《6月8日_加州大学旧金山分校等通过基因组监测揭示SARS-CoV-2多次引入北加亚》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-06-10
  • 1.时间:2020年6月8日

    2.机构或团队:加州大学旧金山分校、加州大学旧金山分校-Abbott病毒诊断和发现中心、牛津大学、美国劳伦斯·伯克利国家实验室、加州公共卫生局等

    3.事件概要:

    Science于6月8日发表了加州大学旧金山分校24家机构的联合文章“Genomic surveillance reveals multiple introductions of SARS-CoV-2 into Northern California”。文章指出,截至2020年5月4日,在加州有超过52,000例COVID-19病例。该文章中,研究人员使用来自加州9个县和大公主号游轮的36位患者的样本,调查北加州从2020年1月下旬开始到3月中旬SARS-CoV-2的基因组流行病学。系统发育分析表明,至少有包括与华盛顿州有关的流行WA1毒株在内的7个不同的SARS-CoV-2谱系隐密地引入了加州,缺乏优势谱系,并且在社区之间有限传播。研究人员通过病毒基因组中的单个碱基替换来定义了与加州2个县的暴发簇相关的谱系。文章表示,这些发现支持了接触者追踪、社交距离和旅行限制,以遏制SARS-CoV-2在加州和其他州的传播。

    4.附件:

    原文链接:https://science.sciencemag.org/content/early/2020/06/05/science.abb9263

  • 原文来源:https://science.sciencemag.org/content/early/2020/06/05/science.abb9263
相关报告
  • 《加州大学旧金山分校等通过基因组监测揭示SARS-CoV-2多次引入北加亚》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-06-23
    • Science于6月8日发表了加州大学旧金山分校24家机构的联合文章“Genomic surveillance reveals multiple introductions of SARS-CoV-2 into Northern California”。文章指出,截至2020年5月4日,在加州有超过52,000例COVID-19病例。该文章中,研究人员使用来自加州9个县和大公主号游轮的36位患者的样本,调查北加州从2020年1月下旬开始到3月中旬SARS-CoV-2的基因组流行病学。系统发育分析表明,至少有包括与华盛顿州有关的流行WA1毒株在内的7个不同的SARS-CoV-2谱系隐密地引入了加州,缺乏优势谱系,并且在社区之间有限传播。研究人员通过病毒基因组中的单个碱基替换来定义了与加州2个县的暴发簇相关的谱系。文章表示,这些发现支持了接触者追踪、社交距离和旅行限制,以遏制SARS-CoV-2在加州和其他州的传播。
  • 《3月30日_对SARS-CoV-2基因组的调查显示其在没有优势谱系的情况下多次独立引入到北加州》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-04-01
    • 1.时间:2020年3月30日 2.机构或团队:加利福尼亚大学、英国牛津大学、加州公共卫生部、哈钦森癌症研究中心、华盛顿大学、美国华盛顿州贝尔维尤疾病建模研究所、美国普斯研究所、美国疾病预防控制中心 3. 事件概要: medRxiv于3月30日发表了加利福尼亚大学等发表的论文“A Genomic Survey of SARS-CoV-2 Reveals Multiple Introductions into Northern California without a Predominant Lineage”。研究人员使用回程旅客、游轮旅客的样本以及感染源不清楚的社区传播病例,调查了北加利福尼亚州SARS-CoV-2的遗传多样性和基因组流行病学。研究人员从2月3日至3月15日诊断为COVID-19感染的29例患者中提取病毒基因组,系统发育分析显示,至少有8种不同的SARS-CoV-2谱系,提示该病毒的多次独立引入到北加州。来自连续两次出游的乘客的病毒基因组与华盛顿州流行病相关包括包括1月19日在美国报告的第一例患者的病毒基因组聚类。研究人员还发现了SARS-CoV-2谱系从一个社区向另一个社区传播的可能证据。研究指出,这些发现表明,迄今为止,北加利福尼亚州SARS-CoV-2的隐性传播的特征是多个传播链,这些传播链是通过国际和州际旅行的单独引入而产生的,而不是单个主要优势谱系的广泛社区传播。快速检测和接触者追踪、社会隔离和旅行限制将有助于减缓SARS-CoV-2在加州和美国其他地区的传播。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.27.20044925v1