《【科学私享】IF=23.7!内蒙农大孙志宏研究员团队解析益生菌对本地肠道微生物群的影响》

  • 来源专题:食品安全与健康
  • 编译者: 杨娇
  • 发布时间:2024-12-23
  • 2024年12月16日,内蒙古农业大学孙志宏团队在iMeta在线发表了题为“Short-term probiotic supplementation affects the diversity, genetics, growth, and interactions of the native gut microbiome”的文章。 第一作者:沈馨、靳昊;通讯作者:孙志宏(sunzhihong78@163.com);合作作者:赵飞燕、郭丽如、赵志鑫 主要单位:内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教yu部重点实验室,农村部奶制品加工重点实验室,内蒙古乳品生物技术与工程重点实验室。

    该研究使用高剂量益生菌Probio-M8对健康志愿者进行干预,发现益生菌的摄入可显著提高肠道微生物组的多样性,并影响本地肠道细菌的单核苷酸变异、生长速率和共丰度网络,突显了益生菌对肠道生态系统生态平衡的影响。为进一步探索益生菌介导的肠道微生物组调节机制奠定了基础,并强调了在设计和优化益生菌应用过程中纳入生态和进化观点的必要性。

  • 原文来源:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5Mzc4MTA4MQ==&mid=2247566670&idx=2&sn=d2d3bbc2ed9529af46538113d9888fa2&chksm=ed466c240c14576890602c948333962fe53cf58b9ad24eef2eb2da9100053c70d66d749702d1#rd
相关报告
  • 《刘宏伟研究团队发表肠道微生物群相关天然产物研究进展综述》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2023-04-20
    •  日前,微生物研究所刘宏伟研究团队受邀在Natural Product Reports发表综述文章,系统回顾了近年来天然产物活性分子、肠道微生物和宿主三者之间的研究进展,为天然产物药效和作用机制的研究提供了思路,并有助于阐明肠道微生物的功能和分子机制。   文章总结并提出了天然产物活性分子菌群互作机制研究的总体策略(图1)。团队通过动物模型或者人群队列研究,明确天然产物活性分子的表型。利用菌群移植、无菌小鼠等实验手段,证明中药天然药物活性分子的药理表型和肠道菌群之间的因果关系。采用多组学的策略,如微生物组测序分析、代谢组分析、转录组分析和蛋白组分析等手段,解析肠道菌群介导中药药效的作用机制,并且结合培养组学等手段获得直接参与介导作用的关键肠道细菌。通过遗传和宿主相互作用分析,解析了关键肠道细菌通过哪些信号通路来调控机体的平衡和稳态以控制疾病。  中国科学院微生物研究所项目研究员代焕琴博士和助理研究员韩俊杰博士为文章的共同第一作者,刘宏伟研究员为通讯作者。微生物研究所尹文兵研究员、陈义华研究员和博士生王涛参与了论文写作并提出了修改建议。本综述相关工作得到了科技部重点研发计划(2021YFA0717000)、国家自然科学基金委项目(22277135、22177131)和中国科学院战略性先导科技专项(B类)(XDB38020000)的资助。   全文链接:https://pubs.rsc.org/en /content/ articlelanding/2023/NP/D2NP00075J       
  • 《Nature Communications|微生物所王军研究组结合三代测序合作解析肠道菌群结构变异和功能》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-06-12
    • 近十年来,肠道微生物组已成为生命科学研究领域的热点,但目前大部分研究都集中在使用二代测序技术进行物种和功能的解析,宏基因组的拼接质量不高并且很难实现菌株水平的功能差异分析。 有鉴于此,中国科学院微生物研究所王军课题组和动物研究所宋默识课题组合作,建立了ONT三代测序和Illumina二代测序数据混合组装和后续分析流程。在mock community上的验证表明,三代和二代测序数据的混合组装从完整度、准确程度以及编码密度方面均比单纯二代或者三代测序组装更有优势。 该研究基于三代ONT序列,提高了宏基因组装的质量、SV的发现能力,发现了大量包括插入突变和基因倒位在内的结构变异对于菌株水平上基因功能的影响,以及噬菌体、CRISPR-spacer等系统的深度挖掘。这项研究是课题组利用三代Nanopore测序技术解析肠道病毒组(Cao et al., Medicine in Microecology, 2020, 4:100012; Cao et al. Gut Microbes, 2021, 13),近期发表的真菌组分析方法(Lu et al, Molecular Ecology, doi:10.1111/mec.16534)和靶向RNA检测病原微生物(Zhao et al., Advanced Science, 2021, 8, 2102593)之后,在利用三代Nanopore测序技术探索肠道微生物研究领域的新进展。这一发现,对未来更精细的精准医学领域的发展提供了理论启发。 中国科学院微生物研究所王军研究员、中国科学院动物研究所宋默识研究员为本文的共同通讯作者。中国微生物研究所助理研究员陈亮、赵娜、博士生曹佳宝、硕士研究生刘小林、助理研究员徐嘉悦为该论文的共同第一作者。该研究得到了国家重点研发计划项目、国家自然科学基金项目、中国科学院战略性先导科技专项、北京市自然科学基金项目等多项资金的资助。 文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-022-30857-9