德国吕贝克大学于2020年2月10日在bioRxiv上发表题为“Alpha-ketoamides as broad-spectrum inhibitors of coronavirus and enterovirus replication”的文章。
冠状病毒的主要蛋白酶和肠病毒的3C蛋白酶具有相似的活性位点结构,对底物P1位置的谷氨酰胺具有独特要求。由于其特异性以及在病毒聚合蛋白加工中的重要作用,这些蛋白酶可以作为开发抗病毒药物的合适靶标。为了获得针对α冠状病毒,β冠状病毒和肠病毒的近等效的广谱抗病毒药,研究人员基于结构设计拟肽α-酮酰胺作为主要蛋白酶和3C蛋白酶的抑制剂;确定了蛋白酶-抑制剂复合体的六个晶体结构;利用合成的化合物对重组蛋白酶以及病毒复制子和病毒感染细胞培养物进行了测试,大多数没有细胞毒性。事实证明,α-酮酰胺的P2取代基的优化对于获得对这三个病毒属的近等效性至关重要。最佳的近等效抑制剂11u(P2 =环戊基甲基)和11r(P2 =环己基甲基)在细胞培养物对肠病毒、α-冠状病毒和β-冠状病毒显示出较低的微摩尔半数有效浓度EC50值。在Huh7细胞中,11r对MERS冠状病毒表现出三位数的皮摩尔活性。