由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的2019年冠状病毒病(COVID-19)是国际关注的突发公共卫生事件。但是,到目前为止,关于病毒的来源及其中间宿主仍存在争议。在这里,我们发现新型冠状病毒与源自五种野生动物的冠状病毒密切相关,这些动物包括花面狸(Paguma larvata)、椰子狸(Paradoxurus hermaphroditus)、果子狸(Civet)、三叶蹄蝠(Aselliscus stoliczkanus)和中华菊头蝠(Rhinolophus sinicus),并且位于系统发育树的同一分支中。但是,基因组和ORF1a同源性表明该病毒与来自这五种动物的冠状病毒不是同一冠状病毒,而该病毒与蝙蝠冠状病毒分离株RaTG13的同源性最高。