便携DNA测序精确度再升级
2021年1月11日Nature Methods报道，丹麦奥尔堡大学等研究人员通过使用特殊的分子标签，可以极大地消除便携式DNA测序仪产生的绝大部分测序错误，使实验室外基因检测提供更多可靠的基因信息。
基因组序列蕴含着有机体的很多信息，可用于研究特定微生物，以及开发诊断工具和治疗方法。缺少精确便携式DNA测序仪，使野外或小型实验室研究遗漏了许多重要基因细节。牛津纳米孔技术公司的MinION将DNA测序从大型实验室中解放出来，但其较的开箱即用错误率（5%-15%），使其使用非常受限。
对此，研究者开发了一个独特的条形码系统，将类似MinION这样的长读长DNA测序平台的精确度提高1000倍以上。在用条形码标记目标分子后，研究人员照常进行标准PCR技术扩增或复制标记的分子，并对得到的DNA进行测序。然后，研究人员使用条形码轻松识别和分组测序数据中的相关DNA片段，在相同时间以高正确率处理比传统方法长10倍的序列片段，更长的DNA长度允许检测细微的遗传变异和高分辨率的基因组组装。
研究者已经通过开放源代码库提供了处理测序数据的代码和协议，使其在任何领域都可以使用。研究者正在开发扩展方法，可以对水源和废水中的微生物进行实时检测，这对于公共卫生管理是非常有用的。
吴晓燕 编译自https://www.sciencedaily.com/releases/2021/01/210112144811.htm
原文链接：https://www.nature.com/articles/s41592-020-01041-y
原文标题：High-accuracy long-read amplicon sequences using unique molecular identifiers with Nanopore or PacBio sequencing
