兰科石仙桃属植物(Pholidota Lindl. ex Hook.)分布于亚洲热带、亚热带地区,世界约有30种,我国产约15种。该属植物具有重要的经济价值,其中有些类群为传统中药材,俗称石橄榄。然而,以往由于采样不足、缺乏足够的信息位点及有限的基因组信息,该属和近缘属间的关系和系统地位尚不清楚,石仙桃属的分类问题尚存在争议。为了解该属植物的系统发育关系及其叶绿体基因组的变异模式,科研人员对13种石仙桃属植物的叶绿体全基因组进行了高通量测序、组装和注释分析。结果显示,石仙桃属叶绿体基因组均为典型的环状四分体结构,大小在158,786 ~ 159,781 bp之间。每个叶绿体基因组包含135个基因,其中蛋白质编码基因89个,tRNA基因38个,rRNA基因8个。密码子使用模式分析显示石仙桃属叶绿体基因组偏向使用以A/U结尾的密码子。重复序列分析鉴定出444个串联重复序列,322个回文重复序列和189个散在重复序列。变异位点共检测到525个SSRs、13834个 SNPs和8630个InDels。本研究确定了6个高度可变区域,用于未来的分子标记及相关的遗传学和基因组学研究。