《Cell Discov | 上海药物所合作揭示腺苷受体A2BR结合内源性和选择性配体的分子机制》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2023-01-09
  •   腺苷(adenosine,ADO)广泛分布于人体各种组织器官,通过作用于腺苷受体(ARs)来调节人体多种重要的生理和病理过程。ARs家族包括四种亚型,分别是A1R、A2AR、A2BR和A3R,其中A2BR与腺苷分子的亲和力较弱(微摩尔级别),而其他三种受体的结合能力均在纳摩尔级别。A2BR在免疫细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞和多种肿瘤细胞中均有表达,调节免疫、细胞生长、心脏功能等。腺苷/A2BR信号通路在急性疾病模型中具有组织保护作用,譬如保护心肌缺血和急性肺损伤等。小分子非核苷类配体BAY 60-6583是A2BR的高亲和力选择性激动剂,具有心脏保护作用。
      2022年12月28日,中国科学院上海药物研究所徐华强研究员团队和谢欣研究员团队联合临港实验室蒋轶研究员共同在Cell Discovery发表了最新的研究成果“Structures of adenosine receptor A2BR bound to endogenous and synthetic agonists”。研究解析了腺苷受体家族A2BR受体分别结合内源性配体腺苷(ADO)和选择性激动剂小分子(BAY 60-6583)并偶联改造型Gs 复合物的冷冻电镜结构,分辨率分别为3.2埃和2.9埃。
      该成果表明,A2BR具有与腺苷受体家族相比具有高度保守的腺苷配体结合口袋。分子动力学模拟分析表明,ADO与A2BR配体识别口袋的结合具有相比A1R和A2AR更低的稳定性,可能介导了ADO对A2BR的相对低亲和力。与内源性ADO相比,BAY 60-6583具有更深的结合位置,并与口袋深处的氨基酸形成极性相互作用。通过对腺苷家族受体中配体结合口袋残基的差异分析,研究人员发现A2BR口袋中的6.51位缬氨酸(V6.51),而腺苷受体家族的其他成员在该位点均为亮氨酸(L6.51)。亮氨酸相比缬氨酸具有更长的侧链,可能对配体的结合产生位阻。研究人员分别对A1R/A2AR的6.51位点进行反向突变,并发现这些突变体均获得了结合BAY 60-6583分子的能力,提示了6.51位缬氨酸是A2BR结合选择性配体的关键位点。该研究成果帮助科研人员从结构的角度理解了A2BR结合腺苷和非核苷类配体的机理,为腺苷家族受体的选择性配体开发奠定了结构基础。
      本研究中的冷冻电镜数据由中国科学院上海药物研究所高峰电镜中心收集。上海药物研究所博士后蔡洪敏、副研究员徐有伟和博士后郭世猛为该论文的共同第一作者。蒋轶、谢欣和徐华强研究员为共同通讯作者,上海药物所为第一完成单位。该工作获得了包括国家自然科学基金委、科技部重大专项,以及上海市市级科技重大专项等资金的资助。
      全文链接: https://www.nature.com/articles/s41421-022-00503-1

  • 原文来源:http://www.simm.ac.cn/web/xwzx/kydt/202301/t20230109_6597304.html
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    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2023-07-10
    •  速激肽是一种广泛分布于神经系统和免疫系统中的神经肽,通过激活三种速激肽受体(tachykinin receptor, NK1-3R)调控疼痛、血管舒张和激素释放等多种生理功能。三种内源性速激肽(SP、NKB及NKA)以不同的亲和力及较低的选择性激活三种速激肽受体NK1R、NK2R及NK3R。聚焦速激肽信号通路的激活机制研究,2022年7月26日,中国科学院上海药物研究所徐华强/尹万超团队联合中国科学技术大学田长麟/石攀团队成功解析了神经激肽受体NK2R与下游蛋白Gq的复合物冷冻电镜结构,揭示了内源性配体NKA选择性识别NK2R亚型的结构基础,阐明了神经激肽受体家族的独特的激活机制,相关成果发表于Cell Discovery上。   NK3R作为下丘脑-垂体-性腺轴调节中一个较为重要的受体,广泛分布于中枢和外周。研究发现,NK3R功能失调会影响包括体液平衡和抗利尿激素释放、心血管功能、运动、疼痛、精神状况、温度调节和生殖等许多生理功能。NK3R能以较高的亲和力被内源性配体速激肽B(NKB)所激活,其次是P物质(SP)及速激肽A(NKA)。Senktide是基于SP改造出的对NK3R具有高亲和力及特异性的多肽配体。然而,速激肽及其类似物senktide与速激肽受体3的激活机制仍然未知,这限制了针对NK3R的药物开发。   2023年6月30日,该联合团队再次在Cell Discovery在线发表题为“Structural insights into neurokinin 3 receptor activation by endogenous and analogue peptide agonists”的研究论文,成功解析了NKB、SP和senktide分别结合NK3R-Gq复合物的冷冻电镜结构,分辨率分别为2.8埃,2.9埃和3.0埃,该结构也是最后被解析的速激肽受体家族成员的高分辨结构。基于获得的高质量结构,研究人员探究了速激肽类激动剂共有保守基序与受体NK3R的作用机制。结构分析发现,速激肽NKB、SP及其类似物senktide序列中C端较为保守的氨基酸基序(-Phe-Xaa-Gly-Leu-Met-NH2)与NK3R跨膜区的残基之间形成广泛的相互作用;NK3R的正性结合口袋参与此共有保守基序互作的主要包括来自跨膜区的残基N1422.61、I1663.33、 Y3156.51、F3196.55、 N1382.57和Y3387.35。进一步的突变和功能实验,验证了这些互作在配体与受体的激活以及传递下游信号至关重要。   速激肽NKB、SP及其类似物senktide序列的N端氨基酸差异较大,推测其差异性导致多肽不同的亲和力,senktide的N端琥珀酰修饰的天冬氨酸可与NK3R的ECL3,ECL2及N端形成稳定的相互作用,N端氨基酸替换实验表明将该氨基酸突变为SP中对应的谷氨酰胺后功能实验显示亲和力显著下降。文中揭示的NK3R与内源性速激肽SP、NKB及其类似物senktide的结构和功能特性之间的相关性将有利于进一步合理开发针对NK3R的具有更高选择性的药物。   该研究成果阐明了内源性肽激动剂NKB和SP以及SP类似物senktide对NK3R的详细激活机制,为理解NK3R肽识别选择性的机制提供了重要的结构模板,并为设计针对NK3R的候选药物提供了线索。   本研究的第一作者为中国科学技术大学博士研究生孙文静、特任副研究员杨帆、博士研究生张欢欢, 以及上海市高峰电镜中心执行主任袁青宁。中国科技大学田长麟教授和石攀副教授,上海药物所徐华强研究员,上海药物所/中科中山药物创新研究院尹万超研究员为共同通讯作者。上海市高峰电镜中心参与该项研究部分冷冻数据的收集。该研究获得了包括上海市重大科技专项、国家自然科学基金委、国家卫健委重大科技专项、国家重点基础研究计划等经费的资助。   全文链接:https://www.nature.com/articles/s41421-023-00564-w
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    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2023-03-09
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