《农科院揭示植物祖先陆地化起源及机制》

  • 来源专题:生物科技领域知识集成服务
  • 编译者: 陈方
  • 发布时间:2020-04-08
  • 从水生向陆地环境的过渡(称为陆地化)通常被认为是改变地球表面陆地植物区系的进化和多样性的关键事件,深刻改变了整个生态系统,为包括人类在内的高等生命提供了氧气、食品、营养等必需的生存和发展基础。
    中国农业科学院基因组所程时锋团队与德国、加拿大、俄罗斯的研究者合作,对双星藻纲(Zygnematophyceae)中的两个物种(Spirogloea muscicola gen. nov.和Mesotaenium endlicherianum)进行基因组测序,构建的系统发育树结果显示S. muscicola与其他所有双星藻纲都能很好地分离,且为新属Spirogloeophycidae中的一个新物种,同时它又是双星藻纲最早分化出来的最接近系统发育树根部的一支;比较基因组学分析显示,之前被认为是陆地植物才有的很多转录因子或与植物激素、抗旱抗逆等相关的基因家族,在S. muscicola基因组上都能找到其祖先起源的“根”。此外,两个关键的基因GRAS和PYL是陆地植物祖先适应陆地生境的关键分子驱动力,GRAS与植物生长、发育和抗逆等代谢途径有关,PYL是脱落酸ABA遗传通路中的重要受体因子,之前一直认为是陆地植物所特有的,但此次研究发现双星藻纲的两个基因组中也存在这两个基因,分子钟结果显示从土壤细菌中来的水平基因转移的时间约为6亿年前,与植物陆地化上岸前的化石时间相吻合。该研究报道了两个新的单细胞绿藻基因组,揭示了陆地植物祖先“借用”土壤细菌基因的遗传物质创新以驱动漫长的陆地化进程。相关研究成果于2019年11月14日发表于Cell上

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  • 《科学家发现植物祖先陆地化“转基因”过程》

    • 来源专题:转基因生物新品种培育
    • 编译者:zhangyi8606
    • 发布时间:2019-12-30
    • 本报讯(记者黄哲雯)近日,国际期刊《细胞》在线发表了中国农科院农业基因组研究所程时锋团队的重要成果——程时锋团队与来自德国、加拿大、俄罗斯和深圳华大基因等国家、机构的科学家联合发布两个单细胞绿藻的基因组,揭示了陆地植物共同的祖先在5亿年前,突破干旱适应成功登陆上岸的分子机制,同时也发现了陆地植物祖先“借用”土壤细菌基因进行陆地化的“转基因”进程。 此前科学家们已明确陆地植物的祖先来自江河湖海,从水生到陆生,从简单到复杂的演化过程中,经历过很多重要的进化创新。程时峰团队通过系统研究,证明了一种水生的单细胞绿藻Spirogloea muscicola是所有陆地植物最近缘的共同祖先。他们发现,许多之前被认为是陆地植物才有的基因,在该绿藻基因组上都能找到起源的“根”。 该研究同时发现,在进化过程中,为了适应陆地环境,陆地植物的共同祖先从土壤细菌中“借”来了两个关键基因:GRAS和PYL,这是大自然自发的“遗传工程事件”,也是陆地植物祖先适应陆地生境的关键分子驱动力。之前,这两个关键基因一直被认为是陆地植物所特有的。科研人员发现这次水平基因转移事件发生的时间约为6亿年前,与植物陆地化上岸前的化石时间相吻合。 基因组所程时锋研究员为该文第一作者,德国科隆大学Michael Melkonian教授以及加拿大阿尔伯塔大学Gane Ka-Shu Wong教授为该文共同通讯作者,基因组所程时锋团队冼文飞实习研究员为共同第一作者。 来源:工人日报
  • 《农科院生物所揭示植物核糖核酸甲基化调控新机制》

    • 来源专题:转基因生物新品种培育
    • 编译者:Zhao
    • 发布时间:2017-10-19
    • 近日,中国农业科学院生物技术研究所和新加坡国立大学开展合作,在核糖核酸甲基化调控机制方面取得重要进展,揭示了5-甲基胞嘧啶修饰在植物信使核糖核酸上的分布规律,阐述了其调控植物发育及基因表达的新机制。相关研究成果于9月28日在线发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。 核糖核酸作为重要的遗传物质,截至目前已有100余种不同的化学修饰形式被发现,6-甲基腺嘌呤的产生机制和生物学功能已发表大量文献,然而核糖核酸上的另一种修饰5-甲基胞嘧啶长期以来研究较少。近年,围绕核糖核酸甲基化修饰调控生物发育和基因表达的研究是表观遗传的热点。 该研究利用基因组高通量测序方法发现了拟南芥信使核糖核酸上超过6000个5-甲基胞嘧啶修饰位点,分析发现修饰主要富集在基因的编码区,尤其在起始密码子下游和终止密码子前。该研究进一步利用液质联用质谱和点杂交技术发现在拟南芥各个组织和不同的发育时期5-甲基胞嘧修饰具有动态变化,显示了核糖核酸甲基化调控的多样性。研究团队还发现一个转运核糖核酸甲基转移酶具有信使核糖核酸甲基化转移活性的活性,通过影响根发育相关基因5-甲基胞嘧啶的修饰,影响其信使核糖核酸的稳定性来实现对基因的调控。 该研究得到了国家“青年相关人才计划”项目、中国农科院科技创新工程等项目的资助,生物所为第一作者单位,谷晓峰研究员和俞晧教授为通讯作者。