《SARS-CoV-2 BA.2.86亚型的进化和中和逃逸》

  • 来源专题:新发突发传染病
  • 编译者: 张玢
  • 发布时间:2023-09-12
  • Omicron BA.2.86亚型不同于Omicron BA.2以及最近流行的变种,仅在刺突蛋白上就有30多个突变。在这里报告了从南非收集的诊断拭子中首次分离到活的BA.2.86亚型,测试了该亚型在细胞培养中对中和抗体的逃逸和病毒复制特性。BA.2.86与Omicron XBB.1.5相比,无论是单独感染还是作为突破性感染,BA.2.86对Omicron BA.1-XBB亚型的中和免疫逃逸能力并不比Omicron XBB.1.5高。中和逃逸相对较早的毒株:BA.2.86表现出广泛的逃逸,既相对于奥米克龙接种前个体的血清中的祖先病毒,也相对于奥米克龙BA.1感染者的血清中的奥米克隆BA.1。没有观察到细胞培养中的病毒特性与XBB.1.5有实质性的差异。BA.2.86和XBB.1.5产生的感染灶大小相似,细胞病变效应相似(均低于SARS-CoV-2),复制动力学相似。还研究了BA.2.86与BA.2序列的关系,发现最接近的是2022年初流通的南部非洲的BA.2样本。这些观察表明,BA.2.86与来自南部非洲的序列比其他地区更接近,因此可能是在那里进化的,这种进化导致了在规模上类似于最近流行的SARS-CoV-2毒株的中和抗体的逃逸。
  • 原文来源:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.08.23295250v1
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    • 新出现的SARS-CoV-2盐化变种BA.2.86引起了全球关注。截至2023年9月8日,共检测到95个序列,其中早期序列来自多个国家,与流行病学无关,并且在没有旅行史的个体中发现,表明存在潜在的国际传播。2023年8月18日,世卫组织将该变异株指定为正在监测的变异株,因为它携带许多突变。BA.2.86 包含许多与当前流行的菌株明显偏离的突变,与 BA.2 相比有 33 个尖峰突变和 14 个受体结合域 (RBD) 突变,与 XBB.1.5 相比有 35 个尖峰突变和 12 个 RBD 突变(附录 1 p 7)。随着与XBB.1.5(T19I,24_26del,A27S,G142D,144del,G339H,G446S,N460K和F486P)的共同突变,BA.2.86的RBD上的其他突变I332V,K356T,V445H,N450D,N481K,A484K和483del可能会增强先前报道的免疫逃逸.1,2N末端结构域上的许多不寻常突变,例如R21T,S50L,69_70del, V127F、F157S、R158G、211del、L212I、L216F、H245N 和 A264D 也可能改变 BA.2.86 的抗原性。这些发现强调了BA.2.86在全球传播的潜力。因此,迫切需要对BA.2.86的抗原性和感染性进行实验评估。
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    • 2024年1月8日,俄亥俄州立大学刘善虑教授团队在Cell杂志上发表了题为Immune Evasion, Infectivity, and Fusogenicity of SARS-CoV-2 BA.2.86 and FLip Variants的研究论文。 最近备受科学家关注的是一种叫做JN.1 的SARS-CoV-2 新亚型,其进化来自于Omicron BA.2.86。BA.2.86毒株于 2023 年 7 月下旬在以色列和丹麦被首次发现,当时已经蔓延到全球各地,包括中国。相对于初始的Omicron亚型BA.2而言,BA.2.86有超过30个突变;而对照从年初到9月份占主流的XBB.1.5,也有35个突变。所以,人们担心一个比Omicron更能免疫逃避的毒株可能会使全球再次陷入2022年初的新冠全球爆发流行时期, 但庆幸的是,这种担心没有发生。为什么?研究 BA.2.86的生物学特性和免疫逃逸特性意义重大。 该研究发现新近出现的Omicron变异株BA.2.86 和FLip在生物学和免疫逃避上有很大的区别。与 FLip 和其他 XBB 突变体相比,BA.2.86 的免疫逃避程度较低,与抗原距离结果一致:BA.2.86 在抗原性上与早期 Omicron 变体 BA.1、BA.2 和 BA.4/5 更为相似,而与 FLip 明显不同。重要也需要警惕的是,BA.2.86在人肺上皮传代细胞系的感染性和膜融合性比目前已知的Omicron都高。但是,这是否预示着新毒株在嗜肺性和毒力上增强,还有待于进一步研究。