《 本期目录 | 过刊浏览 | 常用肿瘤基因分析方法及基于TCGA数据库的分析应用》

  • 来源专题:生物安全网络监测与评估
  • 编译者: yanyf@mail.las.ac.cn
  • 发布时间:2019-03-06
  • 第二代测序(NGS)技术的发展提供了大量的数据,将癌症研究的重点从多物种测序转移到通过高通量测序分析和比较选择的数据。NGS还促进了现有遗传数据分析方法的多样性,促进了高通量基因组学分析方法的不断优化和创新,促进了遗传数据挖掘和分析模型的快速发展。癌症基因组图谱(TCGA)数据库是这项工作的直接成果。TCGA数据库提供了从肿瘤患者样本中收集的遗传数据的全面记录,包括其DNA序列、转录信息、表观遗传修饰和相关信息。本文综述了肿瘤基因组学的挖掘算法和分析方法的最新进展。特别地,我们介绍和回顾了TCGA数据库和数据分析方法,并通过典型案例论证了其适用性。这篇综述可能为研究人员利用bid数据发现新的肿瘤相关靶点提供帮助。

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    • 来源专题:生物安全网络监测与评估
    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间:2019-03-06
    • 第二代测序(NGS)技术的发展提供了大量的数据,将癌症研究的重点从多物种测序转移到通过高通量测序分析和比较选择的数据。NGS还促进了现有遗传数据分析方法的多样性,促进了高通量基因组学分析方法的不断优化和创新,促进了遗传数据挖掘和分析模型的快速发展。癌症基因组图谱(TCGA)数据库是这项工作的直接成果。TCGA数据库提供了从肿瘤患者样本中收集的遗传数据的全面记录,包括其DNA序列、转录信息、表观遗传修饰和相关信息。本文综述了肿瘤基因组学的挖掘算法和分析方法的最新进展。特别地,我们介绍和回顾了TCGA数据库和数据分析方法,并通过典型案例论证了其适用性。这篇综述可能为研究人员利用bid数据发现新的肿瘤相关靶点提供帮助。
  • 《北极研究分析网站—ARMAP》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:mall
    • 发布时间:2017-06-20
    • 北极研究测绘应用网站(ARMAP)刚刚发布了一个新的改进版本,该版本增加了以下功能: 1. 可查看自1997年以来,由NSF和17个其他机构资助的2700多个项目的物流基础和细节,了解由美国资助的北极研究项目情况(如谁在哪里做什么研究?)。 2. 在具有更多信息链接的周期底图上浏览项目地点。 3、可按照学科、基金机构、项目、项目名称、调查员姓名、地区、年份等进行搜索和筛选。 4. 查看相关地图层,如船舶轨道、研究天文台和医疗设施。 5. 使用ARMAP阅读器进行科学规划、物流协调和协作等。 ARMAP与相互联系的项目数据生命周期配套,重点是Web地图应用程序、各种科学层次、文本搜索工具、总结动画、分层ISO元数据以及交互操作的Web服务等信息。新版本的阅读器基于HTML5和JavaScript,改进了搜索和过滤功能,可以实现洁净、快速和现代化的用户体验。 “北极观察员”(the Arctic Observing Viewer)的一个配套应用程序涵盖了超过13,000个具有数据链接的特定监测站点。在程序内可查询到研究项目资助的资金、研究结果和其他相关的具体研究细节。 如果想体验ARMAP的新版本,可以访问:http://armap.org。 (李亚清 编译)