美国宾州州立大学团队最近开发的基因分型“芯片”可以促进珊瑚保护工作。该芯片让研究人员能够通过基因鉴定珊瑚和生活在珊瑚细胞内的共生藻类，这是在珊瑚礁恢复工作中建立和维持遗传多样性的重要步骤。芯片及其附带的在线分析管道有助于使珊瑚生物多样性的遗传识别更容易。这项研究成果已发表在《科学报告》（Scientific Reports）杂志上。
Acroporid珊瑚家族包含所有珊瑚家族中数量最多的不同物种，并且在加勒比海和太平洋中很常见。该芯片是使用加勒比海珊瑚设计的，但也可用于分析太平洋物种，并使研究人员能够鉴定出存在于珊瑚细胞中的共生藻类。
该芯片也称为微阵列，使用超过3万个单核苷酸多态性（简称SNP）。它足够灵敏，可以使研究人员可靠地区分同一珊瑚物种内不同种系的成员。宾夕法尼亚州立大学生物学教授、研究团队负责人Iliana Baums提到，增加珊瑚礁遗传多样性的一种方法是确保它是由一个以上的个体组成的。由于礁石上的所有珊瑚都可能属于同一物种，因此重要的是找到一种可靠的方法来对其进行识别，而他们的芯片可以将其提供给该领域的研究人员。
该芯片已授权给生产Affymetrix微阵列的Thermo Fisher Scientific公司，研究人员使用只需要将珊瑚样品发送到商业实验室即可。在实验室中，提取DNA并在芯片上运行，然后将所得数据返回给研究人员。然后，研究人员可以将数据文件上传到称为Acroporid基因分型标准工具（简称STAG）的在线分析管道中。在基于开源Web的Galaxy平台中的自定义“科学网关”中执行分析并维护数据。
Baums提到，基于SNP芯片和STAG管线，可以帮助并确保世界各地的研究人员能够以标准化的方式从基因上鉴定珊瑚。科学门户网站中维护的数据库使研究人员可以比较样品、识别新的菌株并随时间追踪珊瑚的多样性。
（傅圆圆 编译）
