《来围观一下中国作者发表的研究数据》

  • 来源专题:科技大数据监测服务平台
  • 编译者: zhoujie
  • 发布时间:2019-08-06
  • BMC Research Notes 主要发表经过同行评审后的科学有效的实验结果和数据描述,这是其他很多期刊所不具备的。作为研究数据发表平台,我们坚信:我们相信即使是简单的观察性研究结果,只要合理,就值得拥有一个发表的平台。本刊已被MEDLINE, PubMed, PubMed Central, SCImago, Scopus等数据库收录。

    这里为大家整理了近期发表在BMC Research Notes 上来自中国作者的研究:

    1. 使用CRISPR/Cas9使大豆中的种子贮藏蛋白基因发生突变

    Mutagenesis of seed storage protein genes in Soybean using CRISPR/Cas9

    Chenlong Li et al.

    DOI: 10.1186/s13104-019-4207-2

    大豆是全球范围内食品和工业中的重要植物蛋白来源。伴大豆球蛋白(Conglycinin, 7S))和大豆球蛋白(glycinin, 11S)是由一小组基因编码的两大类贮藏蛋白,约占总大豆种子蛋白的70%。在某些育种计划中,这些基因的突变等位基因通常是必需的,因为这些蛋白亚基的相对丰度可能会影响氨基酸组成和豆类食品的特性。本研究旨在使用发根农杆菌(Agrobacterium rhizogenes)介导的毛状根培养系统测试CRISPR/Cas9体系在编辑大豆贮藏蛋白基因中的效率。

    作者设计了多个sgRNA并测试了它们靶向9个主要贮藏蛋白基因中的表现,经检测发现大豆毛状根中有3种贮藏蛋白的基因发生了突变,突变比例为3.8%至43.7%。该研究为将来大豆育种者改造/开发具有种子贮藏蛋白突变的变体提供了强有力的工具。

    2. 从中国包头市一医院分离得到的肠球菌属中获得性耐药基因的分布情况分析

    Distribution of acquired antibiotic resistance genes among Enterococcus spp. isolated from a hospital in Baotou, China

    Yingjie Tian et al.

    DOI: 10.1186/s13104-019-4064-z

    本研究分析了从中国包头一医院患者中分离得到的肠球菌属中获得性耐药基因的分布情况。2016年12月至2017年9月期间一共从临床标本中收集了73个肠球菌分离株,包括36个(49.3%)屎肠球菌(E. faecium)、35个(47.9%)粪肠球菌(E. faecalis)、1个(1.4%)鹑鸡肠球菌(E. gallinarum)和1个(1.4%)棉子糖肠球菌(E. raffinosus)。肠球菌对呋喃妥因、四环素、庆大霉素(高水平)、氨苄青霉素、环丙沙星和红霉素的耐药率分别为24.7%、49.3%、50.7%、54.8%、74.0%和89.0%。最常见的氨基糖苷类耐药基因为aac(6′)-Ie-aph(2″)-Ia (64.9%)和aph(3′)IIIa (64.9%)。最常见的红霉素核糖体甲基化基因为rm(B) (67.7%),其次为erm(A) (4.6%)和erm(C) (1.5%)。所有耐四环素的肠球菌中均存在耐药基因 tetM。因此,屎肠球菌和粪肠球菌被确定为是包头市医院获得性肠球菌感染最主要的病原菌种类。肠球菌分离株中最常见的耐药基因为 aac(6′)-Ie-aph(2″)-Ia、aph(3′)IIIa、tetM和erm(B) 。要想有效控制多重耐药性肠球菌的感染,有必要采取措施强化对细菌耐药性及耐药基因的监测。

    3. 短信干预服务对糖尿病前期患者的长期影响:一项为期5年的随机对照试验后观察性研究

    Five-year effectiveness of short messaging service (SMS) for pre-diabetes

    Carlos K. H. Wong et al.

    DOI: 10.1186/s13104-018-3810-y

    通过观察性的随机对照试验后研究评估了2年短信服务(SMS)从长远角度是否有助于糖尿病前期患者保持血糖、血脂水平以及减少其3年内发展为糖尿病的风险。SMS干预研究是一项为期2年的随机对照试验,旨在探索SMS是否能够改善糖尿病前期患者的病情及临床结果。作者在该研究项目结束后对研究的104名受试对象进行了长期随访。所有的受试对象在SMS干预结束后5年时接受了糖尿病筛查。本研究的主要结果为随访期间糖尿病的累计发病率,次要结果为5年随访期内糖尿病前期患者的生化指标变化。

    研究平均随访时间为57个月,有19例患者在随访过程中失访,失访率为18.3%。干预组和对照组分别有20和16名患者发展成糖尿病,两组之间无明显差异(干预组和对照组的新发糖尿病率分别为8.08/100人年和7.31/100人年;干预组的风险比为1.184;95%置信区间为0.612-2.288;p值为0.616)。在整个研究群体和各亚组中均未发现SMS能显著降低糖尿病的发生。SMS在干预期间具有一定的积极作用,但其影响仅限于干预措施终止2年内。试验注册号:NCT01556880(于2012年3月16日回顾性注册)。

    4. 在相同条件下生长于富营养培养基中和生长于氧化应激条件下的11种酵母菌种属的转录组学数据

    Transcriptomics data of 11 species of yeast identically grown in rich media and oxidative stress conditions

    William R. Blevins et al.

    DOI: 10.1186/s13104-019-4286-0

    本研究旨在鉴定酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中来源于原先非编码的基因组区域的转录子或无参转录子。通过这些数据,作者比较了不同种类的子囊菌的转录组信息。共获得了11种酵母菌的深度RNA测序结果,这11种酵母菌分别是酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae),奇异酿酒酵母(Saccharomyces paradoxus)、粟酒 裂殖酵母(Saccharomyces mikatae)、库德里阿兹威酵母(Saccharomyces kudriavzevii)、贝酵母(Saccharomyces bayanus)、Naumovia castelii酵母、Kluyveromyces lactis酵母、Lachancea waltii酵母、Lachancea thermotolerans酵母、漆酶裂殖酵母(Lachancea kluyveri)和裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)。研究人员对在富营养和氧化应激条件下生长的酵母菌进行了RNA测序,为每种酵母菌构建了基因组引导的无参转录组装配物。每个样品中都包含合成的加标转录物用于确定测序平台能检测到的最低极限和无参转录组生成流程的可靠度。研究人员随后将无参转录组与参考基因注释进行了比较,并且生成了包含注释过的和新的转录子的装配物。

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    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2023-07-08
    • 近日,中国科学院海洋研究所王凡研究团队在印尼贯穿流(ITF)地转输运方面取得新进展,发布了最新的印尼贯穿流向印度洋的逐月地转输运数据产品,相关研究成果在国际学术期刊Geophysical Research Letters(Nature Index期刊)发表。 太平洋西边界流水体穿过印度尼西亚海进入印度洋,即印度尼西亚贯流(ITF),对局地和全球气候和生物地球化学循环具有至关重要的意义。在印度尼西亚巽他海峡和西澳大利亚弗里曼特尔之间部署的重复消耗性测深仪(XBT)温度观测时间较长,成为ITF地转体积输运估计的重要数据源。地转输运是ITF输运的主要组成部分,现有的对XBT-IX1断面的ITF地转输运的估计范围在2-12 Sv之间。主要的误差来源有两点:一是在XBT制造开始后不久发现的XBT数据偏差;二是稀疏的海洋盐度历史采样和忽略的盐度效应。最近,XBT学界推荐的矫正方案是由中国科学院大气所成里京研究员提出的Cheng2014方案。 王凡研究团队基于Cheng2014矫正方案和(1993-2018年,25个成员,0.25o×0.25o)和(1993-2017年,26个成员,0.5o×0.5o)两套IAP盐度数据,估算了7000米以上的ITF逐月地转输运并根据蒙特卡洛方法定量给出由数据样本误差造成的不确定性。数据产品已在中国科学院海洋数据中心公开发布,欢迎下载使用。数据产品链接:  http://www.casodc.com/data/metadata-special-detail?id=1602584419212836865&otherId=1602584419330277378 研究结果表明,1993-2018年ITF地转输运为8.2±0.2 Sv,其中温度和盐度分量的贡献分别为5.5±0.2和2.8±0.1 Sv。年际变异(~4.4 Sv)由温度分量主导,盐度分量为负贡献。1993-2018年间,ITF呈现1.33 Sv/十年的增强趋势,主要来自盐度分量,其次是温度分量。1984-2017年的版本在1993年之前的盐度分量中显示出更大的不确定性。在后续工作中,数据产品将进行进一步完善和更新,考虑700米以下的中深层输送并计算ITF的热盐输运量,以期加强对跨大洋物质能量交换的科学认识。 论文第一作者为中国科学院海洋研究所博士后郭亚茹,通信作者为李元龙研究员,合作者包括中国科学院大气物理研究所成里京研究员和田天博士、中国科学院南海海洋所陈更新研究员和刘钦燕研究员、中国科学院海洋所胡石建研究员、王晶副研究员和王凡研究员。研究得到了国家重点研发计划、中国科学院战略性先导科技专项、中国科学院跨学科创新团队、国家博士后科学基金和中国科学院海洋数据中心等的支持。 论文链接:  https://agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1029/2023GL103748 文章信息:  Guo, Y. R., Li, Y. L.*, Cheng, L. J., Chen, G. X., Liu, Q. Y., Tian, T., Hu, S. J., Wang, J. & Wang, F. (2023). An updated estimate of the Indonesian Throughflow geostrophic transport: Interannual variability and salinity effect. Geophysical Research Letters, 50, e2023GL103748.
  • 《中国自主研制“海上飞船”亮相三亚引围观》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:mall
    • 发布时间:2017-12-22
    • “会飞的船”亮相三亚引围观!中国“海上飞船”,助力“海洋强国”建设   起降无需机场设施或跑道,在400米的水域中就可以快速起飞,飞行结束后也可以随时在水域降落。由我国自主研制,已通过中国船级社认证的世界上速度最快的“海上飞船”——新一代翔州地效翼船,12月11日在海南三亚崖州湾海域,顺利完成海上各项飞行测试,引起世界各国高度关注。   那么,我国研制地效翼船的背景何在?其性能、特点有哪些独到之处?主要用途又在哪里?是否会成为海上未来交通工具?12月15日,科技日报记者独家采访了承担研发与海上测试的七?二所下属中船重工(海南)飞船发展有限公司相关专家、驾驶员等。 后来居上   我国正在向大型化工程化阶段发展   “可以说,在国际上,我国地效翼船研制是后来居上。目前,已经具备了独立研制适应西北太平洋大风浪环境的中型地效翼船的能力。发展水平在世界范围内仅次于俄罗斯,地效翼船也正在逐步向大型化工程化阶段发展。”翔州1地效翼船总设计师袁昌华说。   记者了解到,我国的地效翼船研发由七?二所开始于1967年。经过几十年的继续努力,在“九·五”和“十·五”预研攻关中,我国在地效翼船研制的关键技术攻关方面,取得了一系列重大的突破。“十二·五”以来,更是对高适航性技术进行了重点突破。尤其随着国内综合工业水平的提升,我国地效翼船研制与应用,更是进入“快车道”。   到目前为止,我国已先后建成10余艘载人地效翼船,进行过广泛的内河和海上试验。尤其在地效翼船的理论和试验方法、设计和建造技术、结构材料、施工工艺、发动机安装和维护等方面,又取得了新进展。   在试验总指挥吕伟高看来,国内地效翼船技术发展水平可以概括为:小型地效翼船研发和应用技术日臻成熟;中大型地效翼船关键技术获得突破;高耐波性技术得到初步验证;国内工业基础和配套能力逐渐完备,研发适合中国海情的中轻实用地效翼船,其条件已然具备。   七?二所先后成功研制了7型实用型地效翼船。其中,某型边防巡逻艇是我军第一种列装的地效翼船实用艇。该艇具有起降迅速、操纵灵活、航行平稳舒适、航速快、安全性高、处理突发事件能力强等特点,技术处国际先进水平。该类型艇的成功应用表明,我国已突破了小型地效翼船的设计建造技术。   由七?二所下属中船重工(海南)飞船发展有限公司研制的我国首型商用海上地效翼船“翔州1”,2013年5月在首飞成功。该船是国内首个通过CCS审图检验并入级的商用地效翼船,标志着中国的地效翼船实现了科技成果的产业化。   除此,面向未来,我国正加快培养一批高素质的地效翼船船员。早在1999年,我国就颁布了《中华人民共和国地效翼船船员培训、考试和发证办法(试行)》。浙江地方港监据此,开展了第一批内河A类地效翼船船员培训。   2014年,山东海事局牵头承担摩托艇等五类船舶操作人员和培训标准研究,七?二所会同青岛港湾学院共同完成了地效翼船船员培训教材和地效翼船船员培训考试管理办法。   去年,七?二所与南通航运职业技术学院联合申报的地效翼船船员培训项目获得批准,国内B类地效翼船船员培训取得突破。第一期海上地效翼船船员培训班,即将开班。  优势突出   地效翼船是世界上速度最快的船舶   在袁昌华眼里,由于地效翼船满足了地效区内外的稳定条件,因此能够在水面机动、驻泊、在贴近水面的地效区稳定飞行,或根据任务需求,跃升高飞。就像汽车在地面上行驶一样,十分安全,这与仅将水面作为机场的水上飞机是截然不同的。因此,与其它海上交通比较,无论对于军用,还是民用来说,地效翼船优势突出,更可以应用一些特殊场景。   执行离岛物资人员运输,地效翼船航速快、无需机场保障,且吃水浅,不需专门深水码头,对基础设施要求很少,对于解决我国南海广阔海域快速到达和小体量海岛无法提供基础设施支撑且岛屿周边水浅难以靠近的问题,有独特优势;而对于环渤海半小时经济圈、环北部湾一小时经济圈、珠江口半小时经济圈建设具有十分重要的意义。   执行海上搜救,地效翼船航速快,备航时间短,不依赖母船搭载,可快速到达海难区域;地效翼船工况多样,能飞高至150m,视距可达50km,便于广域搜索;能在贴近海面的数米高度长期巡航,便于精确识别目标,并精准空投救生物资;能在水面降落并浮航机动,便于人员救捞。   执行海洋物探,海洋物探的最主要手段是航空磁探仪,但该设备量程较小,用固定翼飞机搭载无法低飞,量程打折;用直升机搭载,则易受直升机自身磁场,影响测量精度。用地效翼船搭载磁探仪开展海洋物探,既能利用低飞优势,充分利用磁探仪有限量程,又能发挥速度优势,实现高效作业。   应用旅游与娱乐体验,地效翼船舒适、安全,且可以在10~20米高度长期巡航,可以给游客带来最佳的观景体验,用在兼具交通和观光的航线上具有特别的优势;而对于类似三亚的滨海狭长城市,则可以在水上将分散的景区联动形成集聚合力。同时,地效翼船稳定性好,容易驾驶,可以帮助普通人实现飞行梦想。   驾驶员王晓东告诉记者,地效翼船是世界上速度最快的船舶,大型地效翼船航速可达300kn左右,约为常规船舶的20倍,即使是19座的中轻型地效翼船航速也可达150kn左右;另外,计及地效翼船备航时间短且港口码头紧靠城市的因素,在飞行1小时以内的航线上相比同量级的飞机,地效翼船具有时间优势。   我国翔州1地效翼船的航行速度大概在每小时160公里至210公里之间,是普通舰船的8-12倍,比一般的快艇、气垫船也要快3-5倍左右。从三亚到三沙永兴岛仅仅只需1.5小时左右便可到达。 发展方向   加快创新全面拓展军民两用新领域   说到未来发展,飞船公司总经理石亚军透露,今后,我国地效翼船将向实用化、高耐波性、军民融合三方面发展。   如何体现实用化?石亚军说,“地效翼船作为会飞的船,首先应该是船。而长期以来,过于强调其能飞的特点,影响了它的实用性。因此,要提高其实用性,让飞乘客更舒适、船员更便捷、船东更省心、监管者更放心。”   如何达到高耐波性?石亚军说,“我国的海况复杂,与起降场可选择不同,地效翼船飞行过程中遭遇恶劣海况无法避免;要想地效翼船具备较好的耐波性,除了具备较高的起降抗浪能力外,还要求地效翼船在较大巡航高度下,具备较高的巡航效率,这与以往过于强调地效区飞行效率,有较大差别。”   近年来,七?二所科研团队,面对未来应用,加快技术创新。翔州1地效翼船2014年3月28取得船级社认证时,还是一艘工程样机,而此次出现在三亚崖州湾水域时,已发生了脱胎换骨的变化:内饰全面升级、换装了航空座椅、增设了内部通话系统、空调,乘员舒适度大幅提升;换装了成熟的综合航电,增设了电动半浸桨辅助动力,在地效翼船上首次实现自主靠离泊;未来还会换装煤油发动机,进一步降低使用成本;飞船公司即将推出的翔州2型高耐波性地效翼船,恶劣海况下的巡航效率将超过15。   在石亚军眼里,地效翼船拥有快速、便捷、安全、隐蔽、工况多样的特点,是天然的军民两用产品。今后,军民两个领域的相互促进和螺旋上升,将推动该产业领域又快又好发展。   然而,记者了解到,我国地效翼船发展,仍受到有指南无法规,现有的地效翼船不能适应我国海域的风浪,以及因为介于船和飞机之间的特殊性,两栖性与抗浪性的兼顾、专用动力装置缺乏、新材料和新工艺不成熟等瓶颈的制约。   由于有指南无法规的现状,已严重制约了产业发展。我国近半世纪持续努力获得的技术优势,正在逐渐削弱;民用市场开发停滞不前。2014年,通过船级社认证我国首艘商用海上地效翼船“翔州1”一直无法完成最基本的所有权乃至国籍登记,更不用说是正常运营;而国外的市场需求,也因为中国的产品没有成熟的运营先例,无法实际推进。   同时,由于法规的缺乏,主管机关无法监管和规范民间的地效翼船研发活动,滋生了大量安全风险。如,2013年3月28日,某公司的地效翼船在连云港水域试航过程中发生两死两伤的事故,造成了恶劣的社会影响。   由于现有的地效翼船不能适应我国海域的风浪,限制了实际应用。我国地处西北太平洋,常年风浪较大,在中国海域应用的地效翼船必须适应中国的海况。长期以来,我国的地效翼船以小型为主,较弱的抗风浪能力限制了大规模的应用。   事实上,地效翼船研发经验最为丰富的国家俄罗斯,因其主要海域均为内海,传统上并无高耐波性需求;直到2006年,随着北极航线可行性越来越高,俄罗斯才开始研发高耐波性地效翼船。因此,我国的地效翼船高耐波性技术并无成熟经验可以借鉴,也不能简单的依靠吨位的放大而实现。   值得欣喜的是,以七?二所为代表的研发机构,已在高耐波性技术上取得了突破,不久其旗下中船重工(海南)飞船发展有限公司将推出系列高耐波性地效翼船产品。   专家认为,地效翼船法定检验技术标准和运营安全管理规定的出台,已十分迫切;只有出台相关法规,才能推动产业发展,保住技术优势,降低安全风险,助力海洋强国建设。