《运动中相对能量缺乏小鼠模型的多器官转录组图谱》

  • 编译者: 黄雅兰
  • 发布时间:2024-09-29
  • 能量摄入不足以满足身体活动的能量消耗需求会导致全身神经内分泌和代谢异常,表现为活动依赖性厌食症和运动中的相对能量缺乏(red)。red影响超过40%的运动员,然而缺乏潜在的分子变化一直是更好地了解red及其治疗的障碍。为了评估对能量缺乏反应的分子变化,我们实施了“运动换食物”的范式,其中食物奖励的大小由转轮运动决定。通过使用这种范式,我们在高体力活动并逐渐减少食物摄入的雌性和雄性小鼠中复制了red的几个方面,这导致体重减轻,骨骼健康受损,器官特异性质量变化,以及静息-活动模式改变。通过整合19个不同器官的转录组,我们提供了一个全面的数据集,这将指导未来对red的理解,并可能为代谢健康和(运动)表现提供重要的意义。
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    • 编译者:李康音
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    • 2023年9月27日,MIT化学系、Broad 研究所的王潇研究组在Nature上发表了题为Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution的文章。研究人员采用原位测序技术STARmap PLUS,以194 X 194 X 345 nm3体素尺寸在亚细胞分辨率水平上对成年小鼠全脑和脊髓中17个冠状切面和3个矢状切面组织切片中的1,022个基因进行了检测,使用细胞分割算法ClusterMap得到了109万个高质量空间分辨单细胞基因表达。通过大规模的单细胞分析注释,用空间基因表达定义了更精细的组织区域。 这项工作为理解小鼠中枢神经系统提供了一个大规模的分子空间图谱,囊括了超过一百万个细胞,以及他们的基因表达特征、空间坐标、分子细胞类型、分子组织区域类型,以及遗传操作可及性。这项工作为建立分子空间图谱提供了实验和计算的框架,涵盖了从单个RNA分子到单细胞再到器官组织区域的跨越多个空间尺度的分析,为神经科学研究提供了重要的数据和工具。作者们已将这套图谱开放共享(http://brain.spatial-atlas.net/),供研究者探索。 本文内容转载自“BioArt”微信公众号。 原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/u5Q6AL3JL83XDEiLJjKKuQ
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    • 编译者:李康音
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    • 2023年9月14日, 景乃禾团队与澳大利亚悉尼大学Patrick Tam 教授在Nature Communications在线发表了最新合作研究成果 Time Space and Single-Cell Resolved Tissue Lineage Trajectories and Laterality of Body Plan at Gastrulation。 该研究通过开发单细胞转录组空间重构算法(MDSC mapping),实现了单细胞转录组数据的有参空间重构;通过整合高时间精度的胚胎空间转录组数据和MDSC mapping算法,构建了胚层发生过程中连续时间系列的真实单细胞三维空间转录组图谱;通过分析单细胞空间图谱中不同空间位置的单细胞组成,解析了小鼠原肠胚中单细胞分布的空间异质性;基于单细胞空间异质性的分布这一新线索,发现了早于经典发育学认知的胚胎左-右体轴建立的潜在新起点;结合多种遗传学小鼠模型及胚胎体外培养系统,揭示了BMP信号在胚胎左-右体轴建立起始阶段的重要作用。这项工作,为理解胚层谱系建立规律、胚胎空间模式建成的调控机制等提供了大量翔实的数据和崭新的思路,为哺乳动物体轴极性的建立机制提供了新的见解,极大推动了胚胎发育及干细胞转化研究领域的发展。 本文内容转载自“BioArt”微信公众号。原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/CW6IqNLYbgeaqHvRqF-hLg