PLOS 的使命是为了科学和社会的利益而革新学术交流,其中开放科学是关键所在。开放科学支持严谨性、可重复性、包容性和高效性,有助于加速科学发展、加强研究成效和提高研究成果的可信度。提高开放科学的普及率是充分受益的先决条件。PLOS努力通过政策促进开放,并为研究人员创造机会,让他们在PLOS期刊上发表论文时也能参与开放科学实践。
成功推动开放科学实践,应注意以下几点:
(1)所服务的研究群体;
(2)该群体当前的规范;
(3)开放科学行为如何随着时间的推移而变化,尤其是在应对新政策和新产品时。
结合其他研究活动,开放科学指标(Open Science Indicators, OSIs)是一个重要的数据来源,有助于我们制定解决方案,更好地为 PLOS 作者和整个研究社区服务。请继续阅读,了解我们为什么以及如何更全面、更一致地衡量 PLOS 的开放科学实践。
8.1 什么是开放科学指标?
OSI是已发表文献中有关开放科学实践的新信息来源。OSI是与DataSeer合作开发的,使用自然语言处理(NLP)和人工智能(AI)技术识别和衡量所有PLOS论文中的开放科学实践,并与相关的开放获取论文作为对比数据。该数据集始于2019年1月,每季度更新一次。
8.2 用开放科学指标衡量开放性
PLOS于2021年开始研发OSI,以便为数据驱动战略提供信息,从而实现以下目标:
(1)促进更多的开放科学实践;
(2)增加这些实践的益处和效果的证据。
但直到最近,除了让专家阅读每篇论文外,还没有一种简单的方法来衡量开放科学实践。PLOS以及研究资助者、机构和政策制定者都面临着同样的挑战。
在启动研发OSI之前,PLOS首先确定了6项指导原则。其中,大部分方法都是建立在其他人的工作基础之上的,如元研究者、工具开发者和社区认可的框架。OSI灵感来源包括 FAIR原则、Charité指标仪表盘以及一项关于PMC开放科学实践的荟萃分析。最近,法国开放科学监测机构和英国再现性网络等国家机构也分别创建了适合本国需求的解决方案或探索了开放科学实践的监测需求。
PLOS在制定指导原则时,认为OSI必须依赖于任何研究出版物中的公开文本和元数据,这样测量结果就不仅适用于PLOS,也适用于任何公开的研究论文。PLOS希望在短期内能够进行跨领域、跨地区和跨发表地的比较,并为将来能够轻松扩展到整个科学交流体系奠定基础。当然,PLOS还希望向所有人公开这些数据,供PLOS和其他组织使用。
8.3 选择第一批指标
PLOS期刊支持并促进各种开放科学实践,需要考虑优先衡量哪些开放科学指标。首先选择了三种与PLOS所服务的大部分研究人员高度相关,因此极有可能被广泛采用的做法:数据共享、代码共享和预印本发布。
(1)数据共享
数据是研究的原始产出。读者依靠原始科学数据来加深对已发表研究成果的理解。数据是验证、复制和再分析的关键,可为未来的研究提供信息,并为系统综述或荟萃分析提供依据。
PLOS首创的数据可用性政策要求作者在发表文章时提供支撑其结论的原始数据。PLOS数据可用性政策为作者提供了多种共享数据的选择,具体取决于哪种方式最适合他们和他们的稿件。同时,PLOS认为数据库是最有效、最有影响力的共享方式,OSI能够跟踪最佳实践的进展。
(2)代码共享
如果没有了解数据如何生成和分析的背景,没有验证和重复研究的工具,数据的意义就无从谈起。用开放代码来充实研究文章可以加深理解,促进可重复性和再分析,增强可信度,并节省其他研究人员的时间和精力,从而提高整个科学系统的效率。
所有PLOS期刊都大力鼓励代码共享,而PLOS计算生物学期刊则强制要求共享代码。
(3)预印本
预印本使研究人员能够控制自己的学术交流,从而实现更高效、更全面的共享。研究人员利用预印本确立首发权、发布成果、寻求社区反馈、吸引读者群,并有助于申请基金、工作或终身职位。
PLOS期刊一直鼓励预印本发布,自2018年起,PLOS在投稿环节提供预印本发布便利,帮助作者更轻松地完成投稿过程。
8.4 展望未来
衡量数据共享、代码共享和预印本发布情况,能够了解开放科学实践的现状,也是根据研究人员的实际行为规划未来发展方向的重要环节。PLOS使用OSI指导决策。例如:
(1)优先考虑将"可访问数据图标"扩展到哪些资料库;
(2)监控新解决方案的有效性,例如PLOS与EarthArXiv的整合,以及PLOS计算生物学的代码共享政策;
(3)了解不同学科和地区研究人员的开放科学实践,根据他们的需求调整系统和政策,并更广泛地分享所学到的知识。
未来,PLOS将为开放科学指标数据集添加更多的数据点和新指标,并将其扩展到更多的对比内容中。PLOS还将把从OSI中获得的定量见解与其他信息来源相结合,例如已发表的定性研究,以及对不同社区和实践进行的新颖调查。将定性见解与定量见解相结合,可以更全面地反映研究质量和影响。