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《MedRixv，2月27日，Application and optimization of RT-PCR in diagnosis of SARS-CoV-2 infection》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-02-28

  • Application and optimization of RT-PCR in diagnosis of SARS-CoV-2 infection

    Guanmin Jiang, Xiaoshuai Renc, Yan Liu, Hongtao Chen, Wei Liu, Zhaowang Guo, Yaqin Zhang, Chaoqun Chen, Jianhui Zhou, Qiang Xiao, Hong Shan

    doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.25.20027755

    Abstract

    Background: Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) caused by Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has become a global threat to public health. Aiming to construct an efficient screening pattern, we comprehensively evaluated the performances of RT-PCR and chest CT in diagnosing COVID-19. Methods: The records including demographics, RT-PCR, and CT from 87 confirmed COVID-19 cases and 481 exclusion cases were collected. The diagnostic accuracy of the pharyngeal swab RT-PCR, CT, combination with the second pharyngeal swab RT-PCR or with CT were evaluated individually. Besides, all the stool RT-PCR results were plotted by time to explore the value of stool RT-PCR.

    *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用.

  • 原文来源：https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.25.20027755v1
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    • 发布时间：2020-02-28
    • 信息名称：RT-PCR在SARS-CoV-2感染诊断中的应用与优化 1.时间：2020年2月27日 2.机构或团队：中山大学附属第五医院 3.事件概要： 中山大学附属第五医院的科研人员在medRxiv预印版平台发表论文“Application and optimization of RT-PCR in diagnosis of SARS-CoV-2 infection”，讨论和评估了RT-PCR在SARS-CoV-2感染诊断中的应用与优化。 研究背景：由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2（SARS-CoV-2）引起的2019新型冠状病毒（COVID-19）已成为对公共健康的全球威胁。为了构建有效的筛查模式，科研人员全面评估了RT-PCR和胸部CT诊断COVID-19的性能。研究方法：收集87例确诊的COVID-19病例和481例排除病例的人口统计学信息以及RT-PCR和CT记录，分别评估了咽拭子RT-PCR、CT与第二次咽拭子RT-PCR或CT的诊断准确性。此外，还按时间绘制了所有粪便RT-PCR结果，以探讨粪便RT-PCR的价值。研究结果：RT-PCR和CT的联合检测灵敏度（91.9%，79/86）比单独使用RT-PCR（78.2%，68/87）或单独使用CT（66.7%，81之54）或两种RT-PCR测试（86.2%，75/87）联合检测的敏感性更高。RT-PCR和CT之间有很好的一致性（kappa值为0.430）。在34例结果不一致的COVID-19病例中，有94.1%（n = 32）是轻度感染，其中62.5%（20/32）显示RT-PCR阳性。 46.7%（35/75）COVID-19患者在治疗过程中至少有一次大便阳性，2例大便阳性早于咽拭子。重要的是，一名患者连续出现大便阳性但咽拭子阴性。最后科研人员给出结论：RT-PCR和CT结合使用具有最高灵敏度是筛选COVID-19的最佳方式，在轻度感染的诊断中，RT-PCR优于CT。RT-PCR检测结果应被视为提高发现率和出院率的一项检查内容。该研究为SARS-CoV-2感染的筛查和监测的优化方案提供了依据。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用. 4.附件： 原文链接： https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.25.20027755v1.full.pdf
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  • 《J Hosp Infect，3月6日，Diagnosis of SARS-CoV-2 Infection based on CT scan vs. RT-PCR: Reflecting on Experience from MERS-CoV》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2020-03-08
    • Diagnosis of SARS-CoV-2 Infection based on CT scan vs. RT-PCR: Reflecting on Experience from MERS-CoV Jaffar A.Al-Tawfiq, Ziad A.MemishMD Show more https://doi.org/10.1016/j.jhin.2020.03.001 As of 29th February 2010 the World Health Organization had reported a total of 83 652 COVID-19 cases in 51 countries in addition of China [1]. The diagnosis of respiratory viruses such as Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) and SARS-CoV relies on detection of the virus by real-time RT PCR (rRT-PCR) for in vitro qualitative detection. The current recommendations are likewise to use rRT-PCR for the detection of SARS-CoV-2 in respiratory samples. There are many knowledge gaps facing the global health community in dealing with the new emerging SARS-CoV-2. Among the most pertinent is early identification of cases to facilitate application of isolation policies.
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