2月21日_通过计算药物重组的方法快速鉴定治疗冠状病毒病COVID-19的潜在药物
1.时间:2020年2月21日
2.机构或团队:匹兹堡大学
3.事件概要:
匹兹堡大学的研究人员于2020年2月21日在ChemRxiv发表题为“Fast Identification of Possible Drug Treatment of Coronavirus Disease -19 (COVID-19) Through Computational Drug Repurposing Study”的文章。
最近暴发的新型冠状病毒病COVID-19急需相关的药物治疗策略。应用计算机辅助药物设计技术,快速鉴别市场上药物的再利用是非常有效的,特别是关键病毒蛋白的三维结构被破解之后。利用COVID-19蛋白酶与共价结合抑制剂的复合体的晶体结构,在临床试验中对批准的药物和候选药物进行虚拟对接筛选,并进行分子动力学模拟,使用MM-PBSA-WSAS.2-4端点方法计算结合自由能。几种作为COVID-19蛋白酶潜在抑制剂的药物脱颖而出,包括Carfilzomib、eravaccycline、Valrubicin、Lopinavir和Elbasvir。Carfilzomib是抗肿瘤药物,作为蛋白酶体抑制剂,具有最好的MM-PBSA-WSAS结合自由能-13.82kcal/mol;链霉素,是抗生素和带电分子,有一些抑制作用,带电形式的结合自由能预测值(-3.82kcal/mol)远不及中性形式(-7.92 kcal/mol),生物活性物质PubChem 23727975的结合自由能为-12.86kcal/mol。研究人员分析了受体与配体的相互作用,确定了受体与配体结合的热点,发现残基HIS41是许多病毒的保守残基,包括COVID-19、SARS、MERS和HCV。这项研究结果有助于以COVID-19蛋白酶为靶点的进行合理的药物设计。
4.附件:
链接https://chemrxiv.org/articles/Fast_Identification_of_Possible_Drug_Treatment_of_Coronavirus_Disease_-19_COVID-19_Through_Computational_Drug_Repurposing_Study/11875446
匹兹堡大学的研究人员于2020年2月21日在ChemRxiv发表题为“Fast Identification of Possible Drug Treatment of Coronavirus Disease -19 (COVID-19) Through Computational Drug Repurposing Study”的文章。
最近暴发的新型冠状病毒病COVID-19急需相关的药物治疗策略。应用计算机辅助药物设计技术,快速鉴别市场上药物的再利用是非常有效的,特别是关键病毒蛋白的三维结构被破解之后。利用COVID-19蛋白酶与共价结合抑制剂的复合体的晶体结构,在临床试验中对批准的药物和候选药物进行虚拟对接筛选,并进行分子动力学模拟,使用MM-PBSA-WSAS.2-4端点方法计算结合自由能。几种作为COVID-19蛋白酶潜在抑制剂的药物脱颖而出,包括Carfilzomib、eravaccycline、Valrubicin、Lopinavir和Elbasvir。Carfilzomib是抗肿瘤药物,作为蛋白酶体抑制剂,具有最好的MM-PBSA-WSAS结合自由能-13.82kcal/mol;链霉素,是抗生素和带电分子,有一些抑制作用,带电形式的结合自由能预测值(-3.82kcal/mol)远不及中性形式(-7.92 kcal/mol),生物活性物质PubChem 23727975的结合自由能为-12.86kcal/mol。研究人员分析了受体与配体的相互作用,确定了受体与配体结合的热点,发现残基HIS41是许多病毒的保守残基,包括COVID-19、SARS、MERS和HCV。这项研究结果有助于以COVID-19蛋白酶为靶点的进行合理的药物设计。