巴西马瑙斯的SARS-CoV-2感染病例在2020年底重新出现，尽管此前感染率很高。对2020年11月至2021年1月在马瑙斯采样的病毒进行基因组测序，发现了一种新的SARS-CoV-2变种的出现和传播。谱系P.1获得17个突变，包括与人类ACE2受体结合增强相关的棘突蛋白（K417T、E484K和N501Y）中的三个突变。分子钟分析显示，P.1的出现发生在2020年11月中旬左右，之前是一个分子进化较快的时期。利用整合基因组和死亡率数据的两类动力学模型，我们估计P.1的可传播性可能高出1.7-2.4倍，并且先前（非P.1）感染提供了54-79%的P.1感染保护，而非P.1感染提供了54-79%的保护。增强的全球基因组监测关注的变种，可能表现出增加的传染性或免疫逃避，是至关重要的，以加速大流行反应。
