在武汉爆发包括非典型肺炎在内的呼吸系统疾病期间，患者中发现了以前未知的β-冠状病毒。新发现的冠状病毒类似于蝙蝠中发现的某些β-冠状病毒，但不同于先前已知的SARS-CoV和MERS-CoV。发现2019-nCoV和SARS-CoV之间存在高度序列同一性和相似性。在这项工作中，我们搜索了2019-nCoV所有非结构和结构蛋白的同源模板。在非结构蛋白中，前导蛋白（nsp1），木瓜蛋白酶样蛋白酶（nsp3），nsp4、3C样蛋白酶（nsp5），nsp7，nsp8，nsp9，nsp10，RNA定向RNA聚合酶（nsp12），解旋酶（nsp13），鸟嘌呤N7甲基转移酶（nsp14），尿嘧啶特异性内切核糖核酸酶（nsp15），2' -O-甲基转移酶（nsp16）和ORF7a蛋白可以在同源模板的基础上构建。在结构蛋白中，可以基于来自SARS-CoV的蛋白的晶体结构构建刺突蛋白（S蛋白），包膜蛋白（E蛋白）和核衣壳蛋白（N蛋白）。已知PL-Pro，3CL-Pro和RdRp是针对2019-nCoV设计抗病毒药物的重要目标。而且S蛋白是针对2019-nCoV抑制剂筛选或疫苗设计的关键靶标候选物，因为冠状病毒复制是由S蛋白与细胞表面受体结合而引发的。相信这些蛋白质应可用于进一步的基于结构的虚拟筛选以及相关的计算机辅助药物开发和疫苗设计。
