《温廷益研究组在肿瘤氨基酸代谢调控及靶向纳米药物设计研制方面取得新进展》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2022-06-28
  • 肿瘤细胞的代谢重编程已成为多种癌症细胞的重要代谢特征,肿瘤细胞通过对不同代谢途径的调节大量合成其增殖所必须的物质,使其更适宜于在恶劣的微环境中实现快速增殖。氨基酸是细胞生长的基本营养物质,已有研究发现谷氨酰胺、丝氨酸、甘氨酸、脯氨酸和天冬氨酸的代谢调节参与肿瘤细胞增殖,揭示氨基酸代谢在肿瘤细胞中的代谢调节机制,对癌症治疗和药物设计具有重要的研究意义。

      温廷益研究组前期鉴定了人膀胱癌干细胞一条新的干性维持通路—KMT1A-GATA3-STAT3,揭示了该通路促进膀胱癌干细胞自我更新的机制(Clinical Cancer Research, 2017, 23(21), 6673-6685)。

      在此基础上,研究组继续对膀胱癌细胞中线粒体编码的丝氨酸羟甲基转移酶SHMT2的功能进行深入研究。利用CRISPR/Cas9技术敲除了SHMT2基因,发现其缺失抑制了细胞的增殖、迁移和侵袭能力,同时代谢组学分析发现胞内嘌呤和一碳单位的含量明显降低,ATP合成减少,DNA复制受到抑制,导致细胞周期延迟。同时发现添加一碳单位的供体甲酸盐,能够恢复SHMT2缺失对细胞所产生的影响,表明SHMT2介导的一碳单位对膀胱细胞增殖是必不可少的,也进一步证明了SHMT2通过维持氧化还原稳态来支持膀胱癌细胞的增殖。SHMT2缺失降低NADH/NAD、NADPH/NADP和GSH/GSSG的比值,促进细胞内活性氧(ROS)的积累,导致线粒体膜电位的丢失、细胞色素c的释放、Bcl-2家族蛋白的易位和caspase-3的激活。

      研究结果揭示了SHMT2缺失诱导ROS依赖的线粒体介导的细胞凋亡的重要机制(图1),有助于深入了解丝氨酸代谢和细胞凋亡之间的联系,并为膀胱癌治疗和药物设计提供了一个新的靶标。以SHMT2为靶标,通过筛选不同的小分子抑制剂,获得了一个具有一定抑制效果的新型小分子抑制剂,已获得授权专利1项(ZL201911058182.7)。

      上述研究结果已发表于Cancer Gene Therapy期刊,题为“SHMT2 promotes cell viability and inhibits ROS-dependent, mitochondrial-mediated apoptosis via the intrinsic signaling pathway in bladder cancer cells”,张芸副研究员为第一作者,温廷益研究员为通讯作者。

     针对肿瘤细胞的谷氨酰胺代谢特征,研究组提出了一种靶向谷氨酰胺代谢增强ROS抗癌效果的策略,并开发了一种新的化学动力学治疗(chemodynamic therapy, CDT)纳米粒子(ZIF(Fe)&CB NPs),该纳米粒子具有显著增强的癌细胞毒性和肿瘤抑制效果。以乳腺癌作为研究对象,通过转录组学分析,确定了不同亚型乳腺癌的预测性生物标志物,选择谷氨酰胺酶(GLS1)抑制剂CB-839作为阻断基底型乳腺癌谷氨酰胺酶代谢的候选药物。

      利用仿生矿化方法制备了铁掺杂的基于ZIF的纳米粒子(ZIF(Fe) NPs),进一步将CB-839装载到ZIF(Fe) NPs中,制备获得了增强型CDT多功能纳米粒子ZIF(Fe)&CB NPs,其能够将Fe2+和CB-839同步递送至肿瘤部位。Fe2+介导的芬顿反应(Fenton reaction),将肿瘤细胞内过氧化氢(H2O2)转换成羟基自由基(·OH), 导致胞内产生氧化应激效应;CB-839抑制肿瘤细胞的谷氨酰胺分解代谢,一方面减少了细胞内的抗氧化剂(谷胱甘肽、牛磺酸)的合成,增强Fe2+引起的胞内氧化应激效应;另一方面降低了核苷酸、氨基酸、脂质等的合成,导致DNA损伤修复和细胞生长增殖所需代谢物的供给不足,从而增强了CDT的细胞杀伤作用。

      体内肿瘤抑制实验进一步证实ZIF(Fe)&CB NPs增强的抗癌性能和良好的生物相容性,为基于ROS的抗癌纳米药物的开发和改进提供了一个有效策略。

      上述研究已申请专利1项,相关结果以“Zeolitic imidazolate framework-based nanoparticles for the cascade enhancement of cancer chemodynamic therapy by targeting glutamine metabolism”为题目,发表于Nanoscale期刊,博士研究生菅慧为第一作者,温廷益研究员和张芸副研究员为共同通讯作者。

  • 原文来源:http://www.im.cas.cn/xwzx2018/kyjz/202206/t20220624_6465737.html
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    • 编译者:hujm
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    • L-丝氨酸在细胞代谢过程中具有不可替代的生理作用,是多种氨基酸的合成前体。参与嘌呤、嘧啶等核酸碱基的合成;在脂肪的代谢过程中,参与磷脂酰丝氨酸、鞘磷脂等磷脂的合成和细胞膜的形成;丝氨酸还是胞内多种重要生物物质合成所需的一碳单位的直接供体。由于丝氨酸具有重要生理作用,其被广泛应用于氨基酸输液产品、免疫抑制制和肿瘤治疗等医药领域。但是由于丝氨酸处于至关重要的中间代谢位置,代谢转运速度极快,非常不容易积累,导致无法实现直接发酵法生产丝氨酸,致使丝氨酸成为我国氨基酸生产的四大瓶颈之一。 温廷益研究组前期对工业生产菌种谷氨酸棒杆菌的研究发现, L-丝氨酸对维持菌体的生长代谢至关重要,因为由丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)催化的丝氨酸分解为甘氨酸的反应,同时生成细胞生长所必需的一碳单位。丝氨酸积累导致一碳单位的供应不足,明显降低细胞的生长速率并减少生物量。为解除胞内丝氨酸分解代谢和细胞生长的偶联,利用基因组规模代谢网络模型模拟计算,对一碳单位代谢途径进行了重编程:即通过减弱SHMT的表达,同时将大肠杆菌中甘氨酸裂解系统引入谷氨酸棒杆菌,为细胞提供一条新的一碳单位供给途径满足细胞生长需要。新途径的引入,使细胞获得了能够再循环利用甘氨酸为前体合成一碳单位的能力,不仅满足了细胞生长的需要,维持正常的细胞形态,而且使丝氨酸的积累量显著提高。蛋白质组学分析进一步发现了细胞应对一碳单位代谢扰动的调节机制。细胞通过调节参与一碳单位代谢酶的表达,增强不同一碳单位之间的相互转化,通过一碳单位的循环实现代谢平衡,以满足细胞生长的需要。 本研究通过对一碳单位代谢途径的重编程,解决了丝氨酸代谢和细胞生长所需的一碳单位之间的供需平衡,解除了丝氨酸代谢和细胞生长的偶联,突破了抑制丝氨酸积累的瓶颈。本研究建立了设计一条新的代谢路径维持细胞生理代谢的方法,提供了一种平衡细胞生长和代谢产物积累的新策略,为调节微生物细胞代谢合成目标产物提供了新思路。 该研究已于近日在线发表于ACS Synthetic Biology,微生物所张芸副研究员为该文的第一作者,温廷益研究员为通讯作者。该研究得到中国科学院科技服务网络计划(STS计划)(KFJ-STS-QYZD-047和KFJ-EW-STS-078)和国家自然科学基金(3110074)的资助。
  • 《国家纳米科学中心丁宝全课题组在基于DNA纳米机器的肿瘤疫苗方面取得新进展》

    • 来源专题:中国科学院文献情报制造与材料知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:冯瑞华
    • 发布时间:2020-10-21
    • 国家纳米科学中心丁宝全研究员课题组在DNA纳米机器用于精准化智能化肿瘤疫苗研究方向取得重要进展。研究成果“A DNA nanodevice-based vaccine for cancer immunotherapy”发表于Nature Materials(DOI:10.1038/s41563-020-0793-6; https://rdcu.be/b6SOx)。 恶性肿瘤是一类严重危害人类健康的重大疾病。肿瘤免疫治疗能够调控自身的免疫系统,有效地清除恶性肿瘤细胞。多种肿瘤免疫治疗策略为肿瘤治疗带来了新的希望。其中肿瘤疫苗研究被广泛关注,尤其是针对特定患者的个体化疫苗越来越受到研究者的重视。然而,疫苗在前期研究和临床试验中的抗肿瘤治疗效果仍然不理想。其中一个主要的原因是缺少理想的运输载体,将佐剂分子和抗原分子高效共递送到淋巴器官,从而实现高效的免疫系统激活。此外,免疫功能成分精准定量及在其作用位点的可控释放也是极大的挑战。 基于分子自组装的DNA纳米结构具有结构精确可控、易于化学修饰、生物可降解等特点,是一种很有潜力的纳米载体,在药物靶向运输、可控释放、多种药物协同运输治疗等方面已展示了非常广阔的应用前景。丁宝全课题组在前期的工作中根据生理病理的标志物分子设计构筑了刺激响应型DNA自组装结构及DNA纳米机器,实现了功能蛋白、核酸药物、小分子化药等组分的精准靶向递送及可控释放,在动物水平的多种肿瘤模型展现了良好的治疗效果(Nature Biotechnol., 2018, 3, 258; Angew. Chem. Int. Ed., 2018, 57, 15486; J. Am. Chem. Soc., 2019, 141, 19032)。这些研究提出了药物递送体系程序化设计的研究思路,为肿瘤等疾病的治疗提供了全新的精准化智能化策略。 在前期研究的基础上,丁宝全课题组提出了利用DNA纳米机器构建抗肿瘤疫苗的概念。他们利用DNA折纸技术,构建尺寸形状精准可控、同时搭载肿瘤抗原和多种佐剂的肿瘤疫苗体系,利用抗原特异性的免疫反应进行肿瘤免疫治疗。首先选用肿瘤抗原多肽与单链DNA进行共价偶联,同时针对位于免疫细胞内涵体内的免疫通路受体TLR3及TLR9选取核酸免疫佐剂dsRNA 与CpG,通过核酸分子的杂交在纳米机器内部进行定位定量的装载。设计酸响应的DNA分子锁将装载了各种功能成分的DNA结构封闭,形成完整闭合的DNA纳米机器,保护内部的免疫功能组分。DNA纳米机器由于特殊设计的尺寸形状能够被高效富集到淋巴结,当进入淋巴结内树突细胞后,在内涵体微酸性环境中,分子锁响应性开启,DNA纳米机器由关闭状态转变为开启状态,共同释放抗原和多种佐剂,刺激树突细胞活化和抗原递呈,诱发抗原特异性免疫反应,有效杀伤肿瘤细胞。搭载不同肿瘤抗原多肽的DNA纳米机器在黑色素瘤、结直肠肿瘤小鼠模型上都展现良好的抗肿瘤疗效。由于解决了肿瘤疫苗精准化及多佐剂联用的难题,纳米机器显示了长期的免疫记忆效果,有效抑制肿瘤复发与转移。这种基于多种成分共同精准组装、刺激响应控制的DNA纳米机器在肿瘤疫苗体系的开发及个体化的肿瘤免疫治疗应用中显示了巨大潜力。同时,DNA纳米机器具有可程序化设计的特点,可以通过进一步设计优化用于病毒相关抗原及佐剂等功能成分的递送,有望为抗病毒疫苗的构建提供全新的平台。 国家纳米科学中心博士生刘少利和蒋乔研究员为该论文的共同第一作者,丁宝全研究员为通讯作者。该研究得到北京市科技计划(前沿新材料研究)、国家自然科学基金、中国科学院战略性先导科技专项及前沿科学重点研究计划、科技部重点研发计划等项目的支持。   (a)DNA折纸构建肿瘤抗原肽/ CpG环/ dsRNA共同负载的纳米机器肿瘤疫苗示意图 (b)利用DNA纳米机器进行癌症免疫治疗的示意图