《苏州医工所韩坤课题组在丙型肝炎病毒检测方面取得系列进展》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2022-05-18
  • 丙型肝炎病毒(HCV)是一种正链RNA病毒,属于黄病毒科。HCV感染大多数早期无明显症状,长期感染可发展为肝纤维化、肝硬化,甚至发展为肝癌,严重危及患者生命健康。在临床诊断方面,抗体血清学检测和实时荧光定量PCR检测被认为是诊断HCV感染的金标准。由于检测方法的限制,抗体血清学无法对处于感染窗口期的丙肝病毒进行检测。实时荧光定量PCR由于操作相对繁琐、人员专业化程度要求高和设备昂贵等因素,极大地限制了丙肝病毒早期诊断的应用推广。因此,建立一种灵敏度高、特异性强的HCV RNA检测新方法,对丙肝病毒早期诊断具有重要意义。

      为获得更为直观的检测方式,尽可能摆脱传统检测手段的诸多限制,中国科学院苏州医工所韩坤课题组以石墨烯量子点/银纳米颗粒复合物为基础,设计了可视化的HCV检测新方法。在室温条件下,通过原位生长的方式制备石墨烯量子点/银纳米颗粒复合物,该复合物既解决了银纳米颗粒的易团聚的问题,又可作为显色基底实现直观的信号输出。当有靶标HCV RNA存在时,通过DNA行走策略,触发催化发卡环自组装反应,可将葡萄糖氧化酶偶联至发卡环末端。葡萄糖氧化酶可催化产生过氧化氢,将淡黄色的石墨烯量子点/银纳米颗粒复合物转化为无色透明。该策略在HCV RNA检测时,检测限低至24.84 pM,在HCV RNA的早期诊断方面具有潜在应用。

     该研究成果“A visual method for determination of hepatitis C virus RNAs based on a 3D nanocomposite prepared from graphene quantum dots”发表在一区杂志Analytica Chimica Acta上((2022), 1203, 339693),李夷飞为第一作者,韩坤研究员和苏州大学附属第一医院陈祖涛主任为共同通讯作者。

        论文链接:https://doi.org/10.1016/j.aca.2022.339693

      该项工作得到国家自然科学基金(31500805)、中国科学院青年创新促进会(2015261)、“江苏省333高层次人才培养工程”和苏州市科技计划项目(SYG201508)等项目的经费支持。

      此外,围绕HCV的窗口期诊断的需求,团队前期将碳基纳米材料的特殊性能和生物传感策略有机结合,发展了多种基于碳基纳米材料的HCV核酸的检测方法。如:基于氧化石墨烯对单链DNA和双链DNA吸附力的显著差异,构建了一种核酸辅助的磁性石墨烯与铜纳米颗粒的纳米复合物体系,实现HCV亚型核酸的电化学灵敏检测。基于葫芦脲[7]和亚甲基蓝的主客体作用以及核酸外切酶III的信号放大,进一步降低检测限。

      上述方法为HCV的早期诊断提供了新思路,下一步该团队将进一步提高检测结果的灵敏性和稳定性,推动该技术在丙型肝炎的早期诊断和筛查中的转化应用。

  • 原文来源:http://www.sibet.cas.cn/kxyj2020/kyjz_169572/202205/t20220516_6449026.html
相关报告
  • 《丙型肝炎病毒检测方面取得进展》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-05-24
    • 丙型肝炎病毒(HCV)是一种正链RNA病毒,属于黄病毒科。HCV感染大多数早期无明显症状,长期感染可发展为肝纤维化、肝硬化,甚至发展为肝癌,严重危及患者生命健康。在临床诊断方面,抗体血清学检测和实时荧光定量PCR检测被认为是诊断HCV感染的金标准。由于检测方法的限制,抗体血清学无法对处于感染窗口期的丙肝病毒进行检测。实时荧光定量PCR由于操作相对繁琐、人员专业化程度要求高和设备昂贵等因素,极大地限制了这一检测方式的应用推广。因此,建立一种灵敏度高、特异性强的HCV RNA检测新方法,对丙肝病毒早期诊断具有重要意义。 为获得更为直观的检测方式,尽可能摆脱传统检测手段的诸多限制,中国科学院苏州生物医学工程技术研究所韩坤课题组等以石墨烯量子点/银纳米颗粒复合物为基础,设计了可视化的HCV检测新方法。在室温条件下,通过原位生长的方式制备石墨烯量子点/银纳米颗粒复合物,该复合物既解决了银纳米颗粒的易团聚问题,又可作为显色基底实现直观的信号输出。当有靶标HCV RNA存在时,通过DNA行走策略,触发催化发卡环自组装反应,可将葡萄糖氧化酶偶联至发卡环末端。葡萄糖氧化酶可催化产生过氧化氢,将淡黄色的石墨烯量子点/银纳米颗粒复合物转化为无色透明。该策略在HCV RNA检测时,检测限低至24.84 pM,在HCV RNA的早期诊断方面具有潜在应用。 相关研究成果以A visual method for determination of hepatitis C virus RNAs based on a 3D nanocomposite prepared from graphene quantum dots为题发表在Analytica Chimica Acta上。该项工作得到国家自然科学基金、中国科学院青年创新促进会和苏州市科技计划项目等项目的经费支持。 此外,围绕HCV的窗口期诊断的需求,团队前期将碳基纳米材料的特殊性能和生物传感策略有机结合,发展了多种基于碳基纳米材料的HCV核酸检测方法,如基于氧化石墨烯对单链DNA和双链DNA吸附力的显著差异,研究人员构建了一种核酸辅助的磁性石墨烯与铜纳米颗粒的纳米复合物体系,实现了HCV亚型核酸的电化学灵敏检测。基于葫芦脲[7]和亚甲基蓝的主客体作用以及核酸外切酶III的信号放大,进一步降低了检测限。  
  • 《苏州医工所缪鹏课题组在ctDNA高灵敏检测方面取得进展》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-04-19
    •  核酸检测的应用主要包括病原体分析、遗传疾病鉴定、肿瘤早期诊断、酶活分析等。例如,循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA, ctDNA)是一种来源于恶性细胞的游离DNA片段,携带肿瘤特异性序列改变。ctDNA释放的确切机制目前仍未知,推测可能与濒死细胞的凋亡或坏死有关。通过对ctDNA的定量分析可以获得一系列肿瘤病灶的信息,包括基因点突变、基因组完整程度等。因此ctDNA是一种个性化的肿瘤标志物,在癌症诊断和恶性程度评估等方面能够起到关键作用。   近期,苏州医工所缪鹏研究员课题组发展了一种基于环状双足DNA步行反应的电化学纳米机器,用于ctDNA等核酸指标的高灵敏分析。   首先通过序列设计在DNA探针A与B之间搭建pH可控调节的分子间三螺旋DNA纳米结构,构建出可再生的修饰电极界面。   随后,设计了一种简单有效的链置换策略来放大目标核酸序列的信息。通过将引物与模板序列进行一体化设计,整合于单条发夹结构DNA探针中,有效提升了反应速率,在目标核酸序列存在条件下可生成大量包含目标序列的单链DNA用于下游反应。   接着,发展了环状双足DNA步行反应策略。设计的哑铃结构DNA探针环部分包含有DNA核酶,初始状态下无法与电极界面轨道链结合反应,处于失活状态。当其被上步链置换反应产生的单链DNA所作用时,可逐步释放哑铃环,同时,该探针的5’和3’端之间依次发生自身杂交,形成环状DNA结构。环状双足步行链可进一步与修饰有轨道链的电极发生作用,持续催化裂解反应从而诱导电化学响应的变化。   基于该策略,在优化的实验条件下实现了2.2 aM(约1.3 copy/μL)的核酸检测灵敏度。此外该方法具有良好的序列选择性。进一步对临床血清样本、咽拭子样本等进行了测试验证,通过对异常电化学信号的分析可以在健康对照组中有效分辨出相应患者。该策略也为目前迫切需求的急性感染性疾病病毒核酸检测提供了一种快速高灵敏的新方法。   相关工作得到了国家重点研发计划(2017YFE0132300)等项目的资助。结果已发表ACS Nano, 2022, 16, 4726-4733 (IF=15.881)   论文链接: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsnano.1c11582