《H9N2禽流感病毒的全球遗传变异与传播动力学》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
  • 编译者: 张玢
  • 发布时间:2017-11-14
  • H9N2流感病毒在家禽群体中广泛流行,通过突变,重组和重配等方式产生可变基因型,可能更适合感染新宿主,抵抗药物治疗或逃避免疫压力。 LPAI H9N2病毒有可能向人类高水平的致病性进化。报道了一些关于区域扩散的研究,但全球传播和病毒的驱动因素了解甚少,特别是在基因组规模。研究分析了随机抽取的168个H9N2基因组的所有8个基因片段,为更好地理解病毒的起源和遗传变异提供了一个全景框架,并利用系统地理学和空间流行病学方法揭示了遗传变异,预测因子和H9N2病毒的传播。研究发现更频繁的重配事件涉及PA,NP和NS等节段,21个菌株可能具有由重组事件引起的马赛克结构。基因特异性全球dN / dS比率的估计显示所有基因都经过纯化选择。然而,在HA,NA,M2,NS1和PA三个方法中,至少有两个方法在正向选择下检测到13个位点。此外,推断NA片段核苷酸替代率最高,其tMRCA估计值是其余片段推断值中最小的。关于空间历史,使用GLM分析将人类的空中运输确定为全球病毒迁移的主要驱动因素,经济因素和地理距离是适度的预测因子。在5对区域(> 0.01)之间估计迁移率较高,表明病毒在不连续的地理位置之间频繁迁移。此外,跳跃分析显示华南和华北地区的病毒迁徙更为频繁,美洲和东亚之间的基因流动率较高。而且,美国和东南亚一起是全球传播的主要中心,构成了进化树的主干。这些发现提示了病毒进化,流行病学和人类行为之间复杂的相互作用。

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    • 编译者:张玢
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    • 2013 年 2 月以来,中国内地共报道400 多例实验室确认的人禽流感H7N9 感染病例。本研究的目的在于评估筛选和扑杀受感染的家禽 H7N9 流行病的演变的影响。 研究人员构建人群和家禽感染禽流感 H7N9 病毒传输动力学数学模型。模型中的参数估计采用对动物和人类感染公开可用的全国监测数据。 通过两个主机模型拟合,研究表明,筛查和扑杀家禽中H7N9 可以有效地减小人类 H7N9 的新增病例。此外,,通过家禽筛选和扑杀政策来消除可能H7N9 病毒传播技术上是可行的。 筛选和扑杀感染家禽是在长期预防人类 H7N9 感染的关键措施。该模型可为制定国家长期控制 H7N9 病毒疫情干预战略决策提供重要的依据。
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    • 从2013年到2017年5月17日,中国的甲型H7N9禽流感病毒在中国引发了5波人类感染。在此期间,报告了1,564例实验室确诊人类病例和612例死亡病例;约有一半发生在第五波期间。第五波不仅感染了更多的人,而且还传播到北方;以前的H7N9爆发仅在中国东部和华南地区有记录。此外,中国南部广东省最近从人类病例中分离到的病毒(A / Guangdong / 17SF003 / 2016和A / Guangdong / 17SF006 / 2017)已被确认为高致病性禽流感(HPAI)A(H7N9)病毒,根据其分子(3)和生物(4)的特点。 在2017年5月在中国陕西报告了人类感染高致病性禽流感A(H7N9)病毒。研究人员从5个病人和4个城市的活家禽市场或农场获得了完整的基因组。 结果表明,H7N9从中国南部和东部向西扩展。