《应用程序PIXLS使预印本更易于用作信息来源》

  • 来源专题:科技期刊发展智库
  • 编译者: 于世博 杨恒
  • 发布时间:2023-02-28
  •   2023 年 1 月,德国生命科学信息中心(Informationszentrum Lebenswissenschaften, ZB MED)发文称,由Philipp Schaer教授领导的TH K?ln工作组和由Konrad F?rstner教授领导的ZB MED工作组,将在未来三年内开发一个应用程序PIXLS,用于自动打开预印本服务器。该项目由德国研究基金会(Die Deutsche Forschungsgemeinschaft , 简称DFG )资助。

      PIXLS系统地开放了预印本服务器上以前被忽视的信息来源,并通过增值服务使其更易于访问,这样可以更轻松地对全文和元数据进行再利用。PIXLS团队依赖于信息提取管道,该应用程序从预印本的非结构化数据(即连续文本或数字)中提取结构化信息,数据库可以更好地处理此类结构化信息。因此,它们可以以多种方式重用,也更容易找到。

      提取的数据会在 ZB MED 知识环境中合并和标准化——ZB MED 已经开发的数据库,然后,该数据库将开发增值服务使它们可用于研究。例如,开放数据接口或声誉和趋势指标。这些数据也将通过 ZB MED 的发现服务 LIVIVO 提供。本着开放科学的精神,数据和技术都可供图书馆和科学界重复使用。

      相关背景:德国生命科学信息中心,是生命科学数据和信息的德国国家基础设施和研究中心。目标是为全国提供医学、保健、营养、环境和农业科学及其基础科学和外围领域的信息和文献,以满足研究、教学和实践的需要。

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  • 《提升玉米处理效率的应用程序》

    • 来源专题:农业科技前沿与政策咨询快报
    • 编译者:李晓曼
    • 发布时间:2017-11-28
    • 威斯康星大学麦迪逊分校(UW-MADISON)的生物系统工程助理教授布赖恩·拉克(Brian Luck)和电气与计算机工程副教授丽贝卡·惠勒特(Rebecca Willett)共同开发了一款新应用程序,可以帮助农民在秋季玉米收获期间节省时间和资金,而且还可以全年让奶牛更高产。 一、问题提出 当前的玉米秸秆在通过收割机的两个磨轮间隙后,玉米颗粒即被加工粉碎。但是,机器的磨损会使加工效果变差,并且玉米的差异性使得某些玉米会更不容易粉碎。因此,农民可以通过控制收割机械的磨轮间距,在一定程度上来微调产量:调窄间距,玉米颗粒外皮的受挤压程度会更强烈,但也会使设备工作效率降低,意味着收获速度变慢;调宽间距,机器运转会更快,但是会留下比较多的颗粒完整的玉米。 “主要的问题是,当收割机穿过农田时农民无法判断玉米颗粒的破碎程度。”拉克说。尽管农民很容易辨识到收获来的玉米中会有颗粒完整的、外皮未被粉碎的情况,可他们不能辨识出粉碎的玉米占比。玉米收割后,农民将他们的玉米样品送到商业实验室,烘干玉米颗粒后将其放入一个大型的专用设备,经过九层振动旋转筛子进行分拣,最终得到一个整体的玉米青贮加工得分。而这个分值决定了玉米作为动物饲料的价值。 如果70%的玉米碎粒能进入并通过标准饮用吸管的孔径,那么这份玉米的青贮加工得分会很高。不幸的是,对于许多农民来说,实验室的结果并不太理想,这意味着他们必须每天给奶牛提供更多的谷物以满足它们的营养需求。因此,设计一款效率高、速度快且适应能力强的应用程序变得很重要。 二、工具简介 这个创新工具不是实体农具,而是一款智能手机应用程序。农民只需要提供少量的收获玉米,该应用程序就可以测量收割机的效果。而且无须离开田间,就能获得高质量的玉米碎粒。玉米碎粒的外层硬皮破开后,会露出里面的营养物质淀粉。“破碎后的玉米作为饲料更易于消化,所以奶牛吃了产奶会更多,”威斯康星大学麦迪逊分校的生物系统工程助理教授,兼威斯康星大学拓展学院(University of Wisconsin Extension)的专家布赖恩·拉克说道。另外,根据威斯康星大学麦迪逊分校的乳品科学研究所(Dairy Science Department)的研究发现,优质的玉米碎粒可以使每头奶牛每天的产奶量提高两磅(或约一夸脱)。 三、工具使用 要使用这个应用程序,农民只需提供少量玉米作为样品。把样品摊开并将一枚硬币放在旁边,用手机对准硬币校对像素大小进行拍照。将照片输入软件就可以利用图像处理算法在现场计算出玉米内核加工分值,而无需等收获几周后在外部实验室计算。根据应用程序的玉米内核加工分值和汇总统计数据,农民可以当场调整他们的机器,而不是在收获结束后制定应急计划。初步结果表明,从应用程序返回的分值与实验室做的玉米青贮加工分值非常接近。 智能手机应用程序能够方便、准确地提供一套解决方案,实现现场、事后及时处理问题,获取理想分值。应用程序提供给农民的信息,让他们从不确定中得以解放,避免玉米价格升高时,人们恨不得对每一根玉米都进行精加工;而到了丰收年头,却面临玉米饲料价格过低的情况。“一切都取决于数据,”拉克说道,“效率的提升取决于收集数据的质量。” (编译 李晓曼)
  • 《bioRxiv预印本评论》

    • 来源专题:科技期刊发展智库
    • 编译者:于世博
    • 发布时间:2022-12-29
    • 1. 评论的意义。bioRxiv使得研究人员能立即公开研究成果,以支持科学研究的快速共享。bioRxiv评论面向所有公众开放,以期通过评论交流改进预印本,具体措施包括:允许读者公开评论有关预印本的反馈或疑问,允许公众提问并与作者或社区其他成员分享建设性的观点和意见,评论可以包含额外的参考资料、关于方法的问题或说明、向作者征寻额外信息的请求,甚至是完整的同行评议。   bioRxiv允许作者可以在评论区与读者互动,回复读者提出的任何问题或解释说明预印本的内容。此外,将私人通信(一般指电子邮件)转移到公开评论论坛可使整个社区受益,作者只需回复一次类似的问题以节省时间,读者也可立即访问到原本耗时很久才可获取的信息。 2. 如何发表评论。读者使用 Disqus 平台发表评论(见图6),点击评论图标(在摘要上方的启动栏左起第一个),可打开评估仪表板中的评论选项卡。评论者选择以下任一方式(Disqus、Facebook、Twitter、Google)登录或以访客身份发帖(选择 Disqus 图标并选择“我愿意以访客身份发帖”复选框),同时也可以单击现有评论下方的“回复”链接,直接对先前评论的进行回复。 图6 bioRxiv的评论界面 图片来源:https://connect.biorxiv.org/news/images/comments1.png 3.社区准则。评论的目的是丰富预印本的对话,并提供一个讨论预印本的场所,因此: ●评论必须与预印本相关。 ●评论必须以英文撰写。 ●评论必须是唯一的(不能重复发布)。 ●评论不包括审稿人姓名或期刊名称。 ●评论可包含需要经过筛选后的链接。 ●评论必须文明道德,尊重他人。包含以下内容的评论将不会发布:   辱骂、人身攻击、种族主义/性别歧视/仇外心理/绝对主义/宗教诽谤、淫秽、粗俗、亵渎、诽谤、煽动暴力、商业宣传、教唆、冒名顶替、语无伦次(以及任何不利于科学讨论的言论)。 编译:于世博、刘敬仪