H9N2流感病毒在家禽群体中广泛流行,通过突变,重组和重配等方式产生可变基因型,可能更适合感染新宿主,抵抗药物治疗或逃避免疫压力。 LPAI H9N2病毒有可能向人类高水平的致病性进化。报道了一些关于区域扩散的研究,但全球传播和病毒的驱动因素了解甚少,特别是在基因组规模。研究分析了随机抽取的168个H9N2基因组的所有8个基因片段,为更好地理解病毒的起源和遗传变异提供了一个全景框架,并利用系统地理学和空间流行病学方法揭示了遗传变异,预测因子和H9N2病毒的传播。研究发现更频繁的重配事件涉及PA,NP和NS等节段,21个菌株可能具有由重组事件引起的马赛克结构。基因特异性全球dN / dS比率的估计显示所有基因都经过纯化选择。然而,在HA,NA,M2,NS1和PA三个方法中,至少有两个方法在正向选择下检测到13个位点。此外,推断NA片段核苷酸替代率最高,其tMRCA估计值是其余片段推断值中最小的。关于空间历史,使用GLM分析将人类的空中运输确定为全球病毒迁移的主要驱动因素,经济因素和地理距离是适度的预测因子。在5对区域(> 0.01)之间估计迁移率较高,表明病毒在不连续的地理位置之间频繁迁移。此外,跳跃分析显示华南和华北地区的病毒迁徙更为频繁,美洲和东亚之间的基因流动率较高。而且,美国和东南亚一起是全球传播的主要中心,构成了进化树的主干。这些发现提示了病毒进化,流行病学和人类行为之间复杂的相互作用。