《Sci Rep:新方法有助于寻找治疗COVID-19的药物》

  • 来源专题:中国科学院病毒学领域知识资源中心
  • 编译者: malili
  • 发布时间:2020-12-13
  • 2020年12月10日 讯 /生物谷BIOON/ --最近,KTH皇家理工学院的研究人员与印度Alagappa大学合作在《Scientific Reports》杂志上发表了一份清单,列出了具有COVID-19治疗潜力的各种药物和鸡尾酒疗法。

    通过对DrugBank数据库的虚拟筛选,研究者们发现了攻击SARS-CoV-2的各种方式,即使它们发生了变异。据此,该研究确定了针对冠状病毒重要蛋白质的药物和可能的混合物。

    他们的研究采用了双重评分方法来鉴定具有COVID-19治疗潜力的先导化合物。该程序似乎已成功避免了假阳性,这是虚拟筛选中的常见问题。

    该研究的关键部分是鉴定靶向或结合多种蛋白质的药物,这些蛋白质是病毒复制所必需的,并且也参与宿主细胞感染的初始阶段。通讯作者Vaibhav Srivastava和Arul Murugan说,多靶点提供了一种有效的途径来应对耐药性,这将使药物能够应对病毒的突变。

    Srivastava说:“病毒正在迅速变异,这意味着它正在修饰其蛋白质。如果我们有一种可以靶向多种蛋白质的药物,即使一种蛋白质发生突变,该药物仍将对其他蛋白质有效。” “我们有可能找到混合药物疗法选项,其中每种药物都可以高亲和力地结合特定的靶蛋白。”

    例如,该研究提出了一种鸡尾酒疗法: baloxavir marboxil,那他霉素和RU85053,它们分别针对三种病毒蛋白,即3CL Main蛋白酶,木瓜蛋白酶样蛋白酶和RdRp。事实证明,这种药物混合物可有效治疗其他病毒传播的疾病,例如HIV。

    Murugan说,通过筛查还发现了已经在临床试验中的药物,这一事实证实了他们方法的可靠性。他还说,这样的研究可以提供关于为什么某些药物无效的内在见解。例如,他们指出,羟氯喹是无效的,主要是因为它对病毒蛋白的结合亲和力很差。

    该研究推荐用于测试的其他药物是tivantinib,olaparib,zoliflodacin,golvatinib,sonidegib,regorafenib和PCO-371。

    本文还列出了多靶点药物,例如DB04016,酞菁,他达拉非,它们也可以有效对抗快速变异的冠状病毒。(生物谷Bioon.com)

    资讯出处:Study identifies new potential treatments for COVID-19

    原始出处:Murugan, N.A., Kumar, S., Jeyakanthan, J. et al. Searching for target-specific and multi-targeting organics for Covid-19 in the Drugbank database with a double scoring approach. Scientific Reports 10, 19125 (2020). doi.org/10.1038/s41598-020-75762-7

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    • 最近一段时间内,研究人员和科学家一直在寻找多种治疗COVID-19的解决方案。 在最近一项研究中,芝加哥大学普利兹克分子工程学院(PME)的研究人员使用了最先进的计算机模拟技术来识别可以快速解决这一全球流行病的现有药物。 他们的发现发表在8月14日的《Science Advance》杂志上。 2月初,由于大流行病的迅速发展,Juan de Pablo教授和他的学生利用他们的分子建模专业知识来帮助找到针对这种疾病的治疗方法。de Pablo解释说:“由于高通量筛选中考虑了大量的化合物,这些计算必须涉及许多简化,然后必须使用实验和更精细的计算来评估结果。” 研究人员首先专注于发现目标病毒的弱点。他们选择了其主要蛋白酶:Mpro。 Mpro是一种重要的冠状病毒酶分子,在病毒的生命周期中起着至关重要的作用。它促进了病毒转录其RNA并在宿主细胞内复制其基因组的能力。 Ebselen是一种有希望成为对抗Mpro武器的药物。 Ebselen是具有抗病毒,抗炎,抗氧化,杀菌和保护细胞特性的化合物。 Ebselen用于治疗多种疾病,包括双相情感障碍和听力下降。多项临床试验证明了其在人体中的安全性。 de Pablo和他的学生着手开发酶和药物的详细模型。通过使用这些模型和复杂的超级计算机模拟,他们发现小的Ebselen分子能够以两种不同方式降低Mpro的活性。 “除了在酶的催化位点结合外,Ebselen还与远处的位点牢固结合,后者依靠一种将信息从大分子的一个区域携带到另一区域的机制来干扰酶的催化功能。通过微妙的结构重组来摆脱它。” 这一发现特别重要,因为它有助于解释Ebselen作为再利用药物的潜在功效,并且揭示了该病毒的一个新漏洞,该漏洞以前不为人所知,可用于开发针对COVID-19的新治疗策略。 该研究小组发现了两个结合位点,有望使Ebselen成为设计和开发新型Mpro抑制剂和COVID-19治疗药物的新药。Pablo说:“蛋白酶是病毒中许多蛋白质的一种,我们正在系统地研究与病毒功能有关的其它蛋白质,并研究其脆弱性及其对多种药物的反应。”