《国际专家小组对在COVID-19暴发期间筛查粪便微生物群供体紧急更新的建议》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-03-27
  • 3月16日,The Lancet Gastroenterology & Hepatology期刊在线发表了意大利天主教圣心大学等机构研究团队的题为“Screening of faecal microbiota transplant donors during the COVID-19 outbreak: suggestions for urgent updates from an international expert panel”的文章,指出鉴于全球发生COVID-19疫情,该研究团队作为粪便微生物菌群移植和粪便库的国际专家小组认为,迫切需要(至少暂时)更新粪便供体筛查的建议。该文章认为,有证据表明,SARS-CoV-2可以在粪便中发现,并且即使在呼吸道中不再可检测到,粪便样本仍可以对该病毒保持阳性,这表明可能存在粪口传播途径,且在COVID-19感染的某些患者中存在的胃肠道症状支持了这一猜想。
    该文章指出,粪便微生物群的移植在世界范围内的分类和管理方式不同的差异导致了一个令人困惑的局面,在这种情况下,一些国家将对人类细胞、组织或基于细胞或组织的产品遵守一定的规则,而另一些国家则不会,这可能会导致感染的传播。自制粪便微生物群移植的不受控是一个更令人担忧的问题,这样的担忧在那些想要尝试粪便菌群移植疗法的患者中普遍存在。
    该文章指出,为了防止SARS-CoV-2传播,建议在当前的捐赠者筛查措施中增加一些内容,在所有国家/地区,医生在每次捐赠之前都应筛查两个主要项目:在过去30天内是否存在典型的COVID-19症状(包括发烧、疲劳、干咳、肌痛、呼吸困难和头痛);以及捐赠者在过去30天内到已知受COVID-19感染地区旅行史或与已证实或怀疑感染的个体密切接触。如果这些项目中的任何一个为阳性,则应拒绝潜在的供体,或通过SARS-CoV-2的RT-PCR分析进行测试。在流行国家中,即使所有捐赠者无症状或没有高风险旅行或接触史,也应考虑对所有捐赠者进行RT-PCR分析。或者,使用前,应将捐赠者粪便储存并隔离30天,并且只有在捐赠者未出现症状时才接触。最后,根据当地的流行病学,粪便库应在使用冷冻粪便之前回顾性检查供体的健康状况,以避免SARS-CoV-2进一步传播。

  • 原文来源:https://www.thelancet.com/journals/langas/article/PIIS2468-1253(20)30082-0/fulltext
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    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-03-18
    • 1.时间:2020年3月16日 2.机构或团队:意大利天主教圣心大学、英国伦敦帝国理工学院、美国布朗大学等 3.事件概要: 3月16日,The Lancet Gastroenterology & Hepatology期刊在线发表了意大利天主教圣心大学等机构研究团队的题为“Screening of faecal microbiota transplant donors during the COVID-19 outbreak: suggestions for urgent updates from an international expert panel”的文章,指出鉴于全球发生COVID-19疫情,该研究团队作为粪便微生物菌群移植和粪便库的国际专家小组认为,迫切需要(至少暂时)更新粪便供体筛查的建议。该文章认为,有证据表明,SARS-CoV-2可以在粪便中发现,并且即使在呼吸道中不再可检测到,粪便样本仍可以对该病毒保持阳性,这表明可能存在粪口传播途径,且在COVID-19感染的某些患者中存在的胃肠道症状支持了这一猜想。 该文章指出,粪便微生物群的移植在世界范围内的分类和管理方式不同的差异导致了一个令人困惑的局面,在这种情况下,一些国家将对人类细胞、组织或基于细胞或组织的产品遵守一定的规则,而另一些国家则不会,这可能会导致感染的传播。自制粪便微生物群移植的不受控是一个更令人担忧的问题,这样的担忧在那些想要尝试粪便菌群移植疗法的患者中普遍存在。 该文章指出,为了防止SARS-CoV-2传播,建议在当前的捐赠者筛查措施中增加一些内容,在所有国家/地区,医生在每次捐赠之前都应筛查两个主要项目:在过去30天内是否存在典型的COVID-19症状(包括发烧、疲劳、干咳、肌痛、呼吸困难和头痛);以及捐赠者在过去30天内到已知受COVID-19感染地区旅行史或与已证实或怀疑感染的个体密切接触。如果这些项目中的任何一个为阳性,则应拒绝潜在的供体,或通过SARS-CoV-2的RT-PCR分析进行检测。在流行国家中,即使所有捐赠者无症状或没有高风险旅行或接触史,也应考虑对所有捐赠者进行RT-PCR分析。或者,使用前,应将捐赠者粪便储存并隔离30天,并且只有在捐赠者未出现症状时才考虑使用。最后,根据当地的流行病学,粪便库应在使用冷冻粪便之前回顾性检查供体的健康状况,以避免SARS-CoV-2进一步传播。 4.附件: 原文链接https://www.thelancet.com/journals/langas/article/PIIS2468-1253(20)30082-0/fulltext
  • 《Nature Communications:粪便微生物群组成和微生物群衍生代谢物浓度可以预测COVID-19患者的呼吸功能和死亡轨迹》

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    • 发布时间:2022-12-02
    • 2022年11月,美国研究肠道微生物组和相关代谢物对COVID-19的影响。研究人员前瞻性地招募了71名COVID-19相关危重病患者,在入院后3天内收集粪便样本,通过霰弹枪宏基因组测序(利用对一个群落中几类细胞的DNA进行遗传分析以了解生物的存在及其生理学)确定微生物组组成,并量化微生物群衍生的代谢物(NCT#04552834)。71名患者中,39人存活,32人死亡。死亡率与粪便微生物群中变形杆菌数量呈正相关,与粪便次级胆汁酸和脱氨基酪氨酸(DAT)浓度呈负相关。用于解释粪便次级胆汁酸和脱氨基酪氨酸浓度的微生物组代谢谱(MMP),与导致机械通气的呼吸衰竭进展独立相关。研究表明,粪便微生物群组成和微生物群衍生代谢物浓度可以预测COVID-19患者的呼吸功能和死亡轨迹,并表明肠肺轴在COVID-19恢复中起着重要作用。