2018年12月20日，科学家报道了从塞拉利昂的三个场所取样的五只埃及果蝠（Rousettus aegyptiacus）经检测后是马尔堡病毒阳性。没有人在那里被感染，不过这一发现发出警告：作为一种与对人类高度致命性的埃博拉病毒存在亲缘关系的病毒，马尔堡病毒在当地存在着。
领导来自美国疾病控制预防中心（CDC）的一个研究团队的生态学家Jonathan Towner在一篇新闻稿中表示，“我们很早就知道，在非洲其他地区携带马尔堡病毒的果蝠也生活在西非。因此，我们在西非的蝙蝠中发现这种病毒就不足为奇了。”
这一发现是由美国加州大学戴维斯分校领导的PREDICT-USAID项目和美国CDC开展的监测项目的一部分，这些项目于2016年在西非爆发埃博拉疫情后开始在塞拉利昂采集蝙蝠中的样品。对4只蝙蝠中发现的马尔堡病毒进行的基因测序结果表明它们存在相当大的多样性，这就表明这种病毒已在塞拉利昂存在了多年。
最后一次爆发的马尔堡病毒疫情发生在2017年的乌干达。根据美国CDC的统计数据，2005年在安哥拉爆发的马尔堡病毒疫情最为严重，在252名感染者中，90%的人死亡。来自塞拉利昂蝙蝠的两种马尔堡病毒毒株与马尔堡病毒安哥拉毒株是相类似的。
