《基于HPLC-Q-Exactive-MS / MS和分子对接技术探索传统蒙药Agsirga中干预新型冠状病毒(2019-nCoV)的活性化合物》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-03-18
  • 2020年3月9日,ChemRxiv预印平台发布了内蒙古医科大学药学院的题目为“Exploring the Active Compounds of Traditional Mongolian Medicine Agsirga in Intervention of Novel Coronavirus (2019-nCoV) Based on HPLC-Q-Exactive-MS/MS and Molecular Docking Method”的文章,旨在基于HPLC-Q-Exactive高分辨率质谱技术筛选Agsirga中的所有化合物,并通过分子对接技术从Agsirga的活性化合物中找到可以对2019-nCoV有反应的潜在抑制剂。
    研究人员采用HPLC-Q-Exactive高分辨率质谱法对蒙古药Agsirga的复杂成分进行了鉴定,并通过高分辨率质谱Q-Exactive检测器进行分离。然后将Orbitrap探测器与高分辨率质谱联用,并使用chemsipider数据库和相关文献,结合精确的分子式(误差≤5×10-6)、保留时间、一级质谱和二级质谱信息,推导了这些化合物的质谱碎裂规律。以ACE2为受体,并以推导的化合物为配体,全部采用discover studio、autodock和Chem3D进行预处理。使用AutoDock分子对接软件研究了活性成分与靶蛋白之间的分子对接。利用配体和受体之间的相互作用为筛选抗2019-nCoV药物提供了选择。
    结果表明,根据参考化合物的碎裂模式和查阅文献,通过HPLC-Q-Exactive-MS / MS方法在Agsirga中筛选并鉴定了96种主要生物碱和芪类化合物。结合分子对接,得出结论,蒙古药物Agsirga中存在潜在的活性物质,可以在分子水平上阻断ACE2和2019-nCoV的结合。
    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

  • 原文来源:https://chemrxiv.org/articles/Exploring_the_Active_Compounds_of_Traditional_Mongolian_Medicine_Agsirga_in_Intervention_of_Novel_Coronavirus_2019-nCoV_Based_on_HPLC-Q-Exactive-MS_MS_and_Molecular_Docking_Method/11955273
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    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-03-12
    • 1.时间:2020年3月9日 2.机构或团队:内蒙古医科大学药学院 3.事件概要: 2020年3月9日,ChemRxiv预印平台发布了内蒙古医科大学药学院的题目为“Exploring the Active Compounds of Traditional Mongolian Medicine Agsirga in Intervention of Novel Coronavirus (2019-nCoV) Based on HPLC-Q-Exactive-MS/MS and Molecular Docking Method”的文章,旨在基于HPLC-Q-Exactive高分辨率质谱技术筛选Agsirga中的所有化合物,并通过分子对接技术从Agsirga的活性化合物中找到可以对2019-nCoV有反应的潜在抑制剂。 研究人员采用HPLC-Q-Exactive高分辨率质谱法对蒙古药Agsirga的复杂成分进行了鉴定,并通过高分辨率质谱Q-Exactive检测器进行分离。然后将Orbitrap探测器与高分辨率质谱联用,并使用chemsipider数据库和相关文献,结合精确的分子式(误差≤5×10-6)、保留时间、一级质谱和二级质谱信息,推导了这些化合物的质谱碎裂规律。以ACE2为受体,并以推导的化合物为配体,全部采用discover studio、autodock和Chem3D进行预处理。使用AutoDock分子对接软件研究了活性成分与靶蛋白之间的分子对接。利用配体和受体之间的相互作用为筛选抗2019-nCoV药物提供了选择。 结果表明,根据参考化合物的碎裂模式和查阅文献,通过HPLC-Q-Exactive-MS / MS方法在Agsirga中筛选并鉴定了96种主要生物碱和芪类化合物。结合分子对接,得出结论,蒙古药物Agsirga中存在潜在的活性物质,可以在分子水平上阻断ACE2和2019-nCoV的结合。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://chemrxiv.org/articles/Exploring_the_Active_Compounds_of_Traditional_Mongolian_Medicine_Agsirga_in_Intervention_of_Novel_Coronavirus_2019-nCoV_Based_on_HPLC-Q-Exactive-MS_MS_and_Molecular_Docking_Method/11955273
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    • 编译者:zhangmin
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    • 1.时间:2020年2月25日 2.机构或团队:内蒙古医科大学附属医院 3.事件概要: 内蒙古医科大学附属医院的研究人员在ChemRxiv预印版平台发表题目为“Exploring the Active Compounds of Traditional Mongolian Medicine in Intervention of Novel Coronavirus (2019-nCoV) Based on Molecular Docking Method”的文章,文章采用网络药理学分析、蛋白质对接和分子对接虚拟计算相结合的研究策略开展了蒙药活性成分在新型冠状病毒(2019-nCoV)干预中的研究。研究发现连翘苷和绿原酸能在分子水平上阻断2019-nCoV-S蛋白与ACE2的结合。两者均可作为2019-nCoV的潜在抑制剂用于进一步的研究和开发。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://chemrxiv.org/articles/Exploring_the_Active_Compounds_of_Traditional_Mongolian_Medicine_in_Intervention_of_Novel_Coronavirus_2019-nCoV_Based_on_Molecular_Docking_Method/11882838