据EurekAlert!网站2月25日消息，芝加哥大学的研究人员利用超级计算机首次开发出了一个完整的SARS-CoV-2病毒体的新的多尺度粗粒度模型，包括其核心遗传物质和病毒外壳。该模型为科学家提供了利用该病毒“漏洞”的新方法的可能性。相关研究于2020年11月发表在Biophysical Journal上。
该项研究的早期结果显示了病毒表面的刺突蛋白是相互连接的，当一种蛋白质移动时，另一种蛋白质也会相应移动。刺突蛋白的这种协同运动有助于了解冠状病毒如何探索和检测潜在宿主细胞的ACE2受体。
该团队开发的整体模型首先建立了SARS-CoV-2病毒的四个主要结构元素的原子模型：刺突、膜、核衣壳和包膜蛋白。然后对这些原子模型进行模拟和简化，以生成完整的粗粒度模型。
该团队利用了德克萨斯大学奥斯汀分校的学高级计算中心（TACC）运营的Frontera超级计算机上生成的刺突蛋白的开态和闭态的全原子动力学信息，以及其他数据。Frontera系统由美国国家科学基金会（NSF）资助。
Frontera提供给研究人员的这类信息有助于理解病毒感染的基本机制，还有助于设计更安全、更好的药物来治疗和预防这种疾病。
原文链接：https://www.eurekalert.org/pub_releases/2021-02/uota-fcc022521.php
