印度的研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Strategies for vaccine design for corona virus using Immunoinformatics techniques”,利用B细胞和T细胞表位预测结合分子对接的方法,进行了针对β-冠状病毒非结构蛋白4的基于抗原表位的肽疫苗的设计。
研究中收集了β冠状病毒同源非结构蛋白4的蛋白质序列,并通过系统发育研究对其保守区进行了研究,以确定蛋白质中免疫原性最强的部分。从目标蛋白的识别区域来看,38-47区的肽序列IRNTTNPSAR和76-90区的PTDTYTSVYLGKFRG分别被认为是最有潜力的B细胞和T细胞表位。此外,该预测的T细胞表位PTDTYTSVY和PTDTYTSVYLGKFRG分别与具有低IC50值的MHC等位基因蛋白HLA-A*01:01和HLA-DRB5*01:01相互作用。这些表位完美地配合在MHC I分子和MHC II分子的α螺旋的表位结合槽中,结合能得分分别为-725.0 Kcal /mole和-786.0 Kcal /mole,显示出在MHC分子结合中的稳定性。该MHC限制性表位PTDTYTSVY在世界人口覆盖率中也保持了50.16%的良好保存率。在58.87%的中国人群中也存在MHC I-HLA-A*01:01等位基因。因此,在进一步的实验研究之后,表位IRNTTNPSAR和PTDTYTSVYLGKFRG可作为冠状病毒肽基疫苗的潜在多肽。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。