3月11日上午,COVID-19在波士顿地区蔓延,布罗德研究所(Broad Institute)的员工被建议从第二天开始尽可能在家工作,我在布罗德的电梯里碰到了一位老朋友。我第一次见到Bronwyn MacInnis是在Broad的传染病基因组中心(GCID)担任项目经理时,后来我搬到Stanley精神病研究中心领导该中心的项目管理团队。
Bronwyn是病原体基因组监测主任,他与Pardis Sabeti密切合作,Pardis Sabeti是Broad研究所的成员,也是哈佛大学和哈佛大学公共卫生学院的教授,他们一起研究病原体的基因组学以及它们如何传播。Sabeti实验室最出名的是2014年西非埃博拉疫情、2016年寨卡疫情和马萨诸塞州腮腺炎疫情期间的基因组监测工作。现在,中国正加紧应对COVID-19疫情。
随着电梯加速到六楼,Bronwyn迅速转述说,实验室正在支持波士顿和西非医院和公共卫生实验室的同事建立诊断测试和基于病毒序列的跟踪,以了解病毒是如何传播的。布隆温说,事态正以惊人的速度发展。然后电梯门开了,她冲去开会。
在接下来的几天里,我开始在家工作,我发现我和其他人在斯坦利中心管理的全球人类精神基因组学项目的日常工作稍微慢了下来。我记得我和Bronwyn的简短谈话,所以我给她发了邮件,提供运营和项目管理方面的帮助。随着疫情在波士顿迅速蔓延,Sabeti实验室显然需要某些流程和结构,以有效和高效地管理快速测序和分析数百种病毒基因组的复杂性。这是我和我的团队知道如何做的事情,他们中的大多数人都获得了项目管理专业人员(PMPs)的认证。
雄心勃勃而又复杂的科学努力,比如萨贝提实验室正在着手的这项工作,需要科学与管理的牢固融合,以确保工作中的每一步都经过精心设计并有效执行,同时有效利用资源。
在认识到项目管理在研究中的价值后,Broad学院在过去的五年中,一直在其项目经理的职业发展方面进行投资,包括PMP认证:这些员工在科学上是精明的,他们配备了从行业中学习到的正式项目管理工具包。The Broad已经建立了一个由60多名科学项目经理组成的团队,支持整个研究所的各种研究实验室。
Bronwyn热情地接受了我的帮助,她、Pardis和我很快开始工作,制定他们的计划,我们每个人都知道我们才刚刚开始意识到未来的事情有多么重要。我们开始为工作奠定基础,使我们对COVID-19病毒在波士顿地区的传播有了新的认识。
团队科学行动
每一个重大的科学挑战都可以通过分解成许多小的工作来解决。在项目管理术语中,我们称之为工作分解结构。每个与SARS-CoV-2诊断和监测相关的工作分解结构都需要一个所有者来支持它,并在与团队其他成员协同工作的同时实现具体目标。我知道更多的项目经理可以帮上忙。
当我问我的斯坦利中心项目经理——一个有凝聚力的团队具有互补技能——如果他们愿意深入了解病毒的世界,许多同意更加渴望和兴奋能够把他们的技术技能,在大流行应对工作,并帮助广大社区。
Sabeti实验室手头的业务——建立伙伴关系,从合作医院或公共卫生机构获得用于研究的SARS-CoV-2样本,修改或创建机构审查委员会(IRB)方案;开发和测试新的诊断和测序方案;采购资金和试剂;分析和共享数据——这是一个不小的成就。它涉及大量人员和过程的协调,而没有冗长的启动阶段或面对面的会议。所有人员,包括研究助理,都必须迅速改变方向,迅速适应敏捷的工作生活,在斯坦利中心经理的支持下,项目经理们全身心地投入工作。
卡洛琳·库西克(Caroline Cusick)在搬到斯坦利中心之前,也曾在GCID和Broad的基因组平台工作,她为新的样本跟踪需求带来了专业知识,以管理输入的样本板。她创建了一个连接到电子笔记本系统的新系统,这样实验室成员就可以很容易地监控在分析管道中移动的一批批样品。曾在基因组平台工作过的凯特琳·弗劳尔斯(Katelyn Flowers),促进了样本跟踪和步行测序需求。Felecia Cerrato全身心投入到CARMEN的管理中,CARMEN是一种用于病原体检测的诊断技术,为实验室快速扩大监测的样本处理做准备。安娜·诺伊曼(Anna Neumann)接手了许多合规工作,包括修改关键的法律和IRB文件,使病毒测序和监测工作能够以安全和道德的方式向前推进。为整个团队建立并运行动态会议结构,每天使用Trello和Smartsheet等工具检查行政和科学策略,持续跟踪和监控进度。与来自布罗德数据科学平台、基因组学平台、研究课题保护办公室和战略伙伴关系与联盟办公室的成员一起工作,我们共同探索了这一不断发展的领域。
从一开始就很明显,在开始和计划阶段,早上的签入会议是至关重要的,可以分析出可用性、实力和每个团队成员的兴趣,以及如何将他们部署到特定的功能上。实验室成员和项目经理在一个虚拟的项目Trello板上工作,将所有的组件分解成子任务。每个子任务都有一个或多个所有者,他们被调用来在签入会议中提供更新,以跟踪进度。实验室人员被协调成两个轮班小组,以遵守COVID-19安全指南,最大限度地完成手头的工作。
随着团队快速进入执行阶段,并且样本开始在管道中移动,管理团队支持出现专门用于特定功能的较小会议小组。每个过程都有一个所有者,他监控和管理工作的质量和时间,并让涉众了解情况。我们落实并分享了长期建议、优化方案和跟踪系统。实验室成员很快意识到有科学头脑的项目经理促进所有活动的好处。
这些系统和管道导致的快速生成和分析数据来自300多个SARS-CoV-2基因组,6月8月预印本,基于这些数据与更多的病毒序列和更深的了解病毒的传播在马萨诸塞州,以及增强诊断管道。
Bronwyn说:“在最具挑战性的环境下,这个项目管理团队帮助我们建立了一个生产式的病毒测序和分析流水线,这是无价的。”“他们对社区做出了真正的承诺,不知疲倦地建立了项目和过程管理解决方案,这给了我们扩展工作所需的框架,我们今天仍然依赖它。”