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《来认识一下食蚜虻专家：Santos Rojo和Andrea Aracil》

  • 来源专题：外来生物入侵
  • 编译者： 刘小燕
  • 发布时间：2020-07-30

  • Santos Rojo是西班牙阿利坎特大学的教授，现任环境科学与自然资源系主任，研究重点是双翅苍蝇的生物学和生态学，从生物多样性的研究到分析苍蝇在自然和非自然生态系统中扮演的角色，直到他们如何与其他生物相互作用。Andrea Aracil目前正在做的博士论文是关于食蚜虻成虫前的阶段（主要是幼虫），只要研究形态学、生物学、功能形态学和发育，也参与了一些食蚜虻种类的大批量生产的应用方法进行授粉研究。Santos Rojo和Andrea Aracil组成了一支食蚜虻评估团队，他们正在努力更好地了解欧洲食蚜虻物种灭绝的风险。Santos Rojo和Andrea Aracil处于职业生涯的不同阶段，为那些可能考虑从事昆虫学和学术研究以及这些职业如何为自然保护作出贡献的人们提供了深刻的认识。该项目旨在评估整个欧洲的食蚜蝇物种的灭绝风险，并将有助于指导这些物种在欧洲范围内的决策和保护行动。

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    • 来源专题：人类遗传资源和特殊生物资源流失
    • 编译者：yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间：2019-04-16
    • 这位瑞士人从药学开始，然后移居国外，在基因编码扩展和合成生物学领域工作。回到瑞士后，他喜欢在刺激的实验室环境中工作，并期待着花时间在冰壶和划船上。 Huguenin_Dezot_Nicolas_D-BSSE 在你来这里之前，你对D-BSSE了解多少?你来苏黎世联邦理工学院的动机是什么? 当我还是苏黎世联邦理工学院的一名学生时，我就知道了D-BSSE，从那时起我就一直关注潘克和富森格教授的工作。在获得英国剑桥大学分子生物学实验室Jason Chin教授的博士学位和博士后学位后，我和我的合作伙伴(我在那里遇到的)正在寻找一个我们都可以继续发展学术事业的地方。苏黎世联邦理工学院(ETH Zurich)在各自的研究领域都拥有世界级的研究团队，是理想的雇主。Panke教授领导的生物过程实验室和D-BSSE为我想从事的研究方向提供了一个合适的研究环境。此外，我们认为瑞士在一个小范围内提供了大量的就业机会，拥有高效的公共交通系统，而且它也是一个我们可以看到自己长期生活的地方。 你的期望是什么?自从你来到巴塞尔后，你的期望达到了吗? 虽然我以前住在瑞士(我在讲法语的Neuchatel州的Chez-le-Bart长大)，在苏黎世联邦理工学院学习，但我对巴塞尔并不太了解。 然而，自从我加入以来，我对D-BSSE和巴塞尔研究机构的活力感到非常惊讶。还有许多其他有趣的研讨会和认识新朋友的机会在活动组织,例如,国家能力研究中心(NCCR)的分子系统工程,位于巴塞尔也通过巴塞尔博士后等关联网络或气体(科学D-BSSE员工协会)。由于我每天往返于苏黎世和巴塞尔之间，我也可以很容易地参加苏黎世ETH组织的活动。对我来说，巴塞尔与工业界的紧密联系也是一个优势，当然降低了与学术界合作和发展协同效应的门槛。 你的第一印象如何? 我不知道我在国外生活的这些年是否提高了我容忍杂乱和不整洁的门槛，但我意识到这是这里实验室里的一个主要话题，非常老套，因为它通常与瑞士文化有关!无论如何，我喜欢在整洁的环境中工作! 你将在D-BSSE进行哪些研究? 我想在这里的D-BSSE进行的研究将集中于开发新的方法来进化蛋白质并赋予它们新的功能。酶是一种蛋白质，在我们的日常生活中无处不在(从洗衣粉到腌肉)，但也可以作为催化剂来生产精细化学品。这就是为什么我相信，如果成功，这项研究将在几个研究领域产生重大影响，但也会有很好的商业应用前景。 你希望在瑞士从事什么爱好或个人兴趣? 在剑桥期间，我学会了和我的学院(克莱尔霍尔)划船，我非常喜欢它，我成为学院男子第一艘船的船长!之后，我也有机会与三一学院(Trinity College)合作，在那里我获得了博士后学位。我希望我也能抽出时间在瑞士练习这项运动。 对于冬季，我真的很希望我能重新开始打冰壶，这是我在上大学之前在全国水平上练习的一项运动。
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  • 《来围观一下中国作者发表的研究数据》
    • 来源专题：科技大数据监测服务平台
    • 编译者：zhoujie
    • 发布时间：2019-08-08
    • BMC Research Notes 主要发表经过同行评审后的科学有效的实验结果和数据描述，这是其他很多期刊所不具备的。作为研究数据发表平台，我们坚信：我们相信即使是简单的观察性研究结果，只要合理，就值得拥有一个发表的平台。本刊已被MEDLINE, PubMed, PubMed Central, SCImago, Scopus等数据库收录。 这里为大家整理了近期发表在BMC Research Notes 上来自中国作者的研究： 1. 使用CRISPR/Cas9使大豆中的种子贮藏蛋白基因发生突变 Mutagenesis of seed storage protein genes in Soybean using CRISPR/Cas9 Chenlong Li et al. DOI: 10.1186/s13104-019-4207-2 大豆是全球范围内食品和工业中的重要植物蛋白来源。伴大豆球蛋白（Conglycinin, 7S)）和大豆球蛋白（glycinin, 11S）是由一小组基因编码的两大类贮藏蛋白，约占总大豆种子蛋白的70％。在某些育种计划中，这些基因的突变等位基因通常是必需的，因为这些蛋白亚基的相对丰度可能会影响氨基酸组成和豆类食品的特性。本研究旨在使用发根农杆菌（Agrobacterium rhizogenes）介导的毛状根培养系统测试CRISPR/Cas9体系在编辑大豆贮藏蛋白基因中的效率。 作者设计了多个sgRNA并测试了它们靶向9个主要贮藏蛋白基因中的表现，经检测发现大豆毛状根中有3种贮藏蛋白的基因发生了突变，突变比例为3.8％至43.7％。该研究为将来大豆育种者改造/开发具有种子贮藏蛋白突变的变体提供了强有力的工具。 2. 从中国包头市一医院分离得到的肠球菌属中获得性耐药基因的分布情况分析 Distribution of acquired antibiotic resistance genes among Enterococcus spp. isolated from a hospital in Baotou, China Yingjie Tian et al. DOI: 10.1186/s13104-019-4064-z 本研究分析了从中国包头一医院患者中分离得到的肠球菌属中获得性耐药基因的分布情况。2016年12月至2017年9月期间一共从临床标本中收集了73个肠球菌分离株，包括36个（49.3％）屎肠球菌（E. faecium）、35个（47.9％）粪肠球菌（E. faecalis）、1个（1.4％）鹑鸡肠球菌（E. gallinarum）和1个（1.4％）棉子糖肠球菌（E. raffinosus）。肠球菌对呋喃妥因、四环素、庆大霉素（高水平）、氨苄青霉素、环丙沙星和红霉素的耐药率分别为24.7％、49.3％、50.7％、54.8％、74.0％和89.0％。最常见的氨基糖苷类耐药基因为aac(6′)-Ie-aph(2″)-Ia (64.9%)和aph(3′)IIIa (64.9%)。最常见的红霉素核糖体甲基化基因为rm(B) (67.7%)，其次为erm(A) (4.6%)和erm(C) (1.5%)。所有耐四环素的肠球菌中均存在耐药基因 tetM。因此，屎肠球菌和粪肠球菌被确定为是包头市医院获得性肠球菌感染最主要的病原菌种类。肠球菌分离株中最常见的耐药基因为 aac(6′)-Ie-aph(2″)-Ia、aph(3′)IIIa、tetM和erm(B) 。要想有效控制多重耐药性肠球菌的感染，有必要采取措施强化对细菌耐药性及耐药基因的监测。 3. 短信干预服务对糖尿病前期患者的长期影响：一项为期5年的随机对照试验后观察性研究 Five-year effectiveness of short messaging service (SMS) for pre-diabetes Carlos K. H. Wong et al. DOI: 10.1186/s13104-018-3810-y 通过观察性的随机对照试验后研究评估了2年短信服务（SMS）从长远角度是否有助于糖尿病前期患者保持血糖、血脂水平以及减少其3年内发展为糖尿病的风险。SMS干预研究是一项为期2年的随机对照试验，旨在探索SMS是否能够改善糖尿病前期患者的病情及临床结果。作者在该研究项目结束后对研究的104名受试对象进行了长期随访。所有的受试对象在SMS干预结束后5年时接受了糖尿病筛查。本研究的主要结果为随访期间糖尿病的累计发病率，次要结果为5年随访期内糖尿病前期患者的生化指标变化。 研究平均随访时间为57个月，有19例患者在随访过程中失访，失访率为18.3%。干预组和对照组分别有20和16名患者发展成糖尿病，两组之间无明显差异（干预组和对照组的新发糖尿病率分别为8.08/100人年和7.31/100人年；干预组的风险比为1.184；95%置信区间为0.612-2.288；p值为0.616）。在整个研究群体和各亚组中均未发现SMS能显著降低糖尿病的发生。SMS在干预期间具有一定的积极作用，但其影响仅限于干预措施终止2年内。试验注册号：NCT01556880（于2012年3月16日回顾性注册）。 4. 在相同条件下生长于富营养培养基中和生长于氧化应激条件下的11种酵母菌种属的转录组学数据 Transcriptomics data of 11 species of yeast identically grown in rich media and oxidative stress conditions William R. Blevins et al. DOI: 10.1186/s13104-019-4286-0 本研究旨在鉴定酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）中来源于原先非编码的基因组区域的转录子或无参转录子。通过这些数据，作者比较了不同种类的子囊菌的转录组信息。共获得了11种酵母菌的深度RNA测序结果，这11种酵母菌分别是酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）,奇异酿酒酵母（Saccharomyces paradoxus）、粟酒 裂殖酵母（Saccharomyces mikatae）、库德里阿兹威酵母（Saccharomyces kudriavzevii）、贝酵母（Saccharomyces bayanus）、Naumovia castelii酵母、Kluyveromyces lactis酵母、Lachancea waltii酵母、Lachancea thermotolerans酵母、漆酶裂殖酵母（Lachancea kluyveri）和裂殖酵母（Schizosaccharomyces pombe）。研究人员对在富营养和氧化应激条件下生长的酵母菌进行了RNA测序，为每种酵母菌构建了基因组引导的无参转录组装配物。每个样品中都包含合成的加标转录物用于确定测序平台能检测到的最低极限和无参转录组生成流程的可靠度。研究人员随后将无参转录组与参考基因注释进行了比较，并且生成了包含注释过的和新的转录子的装配物。
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