《最近发现的埃博拉病毒-Makona基因组突变不会改变动物模型的致病性》

  • 来源专题:实验室生物安全
  • 编译者: 张虎
  • 发布时间:2018-11-06
  • 埃博拉病毒(EBOV),分离Makona,西非EBOV流行病的致病因子,已经成为许多调查的主题,以确定遗传多样性及其对病毒生物学,致病性和传播性的潜在影响。尽管随着时间的推移通过多个人 - 人传播链出现了各种突变,但它们的生物相关性仍然值得怀疑。最近,在爆发期间早期出现并稳定的糖蛋白GP和聚合酶L的突变与细胞培养中病毒适应性的改善有关。在这里,我们用携带或缺乏这些突变的EBOV-Makona分离株感染小鼠和恒河猴。令人惊讶的是,所有分离株的表现非常相似,与基因型无关,分别在小鼠和猕猴中引起严重或致命的疾病。同样,我们无法检测到病毒脱落的任何证据。因此,在两种动物模型中,没有特定的生物学表型与这些EBOV-Makona突变相关。

  • 原文来源:https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(18)30569-2
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    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-03-17
    • 3月9日,Science期刊发表了题为“Mutations can reveal how the coronavirus moves—but they’re easy to overinterpret”的新闻文章。 2月28日,Christian Drosten在网上公布了新型冠状病毒的基因序列后,他立即在Twitter上发出警告。随着病毒在世界各地的传播,超过350个SARS-CoV-2的基因组序列已经在在线平台GISAID上共享。这些序列暗含着SARS-CoV-2病毒的传播和进化线索,但由于这些序列只代表了感染病例的一小部分,并且显示出很少的信号差异,因此正如Drosten所意识到的,它们很容易被过度解读。 柏林Charité大学医院的一名病毒学家对一名在意大利感染COVID-19的德国患者的病毒进行了测序。这个基因组看起来与一个多月前在巴伐利亚州首府慕尼黑的一名患者身上发现的病毒基因组相似,且这两种病毒都有三个在中国早期病毒序列中没有发现的突变。Drosten意识到这可能会产生这样的想法,即意大利疫情是巴伐利亚州疫情的“种子”。但他认为,携带这三种突变的中国变体病毒也有可能走上了通往两国的独立道路。因此Drosten在Twitter上说,新测序的基因组“不足以证明慕尼黑和意大利之间存在联系”。 但他的警告无人理会。几天后,美国弗雷德•哈钦森癌症研究中心Trevor Bedford在Twitter上写道,这表明巴伐利亚州的疫情显然没有得到控制,似乎导致了意大利的疫情。这一分析广泛流传,《Technology Review》发言称,“慕尼黑事件可能与整个欧洲相当一部分的疫情有关”,Twitter用户呼吁德国道歉。 现在,更多的病毒多样性正在出现。与所有病毒一样,SARS-CoV-2是随着时间进行随机变异的,只有一部分变异会被病毒的纠错机制捕获并纠正。爱丁堡大学的分子进化生物学家Andrew Rambaut说,在其30000个碱基对的基因组中,SARS-CoV-2平均每月积累约1到2个突变。它的变异速度大约是流感的2到4倍。利用这些微小的变化,研究人员可以绘制系统发育树,还可以在不同的COVID-19病例之间建立联系,并判断是否有未被发现的病毒传播。 科学家还将通过研究基因组的多样性,寻找可能改变病原体危险程度或传播速度的突变。但在这方面,也需要谨慎。Drosten说,大多数基因组的改变不会改变病毒的行为。他补充说,确认突变有影响的唯一方法就是在细胞培养或动物模型中研究它,并举例说明它在进入宿主细胞或传播能力方面已经变得更强。如果病毒真的以一种重要的方式发生了变化,它可能会向任何一个方向发展,使其变得更多或更少危险。 然而,目前仍很少有关于病毒传播的确切结论出现,部分原因是因为基因组的丰富性仍然是全世界超过10万个病例中的一个小样本。尽管中国占了所有COVID-19病例的80%,但在已发表的基因组中,只有三分之一来自中国,很少有来自后来病例的基因组。而且这些研究成果都是在爆发初期得出的,大多数基因组仍然非常相似,这使得很难得出确切结论。英国贝德福德大学的计算生物学家Richard Neher说:“我们只发现了少量的突变,这使得这些基因群非常模糊。随着疫情的爆发,我们希望看到越来越多的多样性和越来越清晰的病毒演变过程”。
  • 《高致病性禽流感H5病毒偶发性死灰复燃》

    • 来源专题:新发突发传染病
    • 编译者:张玢
    • 发布时间:2023-10-23
    • 自2021年以来,高致病性禽流感(HPAI)H5N1活动在全球范围内加剧,日益导致野生鸟类和家禽的大规模死亡以及哺乳动物的偶然感染。然而,强调未来缓解战略的生态和病毒学特性仍不清楚。使用流行病学,空间和基因组学方法,研究人员展示了复苏的HPAI H5起源的变化,并揭示了病毒生态学和进化的重大变化。疫情数据显示,2016-2017年和2020-2021年发生了重要的死灰复燃事件,促成了2021-2022年H5N1的出现和泛动物传播。基因组分析显示,2016-2017年的动物流行病起源于亚洲,那里的HPAI H5储层是地方性的。2020–2021年,非洲家禽中出现了2.3.4.4b H5N8病毒,其突变改变了HA结构和受体结合。2021-2022年,一种新的H5N1病毒通过欧洲野生鸟类的重组进化,在全球传播期间与野生和家禽的低致病性禽流感进行了进一步重组。这些结果突出了高致病性禽流感震中在亚洲以外的转移,并表明高致病性禽流感H5在野生鸟类中的持久性增加正在促进地理和宿主范围的扩大,加速扩散速度并增加重组潜力。由于H5N1和H5N8的早期暴发是由更稳定的基因组星座引起的,最近的这些变化反映了家禽-野生-鸟类界面的适应。因此,家禽的消除策略仍然是限制未来动物流行病的高度优先事项。