2020年3月9日,ChemRxiv预印平台发布了内蒙古医科大学药学院的题目为“Exploring the Active Compounds of Traditional Mongolian Medicine Agsirga in Intervention of Novel Coronavirus (2019-nCoV) Based on HPLC-Q-Exactive-MS/MS and Molecular Docking Method”的文章,旨在基于HPLC-Q-Exactive高分辨率质谱技术筛选Agsirga中的所有化合物,并通过分子对接技术从Agsirga的活性化合物中找到可以对2019-nCoV有反应的潜在抑制剂。
研究人员采用HPLC-Q-Exactive高分辨率质谱法对蒙古药Agsirga的复杂成分进行了鉴定,并通过高分辨率质谱Q-Exactive检测器进行分离。然后将Orbitrap探测器与高分辨率质谱联用,并使用chemsipider数据库和相关文献,结合精确的分子式(误差≤5×10-6)、保留时间、一级质谱和二级质谱信息,推导了这些化合物的质谱碎裂规律。以ACE2为受体,并以推导的化合物为配体,全部采用discover studio、autodock和Chem3D进行预处理。使用AutoDock分子对接软件研究了活性成分与靶蛋白之间的分子对接。利用配体和受体之间的相互作用为筛选抗2019-nCoV药物提供了选择。
结果表明,根据参考化合物的碎裂模式和查阅文献,通过HPLC-Q-Exactive-MS / MS方法在Agsirga中筛选并鉴定了96种主要生物碱和芪类化合物。结合分子对接,得出结论,蒙古药物Agsirga中存在潜在的活性物质,可以在分子水平上阻断ACE2和2019-nCoV的结合。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。