土耳其Ege大学的研究人员12月28日在期刊Scientific Reports上在线发表了题为“In silico discovery of antigenic proteins and epitopes of SARS-CoV-2 for the development of a vaccine or a diagnostic approach for COVID-19”的文章。
文章称，在SARS-CoV-2基因组中，5’端编码一个多蛋白，该多蛋白进一步被切割成15个非结构蛋白，而3’端编码4个结构蛋白和8个附属蛋白。研究人员在27个蛋白中发现了可用于开发COVID-19疫苗或进行血清诊断分析的抗原蛋白和表位。研究人员在对SARS-CoV-2武汉分离株和经常检测到的变异蛋白质进行全基因组分析后发现，表面蛋白中的刺突蛋白、包膜蛋白和膜蛋白以及带有信号肽的蛋白均可能作为候选疫苗，而其余蛋白可被用于开发血清学诊断试验中所需的的抗原。根据所得结果，在27个蛋白中，有26个被预测为可能抗原。在26个蛋白中，刺突蛋白因其具有信号肽、负的GRAVY值（疏水性）、跨膜螺旋、适中的脂肪指数、较大的分子量、较长的半衰期、β- wrap基序以及稳定、可溶性和不过敏等特点而被选为最佳候选疫苗。此外，具有信号肽的orf7a、orf8和nsp-10蛋白也可以作为潜在的候选疫苗。核衣壳蛋白和一个高抗原性的GGDGKMKD表位被鉴定为理想的抗原，可用于开发血清学诊断方法。此外，考虑到MHC-I等位基因，具有高抗原性的KLNDLCFTNV和ITLCFTLKRK表位可用于开发基于表位的多肽疫苗。
原文链接：https://www.nature.com/articles/s41598-020-79645-9
