人类布鲁氏菌病病例在非流行国家很少见，如德国，那里的感染主要是由梅利氏布鲁氏菌引起的。德国牛、猪、羊和山羊布鲁氏菌病国家参考实验室收到一名患者的疑似布鲁氏菌分离物，以供鉴定。细菌学检测和基于pcr的诊断显示该分离物为猪双歧杆菌，但在生物多样性方面没有得出一致的结果。采用全基因组测序和随后的基因分型对分离株进行详细表征，并阐明诊断性PCR未能正确鉴定生物变异的原因。发现分离株为猪布鲁氏菌5型，一种罕见的生物变种，地理分布有限，主要分布在北高加索地区。由于诊断PCR的其中一个靶区缺失，无法正确分型分离株。基于计算机基因分型，可以排除分离株与一种猪芽孢杆菌相同的5个参考菌株。在这里，我们报告了一例罕见的猪布鲁氏菌5型。此外，通过报告这一发现，我们希望让从业者意识到对PCR结果的可能误解，因为不能排除检测到的缺失在猪芽孢杆菌中很常见群落—猪布鲁氏菌5型，目前缺乏现场隔离株。
