《中国科学院海洋研究所在胶州湾浮游植物生物多样性及其时空分布规律格局方面获新认知》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: liguiju
  • 发布时间:2022-05-05
  • 中国科学院海洋研究所陈楠生课题组通过对胶州湾海域开展长时间序列采样、高通量测序以及宏条形码分析,获得了对胶州湾浮游植物群落组成、时空分布规律和影响因素的新认知。这项成果4月25日在线发表在国际学术期刊Water research上。

    胶州湾位于山东半岛南部和黄海西岸,是一个受自然变化与人类活动双重影响极为显著的典型半封闭海湾,也是我国近海生态系统的缩影,为研究我国海域浮游植物群落(特别是有害藻华物种)组成和动态变化的创造了条件。迄今关于胶州湾浮游植物群落已有较多研究。然而,由于前期研究主要采用基于形态学特征进行鉴定,很多细胞尺寸小、形态特征不显著和固定后形态不稳定的浮游植物往往得不到有效研究。基于分子标记的宏条形码技术在有害藻华物种的监测和研究中显示出巨大潜力。

    经过对胶州湾2019年全年逐月样本的采集和基于扩增子序列变异(ASVs)的高分辨率宏条形码系统分析(DADA2),发现了远远高于历史认知的浮游植物生物多样性。此外,该研究发现浮游植物群落相比对空间分布,呈现出显著时间(季节)动态变化,不同浮游植物展示出强烈的季节偏好性。分析表明,影响浮游植物群落的时空动态分布受多种环境因子(特别是温度)的影响。除此之外,浮游植物与其他物种的互作和浮游植物特有的生活史(比如形成休眠孢囊)对浮游植物群落时间偏好性影响较大。浮游植物与其他浮游生物之间的相关性大多为正相关,表明共同进化在海洋生态环境中至关重要。值得关注的是,同属物种(比如玛氏骨条藻和热带骨条藻)呈现出几乎相反的互补分布方式,表明浮游植物在进化过程中形成了不同适应机制,导致时间偏好方面的互补。研究还发现随机因素对浮游植物分布影响贡献较小。长时间的进化过程决定了海洋生态环境中的不同浮游植物逐步演化,形成了独特的生理生化特征,获得对特异性生境的适应,最终达到生态和谐(ecological harmony)。

    文章第一作者是中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室特别研究助理刘淑雅博士,通讯作者是陈楠生研究员。博士后崔宗梅博士和山东胶州湾海洋生态系统国家野外科学观测研究站赵永芳工程师为该论文的共同作者。相关研究得到了中国科学院战略性先导科技专项和自然科学基金委青年科学基金项目等项目资助。

    相关文章及链接:

    Liu S, Cui Z, Zhao Y, Chen N. Composition and spatial-temporal dynamics of phytoplankton community shaped by environmental selection and interactions in the Jiaozhou Bay. Water Research. 2022. https://doi.org/10.1016/j.watres.2022.118488

    刘淑雅,陈楠生.胶州湾海域浮游植物和赤潮物种的生物多样性研究进展. 海洋科学,2021,45(04):170-188. http://qdhys.ijournal.cn/html/hykx/2021/4/20210418.html

    Liu S, Gibson K, Cui Z, Chen Y, Sun X, Chen N. Metabarcoding analysis of harmful algal species in Jiaozhou Bay. Harmful Algae. 2020.92:101772. https://doi.org/10.1016/j.hal.2020.101772

    Liu S, Zhang M, Zhao Y, Chen N. Biodiversity and Spatial-Temporal Dynamics of Margalefidinium Species in Jiaozhou Bay, China. International Journal of Environmental Research and Public Health. 2021.18: 11637. https://doi.org/10.3390/ijerph182111637

  • 原文来源:http://www.qdio.cas.cn/2019Ver/News/kyjz/202204/t20220426_6439129.html
相关报告
  • 《中国科学院海洋研究所在胶州湾海链藻属物种多样性及时空动态分布特征方面获得新进展》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2024-01-28
    • 中国科学院海洋研究所陈楠生课题组通过对胶州湾海域开展全年逐月的时间序列采样、高通量测序以及宏条形码分析,首次开展了胶州湾海链藻属多样性、物种组成以及时空动态分布特征的研究,并探讨了该海域海链藻时空动态分布的驱动因子,获得了新进展。研究成果以题为“Rich diversity and active spatial-temporal dynamics of Thalassiosira species revealed by time-series metabarcoding analysis”的研究论文在Nature旗下期刊ISME Communications发表。博士研究生刘奎艳和特别研究助理刘淑雅博士为论文共同第一作者,陈楠生研究员为通讯作者。 海链藻属(Thalassiosira)是硅藻门中物种最丰富的属之一,目前包括199个物种(179个接受的物种,19个接受的变种和1个接受的forma种),是浮游植物群落的重要组成部分,对海洋初级生产力有积极贡献。多个海链藻物种是有害藻华(Harmful algal bloom, HAB)暴发的原因种,对海洋生态系统和水产养殖造成了负面影响。尽管基于形态的分类学研究已经鉴定了大量的海链藻物种,但是由于该方法的分辨率不足,目前海链藻物种在海洋生态系统中的组成及地理分布情况尚不清楚。 胶州湾是中国黄海的半封闭式滨海海湾,作为滨海生态系统的模型缩影,对浮游植物动态分布进行了长期同步研究,为了解中国整个近海生态系统的结构、功能和趋势提供了有价值的数据集。在胶州湾海域已经有27种(包括1个变种)海链藻物种被鉴定到,除小字海链藻T. minuscula外,几乎所有的海链藻HAB物种均已鉴定,表明胶州湾是研究海链藻 HAB的理想模式海域。前期在胶州湾单次调查采集的浮游植物样本宏条形码分析中,鉴定出胶州湾以前未报道的海藻属物种,表明宏条形码分析在海藻属物种鉴定的优势,并表明该海域存在更多的海藻属物种还未检测。本文推测,通过对胶州湾开展高频次采样,利用宏条形码分析可以更好地揭示胶州湾海链藻属多样性、物种组成以及时空动态分布特征。 本研究以宏条形码分析为手段,系统分析了胶州湾模式海洋生态系统海链藻的组成和时空动态分布。通过对2019年每月从12个采样点采集的样本进行分析,鉴定出14个海链藻属物种,其中5个物种未在胶州湾历史航次得以鉴定,证明了宏条形码分析在生态学研究中的分辨率和有效性。另外,本研究还发现胶州湾海链藻属多个物种表现出显著的时间偏好,其中以柔弱海链藻T. tenera为代表的部分种表现为春冬季偏好,以伦德海链藻T. lundiana和小字海链藻T. minuscula为代表的部分种表现为夏秋偏好,表明温度是影响胶州湾海链藻物种的重要驱动因子。随着更多海链藻物种参考序列的解析和参考序列数据库的完善,宏条形码分析方法可以更加准确、有效地应用于海洋生态系统的生态学研究。 该研究得到国家自然科学基金项目,中国科学院战略性先导科技专项、青岛创业创新领军人才计划项目以及加拿大自然科学与工程研究委员会项目的联合资助。 论文信息:Kuiyan Liu, Shuya Liu, Zongmei Cui, Yongfang Zhao, Nansheng Chen. Rich diversity and active spatial–temporal dynamics of Thalassiosira species revealed by time-series metabarcoding analysis. ISME Communications, 2024, ycad009, https://doi.org/10.1093/ismeco/ycad009 论文链接:https://academic.oup.com/ismecommun/advance-article/doi/10.1093/ismeco/ycad009/7513314
  • 《宏条形码方法揭示胶州湾海域角毛藻物种多样性及其时空动态分布》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2023-08-20
    • 中国科学院海洋研究所陈楠生课题组通过对胶州湾海域开展长时间序列采样、高通量测序以及宏条形码分析,获得了对胶州湾角毛藻物种组成、时空分布规律的认识,研究成果近日在学术期刊Environmental DNA 在线发表。 角毛藻属(Chaetoceros Ehrenberg, 1844)是海洋浮游植物中物种最丰富的硅藻属之一,广泛分布于全球近岸海域,是近岸海域生态系统中的优势种类,在海洋初级生产力和海洋地球化学循环中发挥重要作用。尽管科学家们对角毛藻物种的多样性进行了很多研究,但是绝大多数研究仅仅基于形态特征进行物种鉴定,具有局限性,导致很多形态相似、细胞较小的角毛藻物种尚未得到准确鉴定。基于分子标记的宏条形码技术在浮游植物的研究中显示出巨大潜力。 经过对胶州湾2019年全年逐月12个航次采集到的样本开展基于扩增子序列变异(ASVs)的高分辨率宏条形码系统分析(DADA2),发现了25个角毛藻物种,其中有10个角毛藻物种在胶州湾未报道过,包括细胞较小的Chaetoceros neogracilis和突尼斯角毛藻(Chaetoceros tenuissimus),显示出宏条形码分析方法的优势。其中本研究表明胶州湾多个常见角毛藻物种的鉴定需要修订,比如扁面角毛藻(Chaetoceros compressus)应该是与其形态相似的物种Chaetoceros contortus,冕孢角毛藻(Chaetoceros diadema)应该是与其形态特征相似的物种Chaetoceros rotosporus。比较12个航次的角毛藻相对丰度表明,大部分角毛藻物种表现出强烈的季节偏好性,并且不同角毛藻物种显示不同的季节偏好性,有些物种在冬春两季占优势,有些物种在夏秋两季占优势,显示出复杂的差异生态适应性。本研究为探索角毛藻的季节适应机制奠定了基础。 不仅如此,本研究分析得到的154个注释为角毛藻的ASVs中,超过一半的ASVs(82个ASVs)没有注释到已知角毛藻物种,代表尚未得到鉴定的角毛藻物种(Chaetoceros sp.),表明胶州湾角毛藻多样性被严重低估。因此,可以期待随着更全面的参考条形码数据集的建立,宏条形码分析方法可以更好的应用于角毛藻和其他属浮游植物物种的生态学研究。 中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室博士后崔宗梅和特别研究助理刘淑雅为论文共同第一作者,陈楠生研究员为文章通讯作者。徐青博士和山东胶州湾海洋生态系统国家野外科学观测研究站赵永芳工程师为论文共同作者。相关研究得到了中国科学院战略性先导科技专项和国家自然科学基金委面上基金等项目资助。 相关论文及链接: Zongmei Cui#, Shuya Liu#, Qing Xu, Yongfang Zhao, Nansheng Chen*. Differential ecological adaptation of diverse Chaetoceros species revealed by metabarcoding analysis. Environmental DNA. 2023. (Zongmei Cui and Shuya Liu contributed equally to this work; Nansheng Chen is the corresponding author). https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/edn3.455