《一种新的蝙蝠冠状病毒揭示了Spike蛋白S1/S2剪切位点的自然插入和HCoV-19的可能重组来源》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-03-12
  •     3月5日,bioRxiv预印本发表了来自山东第一医科大学(山东省医学科学院)等团队的题为“A novel bat coronavirus reveals natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the Spike protein and a possible recombinant origin of HCoV-19”的文章。
        新型冠状病毒HCoV-19在中国及其他地区造成了前所未有的肺炎流行,已引起全球范围的公共卫生关注。尽管蝙蝠被认为是HCoV-19最有可能的自然宿主,但病毒的起源仍不清楚。
        在文章中,研究团队报告了一种新的蝙蝠来源冠状病毒,命名为RmYN02,是2019年5月至10月期间从中国云南省收集的227只蝙蝠样本的亚基因组分析中鉴定出来的。RmYN02与HCoV-19在全病毒基因组中的同源性为93.3%,在与HCoV-19最接近的1ab基因中的同源性为97.2%。与此相反,RmYN02受体结合域(RBD)与HCoV-19之间呈现低序列同源性(61.3%),可能不与血管紧张素转换酶2(ACE2)结合。然而,与HCoV-19相似,RmYN02的特点是在Spike蛋白的S1和S2亚单位的剪切位点处有多个氨基酸插入,这就有力证明了这种插入事件在自然界中是可以发生的。这些数据表明,HCoV-19源于蝙蝠和其他野生动物中存在的病毒之间的多重自然重组。

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.02.974139v1
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    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-03-06
    • 1.时间:2020年3月5日 2.机构或团队:山东第一医科大学(山东省医学科学院)、中国科学院西双版纳热带植物园、中国科学院北京生命科学研究所、中国科学院武汉病毒研究所、中国科学院微生物研究所、悉尼大学 3.事件概要: 3月5日,bioRxiv预印本发表了来自山东第一医科大学(山东省医学科学院)等团队的题为“A novel bat coronavirus reveals natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the Spike protein and a possible recombinant origin of HCoV-19”的文章。 新型冠状病毒HCoV-19在中国及其他地区造成了前所未有的肺炎流行,已引起全球范围的公共卫生关注。尽管蝙蝠被认为是HCoV-19最有可能的自然宿主,但病毒的起源仍不清楚。 在文章中,研究团队报告了一种新的蝙蝠来源冠状病毒,命名为RmYN02,是2019年5月至10月期间从中国云南省收集的227只蝙蝠样本的亚基因组分析中鉴定出来的。RmYN02与HCoV-19在全病毒基因组中的同源性为93.3%,在与HCoV-19最接近的1ab基因中的同源性为97.2%。与此相反,RmYN02受体结合域(RBD)与HCoV-19之间呈现低序列同源性(61.3%),可能不与血管紧张素转换酶2(ACE2)结合。然而,与HCoV-19相似,RmYN02的特点是在Spike蛋白的S1和S2亚单位的剪切位点处有多个氨基酸插入,这就有力证明了这种插入事件在自然界中是可以发生的。这些数据表明,HCoV-19源于蝙蝠和其他野生动物中存在的病毒之间的多重自然重组。 4.附件: 原文链接 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.02.974139v1
  • 《山东第一医科大学及中国科学院等国际团队发现一种与SARS-CoV-2密切相关的蝙蝠冠状病毒的刺突蛋白S1/S2裂解位点处也存在氨基酸序列自然插入》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-05-19
    • 5月10日,Current biology发表了题为“A novel bat coronavirus closely related to SARS-CoV-2 contains natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the spike protein”的文章。 新型冠状病毒SARS-CoV-2在中国及全球范围内对公共卫生产生了重大影响。尽管蝙蝠被认为是SARS-CoV-2最有可能的自然宿主,但病毒的起源问题仍不清楚。在本文中作者报告了一种新的蝙蝠源冠状病毒,命名为RmYN02,是从2019年5月至10月间从中国云南省收集的227只蝙蝠样本的亚基因组分析中鉴定出来的。值得注意的是,RmYN02与SARS-CoV-2的全病毒基因组核苷酸同源性为93.3%,1ab基因的核苷酸同源性为97.2%,是迄今为止报道的SARS-CoV-2最接近的种属。而与之相反的是,RmYN02在受体结合域(RBD)与SARS-CoV-2呈低序列同源性(61.3%),可能与血管紧张素转换酶2(ACE2)不结合。另外重要的是,与SARS-CoV-2相似,RmYN02也被发现在刺突蛋白的S1和S2亚单位之间剪切位点处存在多个氨基酸插入。这个发现有力地证明了这种基因/氨基酸插入事件可以在动物beta-冠状病毒中自然发生。