2023年12月13日，哈佛大学等机构的研究人员在Nature杂志在线发表了题为Slide-tags enables single-nucleus barcoding for multimodal spatial genomics的文章。
最近的技术创新使个体细胞内基因表达和表观遗传调控的高通量定量成为可能，改变了我们对复杂组织如何构建的理解。然而，这些测量缺少常规和容易定位这些轮廓细胞的能力。
该研究开发了一种策略，滑动标签，其中完整组织切片内的单个细胞核被标记为空间条形码寡核苷酸，这些核苷酸来自已知位置的DNA条形码珠。然后，这些标记的细胞核可以用作各种各样的单核分析分析的输入。将滑动标签应用于小鼠海马定位核，其空间分辨率小于10 μ m，并提供与普通单核RNA测序数据在质量上难以区分的全转录组数据。
为了证明滑动标签可以应用于各种各样的人体组织，研究人员对大脑、扁桃体和黑色素瘤进行了分析。研究人员揭示了细胞类型特异性的空间变化基因表达在皮质层和空间背景化受体-配体相互作用驱动B细胞成熟在淋巴组织。滑动标签的一个主要优点是它很容易适应几乎任何单细胞测量技术。作为原理证明，研究人员对来自转移性黑色素瘤的相同细胞中的开放染色质，RNA和T细胞受体(TCR)序列进行了多组学测量，确定了在空间不同的微环境中驱动癌细胞状态转变的转录因子基序。滑动标签提供了一个通用的平台，可以将已建立的单细胞测量纲要导入到空间基因组学曲目中。
