《2月3日_SARS-CoV-2感染在鼻拭子和血液中有不同的生物特征》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2021-02-25
  • Science Advances于2月3日发表了美国加利福尼亚大学和加利福尼亚大学旧金山分校等的文章“A diagnostic host response biosignature for COVID-19 from RNA profiling of nasal swabs and blood”,文章描述了鼻拭子和血液中RNA谱分析获得COVID-19的诊断性宿主反应生物信号。
    文章称,该研究使用RNA测序分析了333例COVID-19患者和对照组的286份鼻咽(NP)拭子和53份全血(WB)样品。总体而言,相对于其他感染(流行性感冒、其他季节性冠状病毒和细菌性败血症),COVID-19患者的免疫反应较弱,同时几个关键的差异表达基因下调。住院患者和门诊患者表现出干扰素相关通路的上调,在临床病情更严重的住院患者中观察到了更强烈的炎症反应。当使用独立测试集进行基准测试时,由完整(>1000个基因)、中等(<100个)和小型(<20个)基因生物标志物面板组成的基于机器学习的两层宿主分类器以85.1-86.5%的准确率识别COVID-19疾病。SARS-CoV-2感染在NP拭子和WB之间有不同的生物特征,可用于COVID-19诊断。
    来源:https://advances.sciencemag.org/content/7/6/eabe5984

  • 原文来源:https://advances.sciencemag.org/content/7/6/eabe5984
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    • 编译者:xuwenwhlib
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    • 信息名称:SARS-CoV-2人对人传播的证据和特征 1.时间:2020年2月17日 2.机构或团队:广东省疾病预防控制中心,广东省公共卫生研究所,深圳市疾病预防控制中心,珠海市疾病预防控制中心,深圳南山疾病预防控制中心 3.事件概要: 科研人员在medRxiv预印版平台发表论文“Evidence and characteristics of human-to-human transmission of SARS-CoV-2”,探讨了SARS-CoV-2人对人传播的证据和特征。 研究背景:2019年12月31日,武汉报道了人类暴发COVID-19的事件,然后迅速传播到中国其他省份,科研人员分析了实地调查和基因测序的数据,以描述广东省人传人的证据和特征。研究方法:通过实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)或基因测序检测咽喉拭子、鼻拭子、支气管肺泡灌洗液(BALF)或气管内抽吸物中SARS-CoV-2阳性的疑似病例,确定为COVID-19确诊病例。对每例确诊病例进行了实地调查,从病历中收集确诊病例的临床和人口统计学数据,通过采访获得暴露和旅行史。研究结果:截至2020年2月10日,中国广东省共确诊1,151例确诊病例,其中697例(60.1%)中有234例聚集性感染,214例(18.6%)为继发病例,144例来自家族聚集性感染。随着流行的继续,尽管家族聚集性感染占主导地位,但社区聚集感染也在随着医院聚集性发病而增加。与2019年12月在武汉发现的SARS-CoV-2相比,同一家族聚集感染的整个基因组是相同的,并且呈现出一些独特的单核苷酸变体(SNV)。文章得出结论:科研人员在中国广东省观察到了SARS-CoV-2的明显人际传播,尽管它们大多数来自家庭聚集性感染,但社区与医院的感染正在增加,广东省人与人之间的传播风险正在从家庭转移到社区。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用. 4.附件: 原文链接: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.03.20019141v3.full.pdf
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    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
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    • 得克萨斯生物医学研究所(Texas Biomed)和西南国家灵长类动物研究中心(SNPRC)的科学家在《Nature Microbiology》杂志上发表了有关SARS-CoV-2全面动物模型研究的发现。这些发现最初于2020年6月在线发布在BioRxiv上。该研究评估了三种非人类灵长类(NHP)物种(印度恒河猴,非洲狒狒和新世界起源的普通marmosets),以确定对SARS-CoV-2的易感性与COVID-19疾病的发展。在研究过程中,猕猴和狒狒作为COVID-19疾病研究的动物模型显示了巨大的希望。基于结果,研究人员建议使用猕猴作为模型来开发疫苗,而狒狒则表现出更大的疾病发展趋势,使其成为评估抗病毒疗法和合并症的潜在选择,例如了解COVID之间的联系-19和糖尿病或COVID-19和心脏病。 “ Texas Biomed独特的研究模型的优势在于,其专业知识可以在一个校园内以动物,生物安全和法规方面的能力支持个人科学研究和合同研究,从而帮助从基础发现到临床前开发再到人类临床试验的广泛研究。” Texas Biomed研究副总裁Joanne Turner博士解释说。 用于传染病的动物模型(例如COVID-19)使全世界的科学家能够确定当前正在开发的候选疫苗和抗病毒治疗剂是否可以作为人类干预手段可行。此外,动物模型使科学家能够了解免疫系统受损的人的疾病进展,以协助开发针对这些人的治疗方法。 西南国家灵长类动物研究中心主任Deepak Kaushal博士说:“找到适合COVID-19的动物模型可以立即进行这些关键发现,这是抵抗这种疾病的重要一步。如果没有详尽的动物数据,FDA就不太可能许可将疫苗或抗病毒疗法用于人类使用,即使是目前正在进行人体试验的动物,因为动物模型数据可以确保我们对这种疾病以及人类的反应有完整的了解。进行潜在的治疗。” 由43名研究人员组成的小组报告了这三种NHP中SARS-CoV-2感染/ COVID-19疾病期间的临床,病毒,影像学,免疫学和组织病理学(组织检查)发现。该研究最终发现,非人类灵长类动物显示出与人类相似的SARS-CoV-2感染进展,有些感染者比其他感染者病得更重,上下呼吸道中都有病毒征象和肺炎征象。 Kaushal博士解释说:“我们的结果告诉我们,随着我们更深入地了解疾病,用于人类试验的疗法和疫苗的靶标,这些动物模型将提供相关的,可量化的信息。” 虽然先前的动物研究表明猕猴是SARS-CoV-2的可行模型,但这是研究人员首次对三种不同的灵长类模型进行了纵向研究。此外,研究人员使用了最全面的评估方法,从支气管肺泡灌洗(肺液收集)和鼻拭子确定病毒的存在,再到胸部X射线和CT扫描来评估感染后的肺部健康。 结果显示,猕猴和狒狒模型会形成强烈的急性病毒感染迹象,导致肺炎。而本研究发现非人类灵长类动物的免疫系统会产生强烈反应并清除感染。特殊的骨髓细胞从血液流向肺部,并分泌高水平的I型干扰素,细胞因子等。这些特殊的吞噬细胞的出现与病毒和疾病指标的下降相对应。 这项研究也是SARS-CoV-2感染特异性改变肺部淋巴样细胞(T细胞)的首次报告,猕猴中产生了强烈且非常特异的免疫反应,使动物能够清除病毒。这一发现表明,灵长类模型将有助于理解对SARS-CoV-2的免疫反应,并有助于制定可以产生类似反应的干预措施,并有助于评估需要特殊治疗的疫苗的安全性和有效性。才能产生免疫反应。