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《基因组分析可以为SARS-CoV-2疫苗的研发提供信息 》

  • 来源专题：新药创制
  • 编译者： 杜慧
  • 发布时间：2021-04-30

  • 随着人们对COVID-19突变株及其对COVID-19疫苗保护效果的影响的关注日益增长，研究人员提出了一种方法来检查接种COVID-19疫苗的人中SARS-COV-2感染的情况。

    来自沃尔特·里德陆军研究所美国军事HIV研究计划病毒遗传学负责人Morgane Rolland博士等人的相关结果发表在《Plos Pathogen》杂志上。COVID-19疫苗的临床试验中，接受该疫苗的一些试验志愿者也遇到了突变体感染的情况，通过比较感染接种疫苗人群的病毒与感染安慰剂组的病毒基因特征，可以帮助查明哪些突变体正在逃避疫苗诱导的免疫反应，并为改进COVID-19疫苗提供了依据。

    筛分分析使科学家能够了解病毒的进化模式，这将是推断SARS-CoV-2如何适应广泛使用的疫苗并预测病毒进化最终如何影响疫苗功效的关键。作者指出，SARS-CoV-2的突变相对较慢，这意味着目前的疫苗不太可能很快被淘汰，但我们仍需提高警惕。

  • 原文来源：https://medicalxpress.com/news/2021-03-genomic-sieve-analysis-sars-cov-vaccine.html
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  • 《3月25日_基因组筛分析可为SARS-CoV-2疫苗研发提供依据》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-03-29
    • Eurekalert!网站3月25日消息称，人们对COVID-19变体及其对COVID-19疫苗防护效果的影响越来越关注，研究人员提出了一种方法，用于研究接种过COVID-19疫苗但仍感染了SARS-COV-2的情况。在COVID疫苗试验中，对这些SARS-CoV-2感染进行基因组筛分析是识别与疫苗失败相关的病毒突变并预测疫苗接种如何影响病毒进化的关键工具。该研究被发表在PLOS Pathogens上。 沃尔特里德陆军研究所的病毒遗传学博士Morgane Rolland表示，没有一种疫苗是100％有效的，尽管这些疫苗被证明是高效的且正在被推广，但是一些接种过疫苗的试验志愿者仍然被感染。筛分分析将接种过疫苗的人感染的病毒与安慰剂组志愿者感染的病毒进行了比较，以帮助查明哪些变体正在逃避疫苗诱导的免疫反应，并为改进COVID-19疫苗提供了依据。研究人员解释称，把疫苗想象为筛子，将不同的变异体作为“卵石”注入筛子中：疫苗将阻止某些变异体，但允许其他变异体通过，并且筛分分析可了解哪些变异体可以通过。 筛分分析使科学家能够识别进化模式，这将是推断SARS-CoV-2如何适应广泛使用的疫苗并预测病毒进化最终如何影响疫苗功效的关键。研究人员指出，SARS-CoV-2的突变相对较慢，这意味着目前的疫苗不太可能很快被淘汰，但在大多数人接种疫苗之前的几个月里，需要提高警惕，以阻止有关变体的传播。过去两个月出现的变体凸显了对下一代疫苗的需求。对通过疫苗试验获得的样本进行筛分分析是确定未来应如何设计疫苗的有效方法。 原文链接：https://www.eurekalert.org/pub_releases/2021-03/tumh-gsa032521.php
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  • 《美国FDA等对SARS-CoV-2基因组的序列分析揭示对疫苗设计重要的特征》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-04-14
    • bioRxiv预印平台于3月31日发布了美国食品药品监督管理局等的文章“Sequence analysis of SARS-CoV-2 genome reveals features important for vaccine design”。文章指出，随着SARS-CoV-2大流行的迅速发展，开发有效疫苗的需求至关重要。疫苗开发的一种有前途的方法是通过密码子对去优化来产生减毒病毒。这种方法的优势在于，除了其基因组序列外，它仅需要特定于所讨论病毒的有限知识。因此，这种方法非常适合可能没有大量数据的新兴病毒。研究人员通过计算机对SARS-CoV-2基因组序列与与冠状病毒科的其他病毒相比的几个特征（例如，密码子使用、密码子对使用、二核苷酸/连接二核苷酸使用，移码区域周围的RNA结构），整个人类基因组以及受到该病毒攻击的主要的特定人类组织（例如肺）的转录组进行了分析。研究人员称其分析确定了刺突蛋白（S）和核衣壳蛋白（N）是去优化的有希望的靶标，揭示了SARS-CoV-2疫苗开发的路线图，该路线图可以推广到其它病毒。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
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