一项新研究发现,各国上报禽流感基因信息的平均时间为七个月,而加拿大排在最后,而禽流感基因信息对于追踪和预防人类大流行至关重要。
今天在《自然生物技术》杂志上发表的这篇未经同行评审的评论文章的作者表示,这项研究凸显了加拿大和其他国家迫切需要加快从感染动物采样、分析基因信息到提交全球科学数据库的流程。
动物学系教授 Sarah Otto 博士 (SO) 和动物学博士生 Sean Edgerton (SE) (他/他) 讨论了为什么快速获取这些信息至关重要,以及加拿大之前是如何做到的。
我们为什么需要这些数据?
SO:如果我们希望预防另一场大流行,我们就需要追踪病毒的进化。我们担心的流感病毒株 H5N1 已经对多个国家的奶制品和家禽业造成了严重破坏,并传播到数百种鸟类和哺乳动物,但到目前为止,该病毒还没有进化出在人类中有效传播所需的特征。通过来自世界各地的实时基因数据,我们可以密切关注这些特征,如果我们发现这种进化,就发出警报。我们对 COVID 变种就是这么做的。通过利用基因数据追踪病毒的进化,我们能够提前警告变种的传播,从而采取公共卫生应对措施,例如增加医院容量并迅速为高危人群提供疫苗。我们一起拯救了生命。
你发现了什么?
SE:我们在全球数据库“全球共享所有流感数据倡议”(GISAID) 上查看了 2021 年 1 月至 2024 年 12 月的近 19,000 个 H5N1 样本。我们测量了从动物或人类身上采集病毒样本,分析基因数据,到提交到数据库,然后其他科学家才能对其进行研究所需的时间。然后,我们计算了每个国家提交至少 50 个序列的平均时间。我们发现全球平均时间约为 228 天。加拿大最慢,平均 618 天。最快的国家是捷克共和国和荷兰,平均只有 25 天。对于像 H5N1 这样有可能引发大流行的病毒来说,花费的时间之长令人震惊。
为什么延迟这么久?
SO:我们不确定,但延迟可能是由于参与整个收集、分析和提交过程的不同机构数量众多。此外,几乎没有专项资金用于监测加拿大野生动物中的 H5N1,因此大多数监测这种高致病性流感病毒传播的努力都是依靠其他研究。
我们能做什么?
SO:我知道我们可以做得更好。加拿大大幅缩短了 SARS-CoV-2 的提交时间,将数据延迟时间从约 88 天缩短至 16 天。加拿大现在是向世界通报导致 COVID-19 的病毒变化的最强大和最有效的国家之一。我们可以对 H5N1 做同样的事情。我们还担心最近美国对收集和共享信息的限制,政府科学家被大范围解雇,数据共享受到限制。野生动物不关心边界,因此加拿大需要站出来监测北美的情况,以帮助提醒我们自己和其他国家注意这种病毒令人担忧的变化。