《上海药物所徐华强课题组合作解析糖皮质激素与GPR97和Go蛋白复合物的冷冻电镜结构》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2021-01-10
  • 中国科学院上海药物研究所徐华强研究员团队与山东大学孙金鹏教授团队、浙江大学张岩教授团队等首次解析了糖皮质激素与其膜受体GPR97和Go蛋白复合物的冷冻电镜结构,这也是国际上首次解析的黏附类GPCR与配体和G蛋白复合物的高分辨率结构。该研究成果 Structures of glucocorticoid-bound adhesion receptor GPR97-Go complex 于2021年1月6日在线发表于Nature杂志。

      黏附类G蛋白偶联受体(Adhesion G protein-coupled receptors, aGPCRs)是GPCR超家族成员之一,在生物体许多重要的生理过程中发挥关键分子开关的作用,如脑的发育、水盐调节、炎症以及细胞命运决定等。与GPCR超家族其它成员相比,aGPCRs除了具有经典的7次跨膜核心(7TM)外,还具有较长的胞外区域,组成了拥有不同功能的结构域。目前普遍认为aGPCRs可被结合胞外的基质蛋白或可溶性小分子激活,然而,小分子配体是否可以直接结合7TM并激活受体尚不清楚。

      糖皮质激素对机体的发育、生长、代谢以及免疫等功能发挥着重要的调节作用,是机体应激反应最重要的调节激素和临床上使用最为广泛的抗炎和免疫抑制剂之一。经典理论认为,糖皮质激素通过与糖皮质激素核受体结合,并穿过核孔,在细胞核内发挥调控相关基因表达的作用。该作用方式通常需要较长的反应时间,被称为基因组机制。徐华强课题组分别在2002年和2014年解析了糖皮质激素核受体与地塞米松(Cell, 110: 93-105)和内源性糖皮质激素----氢化可的松(Cell Research, 24: 713–726)的晶体结构,揭示了糖皮质激素识别和功能调控其核受体的机制,推动了糖皮质激素受体靶向药物的开发。另一方面,糖皮质激素也被发现能够快速引起细胞和机体的变化,提示生物体内可能存在着糖皮质激素的膜受体,其能够介导糖皮质激素的快速反应。研究发现,糖皮质激素的快速反应与G蛋白有密切关系,Gi的抑制剂PTX能够抑制糖皮质激素的快速作用,并据此推测GPCR是糖皮质激素的潜在膜受体。山东大学孙金鹏教授和易凡教授团队等对GPR97进行了大量受体生理学和内源性配体发现等工作,发现包括糖皮质激素类的氢化可的松、可的松以及11-脱氧皮质醇等在内的内源性类固醇激素都能够激活GPR97,其中地塞米松具有更强的GPR97激活能力,并最终确认Go是GPR97激活后偶联的G蛋白通路。

      在前期工作的基础上,联合团队采用单颗粒冷冻电镜技术,分别对外源配体倍氯米松(BCM)以及内源性配体氢化可的松(cortisol)激活GPR97后形成的复合物进行了结构解析,最终分别获得了两个配体激活态的GPR97受体与Go蛋白的复合物结构,分辨率分别为3.1埃和2.9埃(图1a和1b)。

    相对其它GPCR亚家族成员,GPR97的7TM呈现独特的空间分布,其螺旋也展现出与其它受体不同的长度;根据传统理论,aGPCR特有的胞外GAIN结构域和7TM在激活GPCR的过程中作为整体发挥其核心功能,然而,研究人员在结构中首次发现糖皮质激素结合在GPR97 7TM核心中的一个椭圆形正构结合口袋(图1c);此外,GPR97展现出不同于其他A类GPCR成员的独特激活机制。GPR97序列中不含有保守的PIF、DRY和NPxxY等motif,其首先通过toggle switch W6.53 识别配体并被激活。激活的受体借助首次发现的upper Quaternary core(UQC)将受体TM3-TM5-TM6捆绑在一起,继而通过HLY motif介导与Go蛋白的结合。受体7TM组成较大的胞内侧G蛋白结合口袋,3个胞内环都参与了受体与G蛋白的相互作用,胞内环与受体的组成性激活密切相关;在本项研究中,研究人员还首次阐述了G蛋白的棕榈酰化修饰在其偶联GPCR中的关键作用。研究首次发现Gαo的α5螺旋C351位点被棕榈酰化修饰(图2),并进一步验证了该修饰在Go与GPR97的偶联中的独特作用。

    综上,合作团队首次发现了糖皮质激素的高亲和力膜受体,并通过单颗粒冷冻电镜技术,解析了黏附类GPCR家族中GPR97在糖皮质激素的激活作用下与Go蛋白复合物的结构,从而在近原子分辨率上揭示了糖皮质激素识别并激活膜GPR97,以及受体偶联Go蛋白的分子机制。该成果将对糖皮质激素膜受体功能研究和黏附类GPCR的激活机制理解发挥了重要的示范和推动作用。

      上海药物所为本研究的第一完成单位,上海药物所与山东大学基础医学院联合培养博士生平玉奇,浙江大学基础医学院博士后毛春友,山东大学基础医学院副教授肖鹏、硕士研究生赵儒嘉,上海药物研究所蒋轶研究员为本文共同第一作者;山东大学孙金鹏教授、浙江大学基础医学院张岩教授以及上海药物所徐华强研究员为共同通讯作者,山东大学易凡教授和于晓教授为本文的共同作者。本研究得到国家基金委、科技部、上海市科委等单位的基金资助。

  • 原文来源:https://doi.org/10.1038/s41586-020-03083-w;http://www.simm.ac.cn/web/xwzx/kydt/202101/t20210106_5853197.html
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    • 编译者:hujm
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    • 近日,中国科学院上海药物研究所徐华强研究员、余学奎研究员,北京协和医院张抒扬教授以及中国科学院武汉病毒研究所张磊珂副研究员等研究人员在新冠重要药靶RNA复制酶研究领域取得重要进展,首次解析了新冠病毒基因复制酶结合老药苏拉明复合物的冷冻电镜结构,分辨率为2.6埃,这也是国际上第一个解析的非核苷类抑制剂结合新冠病毒RNA复制酶的三维结构。该研究成果3月5日以长文形式在线发表于国际期刊《自然-结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)。   新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情自暴发以来,已经在全球范围内蔓延,寻找一套安全有效的治疗方案依旧非常迫切。迫于直接抗病毒药物研发的紧急需求,筛选已上市药物用于治疗和预防新冠病毒有望从一个独特的途径开展抗COVID-19药物研发。   新冠病毒RNA复制酶负责子代病毒基因组的复制,在序列和结构上都非常保守,即使是在变异频率很高的RNA病毒中也很少发生突变,同时在人体细胞也没有同源蛋白,是非常重要的抗病毒靶点。根据病毒RNA复制酶抑制剂的化学结构和作用机制的差异,抗病毒药物研发分为核苷类抑制剂和非核苷类抑制剂两个方向。对于核苷类抑制剂的作用机制研究,徐华强研究团队与合作者前期利用冷冻电镜三维重构技术首次解析了新冠病毒RNA复制酶结合RNA与核苷类药物瑞德西韦复合物2.5埃的冷冻电镜结构,揭示了瑞德西韦以单磷酸的形式共价结合在引物链的+1位,使RNA处于转位前的状态,直接抑制了新冠病毒RNA复制酶的活性。而非核苷类抑制剂不需要经过细胞内的磷酸化来获取活性形式,直接作用于病毒复制合酶,引起酶的失活;同时其具有结构多样、高效低毒以及可与其它作用机制的抗病毒药物协同作用等特性,早已用于常见热门病毒防治上。   针对新冠病毒RNA复制酶开展非核苷类抑制剂的发现和机制研究,将有助于开发更有效的抗新冠病毒药物。鉴于此,张抒扬研究团队在前期工作基础上,从老药库中筛选活性化合物,发现百年老药苏拉明可以有效抑制新冠病毒RNA复制酶,在酶水平上是瑞德西韦的三磷酸活性形式的20倍以上;同时,在细胞水平上也具有较强的抑制新冠病毒复制的能力。   徐华强研究团队与合作者采用单颗粒冷冻电镜技术,解析了苏拉明结合新冠病毒RNA复制酶复合物的三维结构。从解析的结构看,有两个苏拉明分子结合在新冠病毒RNA复制酶的活性中心里,其中一个苏拉明分子占据了模板链结合的位点;另一个苏拉明分子占据了在引物链所在的催化活性中心的位置,揭示了苏拉明通过自身的强电负性的结构特点,竞争性地抑制新冠病毒RNA复制酶结合病毒基因序列,进而抑制了新冠病毒RNA复制酶的活性,这与研究团队利用凝胶迁移功能实验检测到的结果一致。随后,通过对比苏拉明和苏拉明衍生物结合诺如病毒RNA复制酶的晶体结构,研究显示出苏拉明对不同的病毒RNA复制酶的调控机制是有区别的。研究人员最后系统检测了苏拉明衍生物,发现了多个比苏拉明具有更强抑制作用的化合物分子,可以用于后续苏拉明衍生物的改造,进行抗病毒药物研发。   该项研究对理解苏拉明抑制新冠病毒RNA复制酶的分子机制奠定了结构基础,拓展了对非核苷类抑制剂作用机制的认识,有望推进靶向RdRp的非核苷类抑制剂的药物研发。   上海药物所尹万超副研究员为论文第一作者,清华大学医学院博士生栾晓东、药物所李智海副研究员和博士生周紫薇,以及武汉病毒所博士生王清星为该论文的共同第一作者。徐华强研究员、张抒扬教授、余学奎研究员及张磊珂副研究员为共同通讯作者。上海药物所为本研究第一完成单位。研究工作同时得到了上海药物所蒋华良院士和武汉病毒所肖庚富研究员的支持和帮助。该工作得到国家重点研发计划、上海市市级科技重大专项、科技部重点研发计划、中国科学院战略性先导科技专项、中国科学院青年创新促进会、国家自然科学基金委等项目的资助。