Science Advances于2月3日发表了美国加利福尼亚大学和加利福尼亚大学旧金山分校等的文章“A diagnostic host response biosignature for COVID-19 from RNA profiling of nasal swabs and blood”,文章描述了鼻拭子和血液中RNA谱分析获得COVID-19的诊断性宿主反应生物信号。
文章称,该研究使用RNA测序分析了333例COVID-19患者和对照组的286份鼻咽(NP)拭子和53份全血(WB)样品。总体而言,相对于其他感染(流行性感冒、其他季节性冠状病毒和细菌性败血症),COVID-19患者的免疫反应较弱,同时几个关键的差异表达基因下调。住院患者和门诊患者表现出干扰素相关通路的上调,在临床病情更严重的住院患者中观察到了更强烈的炎症反应。当使用独立测试集进行基准测试时,由完整(>1000个基因)、中等(<100个)和小型(<20个)基因生物标志物面板组成的基于机器学习的两层宿主分类器以85.1-86.5%的准确率识别COVID-19疾病。SARS-CoV-2感染在NP拭子和WB之间有不同的生物特征,可用于COVID-19诊断。
来源:https://advances.sciencemag.org/content/7/6/eabe5984