下的一项联合倡议,专注于植物基因组学的前沿研究,目标是开发创新解决方案并使作物适应与气候变化相关的压力。在此处了解更多信息。